В статье рассматривается эволюция концепции СПЭБ с момента их создания в 1963 г. до наших дней. Показано, что образование СПЭБ как производных противочумных учреждений было закономерным шагом, основанным на российском и советском историческом опыте работы здравоохранения как в периоды прошедших войн, так и по ликвидации чрезвычайных ситуаций в мирное время. На ряде конкретных примеров участия этих формирований в ликвидации ЧС санитарно-эпидемиологического характера раскрыта эволюция концепции СПЭБ, основных принципов их функционирования. Показано, что движущей силой эволюции концепции СПЭБ, определявшей изменения в структурно-функциональной организации СПЭБ, их материально-техническом оснащении на всех этапах были вновь возникающие биологические угрозы. Эволюция концепции СПЭБ основывалась на научном анализе практического опыта их применения, а также на использовании достижений научно-технического прогресса на каждом временном этапе. Охарактеризована модернизация материально-технической и технологической базы СПЭБ в 2007-2010 гг. Раскрыты основные направления деятельности СПЭБ, их функции, тактика применения этих формирований на современном этапе. Показаны изменения в концепции СПЭБ, тактике их применения, обусловленные новым направлением в работе СПЭБ - обеспечением санитарно-эпидемиологического благополучия при проведении массовых мероприятий с международным участием.

Проанализированы данные эпизоотологического обследования энзоотичных по чуме территорий Российской Федерации за 2013 г. Дана оценка состояния численности основных носителей и переносчиков, а также эпизоотической активности природных очагов чумы различного типа. Выполнен анализ условий снижения эпизоотического потенциала горных и высокогорных природных очагов чумы Кавказа, Алтая и Тывы. Зарегистрированы единичные находки зараженных чумой блох на участках стойкого проявления чумы на территории Прикаспийской низменности. Представлен эпизоотологический прогноз на 2014 г. Отмечено повышение вероятности выхода из состояния межэпизоотического периода Волго-Уральского песчаного и Центрально-Кавказского высокогорного природных очагов чумы. Обоснованы возможность продолжения эпизоотий чумы и их интенсивность на территории Прикаспийского песчаного, Алтайского горного, Тувинского горного, Восточно-Кавказского высокогорного природных очагов чумы.

культур V. cholerae О1 El Tor сероваров Ogava и Inaba в субъектах, различных по типам эпидемических проявлений холеры.

Проведен анализ эпидемиологической и эпизоотологической ситуации по сибирской язве в Российской Федерации и в мире в 2013 г., представлен прогноз заболеваемости на 2014 г. Отмечено снижение заболеваемости людей сибирской язвой в России (2 случая в 2013 г. по сравнению с 12 - в 2012 г.). Выявлено 3 случая сибирской язвы у крупного рогатого скота.

Представлен анализ и проведена оценка эпизоотической и эпидемической ситуации по бруцеллезу в Российской Федерации в 2013 г. Показано, что на фоне напряженной эпизоотической обстановки в Российской Федерации наметилась тенденция к сокращению количества заболевших бруцеллезом людей. Сохраняется высокий уровень заболеваемости среди людей в Северо-Кавказском и Южном федеральных округах, обусловленной циркуляций возбудителя бруцеллеза вида B. melitensis . Результатом реализации комплексной программы по профилактике бруцеллеза в Республике Дагестан явилось существенное снижение заболеваемости впервые выявленным бруцеллезом в республике. В 2014 г. прогнозируется стабилизация количества заболеваний бруцеллезом среди людей и сельскохозяйственных животных на уровне 320-370 случаев.

Эпидемическая ситуация по лихорадке Западного Нила в странах Европы в 2013 г. характеризовалась заметным подъемом заболеваемости, обусловленным, прежде всего, вспышкой ЛЗН в Сербии (302 случая). На североамериканском континенте - в США и Канаде, проявления ЛЗН в 2013 г. характеризовались более низкой интенсивностью, чем в предыдущем эпидемическом сезоне. В 2013 г. в России всего зарегистрировано 192 случая заболевания населения в 16 субъектах РФ, что значительно ниже предыдущего года (2012 г. - 455 случаев). Установлено, что в эпидемический сезон 2013 г. на территории Волгоградской и Саратовской областей циркулировал 2-й генотип ВЗН, как и в Сербии, Греции, Италии, а в Астраханской области - генотип 1. За период наблюдения за эпидемической ситуацией на территории Российской Федерации в 1999-2013 гг., маркеры вируса ЗН выявлены в 61 субъекте РФ, что подтверждает потенциальную опасность инфицирования населения ЛЗН в эпидемический сезон на большей части территории страны. По данным Росгидромета, климатические условия на территории России в ближайшие 5-10 лет будут сохранять тенденцию к потеплению, что будет способствовать дальнейшему распространению ЛЗН на более северные территории.

