Изучение биологических и молекулярно-генетических свойств штаммов Bacillus anthracis, изолированных на территории Сибири и Дальнего Востока (1959 – 2013 гг.)


https://doi.org/10.21055/0370-1069-2018-3-54-59

Полный текст:


Аннотация

Цель работы – изучение биологических и молекулярно-генетических свойств культур Bacillus anthracis, выделенных на курируемой территории Сибири и Дальнего Востока с 1959 по 2013 год. Материалы и методы. В исследование отобрано 39 музейных штаммов B. Anthracis, изолированных из материалов различного происхождения в 11 субъектах Сибири и Дальнего Востока во время эпизоотических и эпидемических осложнений по сибирской язве и мониторинга почвенных очагов. Штаммы изучены по 16 культурально-морфологическим и 23 биохимическим тестам, вирулентности, плазмидному составу, 15 вариабельным VNTR- и 13 SNP-локусам. Результаты и обсуждение. Показана фенотипическая неоднородность и значительная генотипическая гетерогенность популяции штаммов сибиреязвенного микроба на курируемой территории. Типичными культурально-морфологическими  и  биохимическими  свойствами обладают 87,2 % изолятов. По результатам молекулярно-генетического типирования выявлено 20 VNTR-профилей и три канонических SNP кластера, которые отнесены к двум глобальным генетическим линиям А и В. Полученные результаты могут служить в качестве генетического маркера при расследовании случаев сибирской язвы, возможных актов биотерроризма и оценке эпизоотической активности СНП на определенной административной территории. На основе систематизации и анализа сведений  о  происхождении,  биологических  и  молекулярно-генетических  свойств штаммов создана база данных «биологические  свойства  штаммов Bacillus  anthracis,  изолированных  на  территории Сибири и Дальнего Востока», а также получено свидетельство о государственной регистрации. Структура базы данных пополняема и может быть расширена по результатам применения новых технологий и методов.


Об авторах

Е. В. Кравец
ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока», Иркутск
Россия
664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78


З. Ф. Дугаржапова
ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока», Иркутск
Россия
664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78


В. Е. Такайшвили
ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока», Иркутск
Россия
664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78


Т. А. Иванова
ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока», Иркутск
Россия
664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78


М. В. Чеснокова
ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока», Иркутск
Россия
664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78


С. В. Балахонов
ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока», Иркутск
Россия
664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78


Список литературы

1. Афанасьев М.В., Кравец Е.В., Дугаржапова З.Ф., Такайшвили В.Е., Половинкина В.С., Балахонов С.В. Сравнительный мультилокусный vntr и snp анализ штаммов bacillus anthracis. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2014; 2: 36–40.

2. Дугаржапова З.Ф., Родзиковский А.В., Чеснокова М.В., Балахонов С.В., Болошинов А.Б., Ханхареев С.С., Болошинова Н.П., Намноева Л.К., Шобоева Р.С., Юзвик Л.Н., Лауль З.Л., Мосорова А. В. Эпизоотолого-эпидемиологический анализ ситуации по сибирской язве в Республике Бурятия(1995–2008 гг.). Эпидемиология и инфекционные болезни. 2010; 6:11–5.

3. Дугаржапова З.Ф., Чеснокова М.В., Гольдапель Э.Г., Косилко С.А., Балахонов С.В. Сибирская язва в азиатской части российской федерации. Сообщение 2. Современная эпизоотолого-эпидемиологическая ситуация в сибири и на Дальнем Востоке (1985–2015 гг.). Проблемы особо опасных инфекций. 2017; 1:59–64. Doi:10.21055/0370-1069-2017-1-59-64.

4. Кузнецовский А.В., Мигова Г.В., Федоров Ю.Н., Кибирев Я.А., Воробьев А.А., Дармов И.В., Борисевич И.В., Савиных А.В., Горин О.В. Генетическое типирование вакцинных штам-мов bacillus anthracisметодом мультилокусного vntr-анализа. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2009; 4:13–8.

5. Куличенко А.Н., Редактор. Сибирская язва на Северном Кавказе. Майкоп: качество; 2016. 198 С.

