Разработка ДНК-биочипа для выявления субтипов вируса гриппа А
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2012-2(112)-89-93
Аннотация
Разработан ДНК-биочип для определения субтипов вируса гриппа А, патогенных для человека. Микрочип способен определять H1, H3, H5-субтипы гемагглютинина (включая H1-субтип гемагглютинина пандемического вируса гриппа A/H1N1(2009)) и N1, N2-субтипы нейраминидазы вируса гриппа. Полученный микрочип был успешно апробирован на штаммах высокопатогенного вируса гриппа птиц A/H5N1, пандемического вируса гриппа A/H1N1(2009), сезонных вирусах гриппа A/H1N1 и A/H3N2.
Об авторах
А. Н. Шиков
Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
Е. И. Сергеева
Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
О. К. Демина
Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
В. А. Терновой
Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
В. В. Рябинин
Новосибирский институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
Россия
Россия
Е. В. Костина
Новосибирский институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
Россия
Россия
Е. М. Малкова
Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
А. Н. Синяков
Новосибирский институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
Россия
Россия
А. П. Агафонов
Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
Список литературы
1. Burke A. Cunha Influenza: historical aspects of epidemics and pandemics. Infect. Dis. Clin. North Am. 2004; 18:141-55.
2. Fesenko E.E., Kireyev D.E., Gryadunov D.A., Mikhailovich V.M., Grebennikova T.V., L'vov D.K. et al. Oligonucleotide microchip for subtyping of influenza A virus. Influenza Other Respi Viruses. 2007; 1(3):121-9.
3. Garten R.J., Davis C. T., Russell C.A. et al. Antigenic and genetic characteristics of swine-origin 2009 A(H1N1) influenza viruses circulating in humans. Science. 2009; 325:197-8.
4. Gottfredsson M., Halldorsson B., Jonsson S. et al. Lessons from the past: Familial aggregation analysis of fatal pandemic influenza (Spanish flu) in Iceland in 1918. Proc. Natl Acad. Sci USA. 2008; 105:1303-8.
5. Guleria R., Kumar J., Mohan A., Wig N. Influenza A: from highly pathogenic H5N1 to pandemic 2009 H1N1. Epidemiology and clinical features. Indian J. Microbiol. 2009; 49:315-9.
6. Huang Y., Tang H., Duffy S., Hong Y., Norman S., Ghosh M. et al. Multiplex Assay for Simultaneously Typing and Subtyping Influenza Viruses by Use of an Electronic Microarray. J. Clin. Microbiol. 2009; 47(2):390-6.
7. Kessler N., Ferraris O., Palmer K., Marsh W., Steel A. Use of the DNA flow-thru chip, a three-dimensional biochip, for typing and subtyping of influenza viruses. J. Clin. Microbiol. 2004; 42(5):2173-85.
8. Leinberger D.M., Schumacher U., Autenrieth I.B., Bachmann T.T. Development of a DNA Microarray for Detection and Identification of Fungal Pathogens Involved in Invasive Mycoses. J. Clin. Microbiol. 2005; 43:4943-53.
9. Neverov A.A., Riddell M.A., Moss W.J., Volokhov D.V., Rota P.A. et al. Genotyping of Measles Virus in Clinical Specimens on the Basis of Oligonucleotide Microarray Hybridization. J. Clin. Microbiol. 2006; 44:3752-9.
10. Peiris J.S.M., Menno D.J., Guan Y. Avian Influenza Virus (H5N1): a Threat to Human Health. Clin. Microbiol. 2007; 20(2):243-67.
11. Schena M., Shalon D., Davis R.W., Brown P.O. Quantitative monitoring of gene expression patterns with a complementary DNA microarray. Science. 1995; 270:467-70.
12. Susi P., Hattara L., Waris M., Luoma-aho T., Siitari H., Hyypiä T., Saviranta P. Typing of Enteroviruses by Use of Microwell Oligonucleotide Arrays. J. Clin. Microbiol. 2009; 47:1863-70.
Рецензия
Для цитирования:
Шиков А.Н., Сергеева Е.И., Демина О.К., Терновой В.А., Рябинин В.В., Костина Е.В., Малкова Е.М., Синяков А.Н., Агафонов А.П. Разработка ДНК-биочипа для выявления субтипов вируса гриппа А. Проблемы особо опасных инфекций. 2012;(2(112)):89-93. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2012-2(112)-89-93
For citation:
Shikov A.N., Sergeeva E.I., Demina O.K., Ternovoy V.A., Ryabinin V.V., Kostina E.V., Malkova E.M., Sinyakov A.N., Agaphonov A.P. Development of DNA-Biochip for Identification of Influenza A Virus Subtypes. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2012;(2(112)):89-93. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2012-2(112)-89-93
Просмотров: 556
Послать статью по эл. почте 