Крымская геморрагическая лихорадка остается одной из наиболее актуальных инфекций для юга России. В течение последних пяти лет в ряде регионов сохраняется стабильно высокий уровень заболеваемости, уровень летальности в среднем составляет 4,4 %. В 2013 г. в субъектах ЮФО и СКФО зарегистрировано 79 случаев заболевания КГЛ. В работе представлен анализ эпидемиологической ситуации по Крымской геморрагической лихорадке (КГЛ) в России в 2013 г., обобщены результаты эпизоотологического обследования территории природного очага КГЛ на юге европейской части России, приведены результаты генетического типирования вируса ККГЛ, выявленного в 2011-2013 гг. на юге России. На основании данных эпизоотологического мониторинга составлен прогноз развития эпидемиологической ситуации по КГЛ на 2014 г.

Целью нашей работы является демонстрация некоторых особенностей разрабатываемой в ГНЦ ВБ «Вектор» модели эпидемий. Предполагается, что данная модель универсальна и способна описывать развитие любой эпидемии острого инфекционного заболевания, где основными путями передачи инфекции является инфицирование из некоторого внешнего источника или при случайных контактах между людьми независимо от пола, возраста и других социально-демографических особенностей групп населения. В модели задается спектр основных мер противодействия: профилактическая вакцинация и вакцинация, проводимая уже в ходе эпидемии, поиск и изоляция (наблюдение) больных, контактных и лиц, подозрительных на заболевание, карантин. Модель доступна по адресу http://vector-epimod.ru. Исследуется влияние различных ресурсных ограничений на развитие эпидемии натуральной оспы в населенном пункте - городе-миллионнике.

Прогнозирование заболеваемости клещевым вирусным энцефалитом выполнено тремя методами. Показано, что в логарифмической модели согласованность вариабельности реальных значений обращаемости по поводу присасывания клещей и прогнозных в текущем квазицикле составляет 31,4 %. Построены многофакторные регрессионные модели обращаемости по поводу присасывания клещей и заболеваемости клещевым вирусным энцефалитом. Выявлены наиболее значимые факторы, описывающие специфическую профилактику, акарицидные обработки, вирусофорность клещей, и оценен их вклад в прогноз. Максимальный вклад комплекса показателей при прогнозировании обращаемости по поводу присасывания клещей составил величину до 78 %, показателей: серопрофилактика - до 64 %, вакцинация - 11,5 %, акарицидные обработки - 4 %, вирусофорность клещей - 3 %. Показано, что увеличение площадей акарицидных обработок на 20 % может привести к снижению обращаемости на 5 %, в то время как снижение обработок на 20 % - к увеличению обращаемости почти на 7 %. Полученные оценки значимости лечебно-профилактических мероприятий необходимо учитывать при разработке территориальных профилактических программ на фоне обязательного применения акарицидных обработок.

На основании информации, поступившей в Референс-центр по мониторингу природно-очаговых инфекций Иркутского научно-исследовательского противочумного института из учреждений Роспотребнадзора двенадцати субъектов Сибирского, девяти - Дальневосточного и трех - Уральского федеральных округов, представлен анализ заболеваемости природно-очаговыми и зоонозными болезнями в Сибири и на Дальнем Востоке за 9 месяцев 2013 г., отражен объем лабораторных исследований в регионе на сибирскую язву, бруцеллез, туляремию, иерсиниозы, лептоспирозы, боррелиозы, риккетсиозы и ряд вирусных инфекций. Паводок в Приамурье не оказал значимого влияния на эпидемиологическую ситуацию в 2013 г., однако в 2014 г. возможны эпизоотические и эпидемические осложнения, для предотвращения которых проводится усиленный комплекс профилактических мер. Сохраняется напряженной обстановка по туляремии в Ханты-Мансийском АО, по бруцеллезу в Республике Тыва и Забайкальском крае.