6. Маринин Л.И., Дятлов И.А., Редакторы. Методы изучения биологических свойств возбудителя сибирской язвы. Учебно-методическое пособие. М.: Зао мп«гигиена»; 2009. 304 С.

7. Попова А.Ю., Куличенко А.Н., Редакторы. Опыт ликвидации вспышки сибирской язвы на ямале в 2016 году. Ижевск: ООО «Принт-2»; 2017. 313 С. Doi: 10.23648/prnt.2184.

8. ЧеркасскиЙ Б.Л. Эпидемиология и профилактика сибирской язвы. М.: Интерсэн; 2002. 384 С.

9. Aikembayev A.M., Lukhnova L., Temiraliyeva G., MekaMechenko T., Pazylov Y., Zakaryan S., Denissov G., Easterday W.R., Van Ert M.N., Keim P., Francesconi S.C., Blackburn J.K., Hugh-Jones M., Hadfield T. historical distribution and molecular diversity of Bacillus anthracis, Kazakhstan. Emerg. Infect. Dis.2010; 16(5):789–96. DOI: 10.3201/eid1605.091427.

10. Hoffmaster A.R., Fitzgerald C.C., Ribot E., Mayer L. W., Popovic T. Molecular subtyping of Bacillus anthracisand the 2001 bioterrorism-associated anthrax outbreak, United States. Emerg. Infect. Dis. 2002; 8(10):1111–7. DOI: 10.3201/eid0810.020394.

11. Keim P., Price L.B., Klevytska A.M., Smith K.L., Schupp J.M., Okinawa R., Jackson P.J., Hugh-Jones M.E. Multiple-locus variable-number tandem repeat analysis reveals genetic relationships within Bacillus anthracis. J. Bacter. 2000; 182(10):2928–36. DOI: 10.1128/JB.182.10.2928-2936.2000.

12. Okutani A., Tungalag H., Boldbaatar B., Yamada A., Tserennorov D., Otgonchimeg I., Erdenebat A., Otgonbaatar D., Inoue S. Molecular epidemiological study of Bacillus anthracisisolated in Mongolia by multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis for 8 loci (MLVA-8). Jpn. J. Infect. Dis. 2011; 64(4):345–8.

13. Simonson T.S., Okinaka R.T., Wang B., Easterday W.R., Huynh L., U’Ren J.M., Dukerich M., Zanecki S.R., Kenefic L.J., Beaudry J., Schupp J.M., Pearson T., Wagner D.M., Hoffmaster A., Ravel J., Keim P. Bacillus anthracisin China and its relationship to worldwide lineages. BMC Microbiol.2009; 9:71 DOI: 10.1186/1471-2180-9-71.

14. Van Ert M.N., Easterday W.R., Huynh L.Y., Okinaka R.T., Hugh-Jones M.E., Ravel J., Zanecki S.R., Pearson T., Simonson T.S., U’Ren J.M., Kachur S.M., Leadem-Dougherty R.R., Rhoton S.D., Zinser G., Farlow J., Coker P. R., Smith K.L., Wang B., Kenefic L.J., Fraser-Liggett C.M., Wagner D.M., Keim P. Global genetic population structure of Bacillus anthracis. PLoS ONE. 2007; 2(5):e461. DOI: 10.1371/journal.pone.0000461.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Кравец Е.В., Дугаржапова З.Ф., Такайшвили В.Е., Иванова Т.А., Чеснокова М.В., Балахонов С.В. Изучение биологических и молекулярно-генетических свойств штаммов Bacillus anthracis, изолированных на территории Сибири и Дальнего Востока (1959 – 2013 гг.). Проблемы особо опасных инфекций. 2018;(3):54-59. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2018-3-54-59

For citation: Kravets E.V., Dugarzhapova Z.F., Takaishvili V.E., Ivanova T.A., Chesnokova M.V., Balakhonov S.V. Biological and Molecular-Genetic Properties of Bacillus anthracis strains Isolated in Siberia and Far East Regions (1959–2013). Problems of Particularly Dangerous Infections. 2018;(3):54-59. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2018-3-54-59

Просмотров: 69

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)