Изучение генетического разнообразия штаммов Yersinia pestis из Центрально-Кавказского высокогорного природного очага чумы

Изучены методом MLVA по 25 VNTR-локусам штаммы Yersinia pestis , изолированные в Центрально-Кавказском высокогорном природном очаге чумы с 1971 по 2012 год. Анализ приуроченности кластеров дендрограммы к определенным территориям, объектам и срокам изоляции штаммов проводили с использованием программы Arc GIS 10.1. Установлена взаимосвязь MLVA25-типов Y. pestis с участками и временем выделения штаммов в Центрально-Кавказском высокогорном природном очаге чумы, потребностью в пролине. Кластеры, группы и подгруппы штаммов приурочены к определенным территориям: группы – к ландшафтно-эпизоотологическим районам, подгруппы – к поселениям горных сусликов. Периодически группы штаммов распространяются в другие ландшафтно-эпизоотологические районы очага. Генетические варианты штаммов возбудителя чумы в пределах поселений горных сусликов меняются с течением времени, что является косвенным свидетельством действия механизма микроэволюции.

Центрально-Кавказский природный очаг чумы, Yersinia pestis, генотипирование, генетические варианты, Central-Caucasian high-mountain natural plague focus, genotyping, genetic variations

1. Евченко Ю.М. Сезонность эпизоотий на разных участках Центрально-Кавказского высокогорного природного очага чумы. Вестник Российской военно-медицинской академии. 2008; 2(Ч. II):615–6.

2. Ермаков О.А., Титов С.В., Савинецкий А.Б., Сурин В.Л., Зборовский C.С., Ляпунова Е.А., Брандлер О.В., Формозов Н.А. Молекулярно-генетические и палеоэкологические аргументы в пользу конспецифичности малого (Spermophilus pygmaeus) и горного (S. musicus) сусликов. Зоол. журн. 2006; 85 (12):1474–10.

3. Кузнецова И.В., Ефременко Д.В. Генотипирование штаммов Yersinia pestis, изолированных из Восточно-Кавказского высокогорного природного очага чумы в 2010 г. Медицинский вестник Северного Кавказа. 2013; 8(1):98–99.

4. Куличенко А.Н., Евченко Ю.М., Мозлоев Г.А., Григорьев М.П., Ляпустина Л.В., Чурикова Н.В. Эпизоотическая активность Центрально-Кавказского высокогорного природного очага чумы. Пробл. особо опасных инф. 2011; 4(110):23–5.

5. Онищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. Природные очаги чумы Кавказа, Прикаспия, Средней Азии и Сибири. М.: ОАО Изд-во Медицина; 2004. 192 с.

6. Сидоренко Е.В. Методы математической обработки в психологии. СПб: Речь; 2007. 220 с.

7. Li Y., Cui Y., Hauck Y., Platonov M.E., Dai E., Song Y., Guo Z., Pourcel C., Dentovskaya S.V., Anisimov A.P., Yang R., Vergnaud G. Genotyping and phylogenetic analysis of Yersinia pestis by MLVA: insights into the worldwide expansion of Central Asia plague foci. PLoS One. 2009; 4(6):6000.

8. Platonov M.E., Evseeva V.V., Svetoch T.E., Efremenko D.V., Kuznetsova I.V., Dentovskaya S.V., Kulichenko A.N., Anisimov A.P. Phylogeography of Yersinia pestis Vole Strains Isolated from Natural Foci of the Caucasus and South Caucasus. Mol. Genet. Microbiol. Virol. 2012; 27(3):108–4.

9. Riehm J.M., Vergnaud G., Kiefer D., Damdindorj T., Dashdavaa O., Khurelsukh T., Zöller L., Wölfel R., Le Flèche P., Scholz H.C. Yersinia pestis lineages in Mongolia. PLoS One. 2012; 7(2):30624.