На основании анализа материалов о распространении и численности иксодовых клещей на территории Тульской области в 1998-2012 гг. получены новые данные о расширении ареала I. ricinus . В качестве ландшафтной основы для изучения закономерностей пространственного размещения этого вида использованы результаты ботанико-географического районирования в регионе. Выявлены территории с низкими, средними и высокими показателями численности этого вида. В последнее десятилетие клещи I. ricinus стали встречаться не только в лесной, но и в лесостепной зоне. Наиболее благоприятные для него биотопы располагаются в смешанных лесах Приокского и широколиственных лесах Засечного районов. В лесостепи оптимальные биотопы сосредоточены в нагорных и остепненных дубравах на юге Юго-Восточного района. Причины этого явления связаны c ростом численности клещей этого вида в оптимальных для обитания ландшафтах, уменьшением площадей сельскохозяйственных угодий и зарастанием их кустарником и лесом. Средняя численность I. ricinus в лесной зоне составила 39,4, в лесостепной - 23,7 экз./фл.-км. Определены потенциальные участки риска по клещевым природно-очаговым инфекциям, циркуляция и передача возбудителей которых обеспечивается I. ricinus , что, в свою очередь, является основанием для проведения целевого эпизоотологического обследования и регламентации профилактических мероприятий.

Для оптимизации применения ГИС-технологий в анализе лептоспироза были использованы данные эпидемиологического и эпизоотологического исследования лептоспироза в Европе, Украине и Крыму. В статье описан методологический подход, состоящий из 4 этапов, который применен для совершенствования эпиднадзора за лептоспирозом. Первый этап основан на изучении опыта ранее проведенного картографирования лептоспироза и выявлении особенностей территории. Второй этап - использование ГИС в эпидемиологическом анализе для разработки критериев районирования энзоотичных территорий, оценки динамических качественных и количественных изменений эпидемического процесса, определения влияния социально-экологических особенностей территории на эпидемический и эпизоотический процессы. Третий этап - создание баз данных (атрибутивные таблицы) с географической привязкой изучаемых явлений (природные очаги лептоспироза, точки выявления животных-хозяев, места возможного инфицирования человека, показатели заболеваемости и др.). Четвертый этап - проведение комплексного анализа полученных карт. Использование подхода позволяет не только определить значимость очагов и изучить комплексное влияние социально-экологических факторов на риск заражения людей, но и провести районирование территории, с учетом эпидемически значимых факторов, что является научно обоснованной основой для разработки адекватных профилактических и противоэпидемических мероприятий.

Исследования осуществляли осенью 2013 г. в закрытых биотопах (подвалы, подъезды многоэтажных домов) в районах эпидемических проявлений ЛЗН на территории Саратова. Проведен учет численности имаго и личинок комаров Culex pipiens . Установлена высокая численность переносчиков: в подвалах - от 10 до 800 экз. на 1 кв.м, в подъездах - от 1 до 30 экз. Численность личинок в затопленных подвалах составила от 600 до 3800 экз. на 1 кв.м. В пробах личинок и вновь выплодившихся имаго комаров выявлены маркеры вируса Западного Нила, что свидетельствует о возможности трансовариальной и трансфазовой передачи вируса в популяции комаров урбанизированных биоценозов. Обосновано, что автогенно размножающиеся самки подвальных комаров Culex pipiens обеспечивают сохранение вируса в межэпидемический период. Последнее подтверждает возможность формирования стойких, эпидемически активных микроочагов ЛЗН в селитебных ландшафтах, что необходимо учитывать при оценке рисков заражения городского населения.

Проведено сравнительное изучение способности 6 типичных штаммов и 10 геновариантов V. cholerae биовара Эль Тор, завезенных на территорию России, ферментировать различные углеводы. Выявлено, что геноварианты, как и типичные Эль Тор вибрионы, ферментируют маннозу, сахарозу, манит, но не активны в отношении к арабинозе и рамнозе. Однако показано, что у геновариантов по сравнению с типичными штаммами Эль Тор вибрионов снижена способность к ферментации глюкозы. Геноварианты, как и классические вибрионы, не растут на минимальной среде с 1 % содержанием глюкозы и не способны полностью ферментировать глюкозу до ацетилметилкарбинола в реакции Фогес-Проскауэра. Выдвигается гипотеза, что изменение метаболизма глюкозы в изученных штаммах геновариантов может быть связано с изменением механизма регуляции некоторых генов вирулентности.

Стремительно развивающиеся технологии секвенирования создали возможность определения нуклеотидной последовательности ДНК полного индивидуального генома человека всего за несколько недель. Производительность некоторых секвенаторов измеряется уже многими сотнями миллиардов пар оснований за рабочий цикл. В обзоре рассмотрены принципы и аналитические возможности современных методов секвенирования ДНК, которые условно разделены на три основных вида: классические - секвенирование с помощью капиллярного электрофореза и пиросеквенирование; новые («второго» поколения - Next Generation Sequencing - NGS) - проводят одновременно секвенирование миллионов фрагментов ДНК, каждый из которых представлен кластером из многих тысяч или сотен тысяч своих клонов - это высокопроизводительное пиросеквенирование, циклическое лигазное и полупроводниковое секвенирование; секвенирование на молекулярных кластерах с использованием флуоресцентно меченных предшественников; новейшие («третьего» поколения - Next-Next Generation Sequencing - NNGS) методы секвенирования, которые считывают информацию с миллионов единичных фрагментов ДНК без их предварительного клонирования.

В обзоре рассмотрены некоторые особенности циркуляции вируса венесуэльского энцефаломиелита лошадей (ВЭЛ). Энзоотические штаммы вируса ВЭЛ в настоящее время играют все возрастающую роль как этиологические агенты заболеваний у людей. Большинство случаев ВЭЛ у людей в эндемичных регионах в межэпидемический период вызваны инфицированием вирусом ВЭЛ подтипа ID, который включает в себя 6 генотипов. От людей выделены генотипы Колумбия/Венесуэла, Панама/Перу и Перу/Боливия подтипа ID вируса ВЭЛ. Возможность возникновения новых эпидемических вспышек ВЭЛ обусловлена мутациями штамма ID подтипа в IС подтип, который и представляет в настоящее время потенциальную угрозу как этиологический агент заболевания.

Разработана мультилокусная ПЦР-тест-система, позволяющая дифференцировать токсигенные генетически измененные штаммы Vibrio cholerae биовара Эль Тор на штаммы с высоким и низким эпидемическим потенциалом на основе определения структуры одного из генетических маркеров возбудителя 7-й пандемии холеры - острова пандемичности VSP-II. В рамках данной работы были подобраны три гена-мишени , расположенные в центральной и краевой областях этого мобильного генетического элемента. Разработанная ПЦР-тест-система позволяет выявлять штаммы, содержащие интактный VSP-II, VSP-II с короткой делецией, а также VSP-II с протяженной делецией. Штаммы с интактным VSP-II или имеющие короткую делецию в острове пандемичности относятся к вариантам с низким эпидемическим потенциалом, в то время как штаммы, содержащие VSP-II с протяженной делецией относятся к вариантам с высоким эпидемическим потенциалом. Экспериментально доказана специфичность и эффективность тест-системы при анализе 28 токсигенных генетически измененных штаммов V. cholerae биовара Эль Тор и 6 штаммов близкородственных видов и энтеробактерий. Полученные результаты совпадают с данными монолокусного ПЦР анализа и в ряде случаев подтверждены секвенированием.

Значительная роль в обеспечении санитарно-эпидемиологического благополучия в период подготовки и проведения массовых мероприятий отводится лабораторному обеспечению эпидемиологического надзора. С учетом возрастания нагрузки на лабораторную базу учреждений Роспотребнадзора и лечебно-профилактических организаций на территории проведения массового мероприятия для осуществления лабораторных исследований могут быть задействованы СПЭБ Роспотребнадзора. На моделях организации и проведения лабораторных исследований в МК СПЭБ в период подготовки и проведения XXVII Всемирной летней универсиады в 2013 г. в Казани и саммита «Группы двадцати» в Санкт-Петербурге в 2013 г. сформулированы основные принципы организации и алгоритмы диагностической работы в лабораториях мобильных формирований, задействованных для обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия в период проведения массовых мероприятий.

Целью работы являлась разработка способа ускоренного линейного иммуноэлектрофореза для дифференцирования патогенных возбудителей сапа и мелиоидоза от непатогенных близкородственных буркхольдерий. Предлагаемая модификация метода позволила обнаружить антигены патогенных B. pseudomallei и B. mallei по наличию линий преципитата на границе гель-образца и геля с иммунными сыворотками. B. thailandensis , B. cepacia и B. gladioli таких линий преципитата не образовали, что дало возможность дифференцировать их от патогенных буркхольдерий. Способ ускоренного ЛИЭФ отличается простотой, быстротой исполнения, наглядностью. Метод пригоден для определения общих и специфических антигенов буркхольдерий, отбора иммунных сывороток, содержащих антитела к соответствующим антигенам, и может применяться как дополнительный аналитический метод выявления антигенов патогенных буркхольдерий.

Целью работы было сравнение микроорганизмов, принадлежащих к шести различным видам рода Bacillus , по распределению подвижности ампликонов, полученных с использованием праймера, содержащего chi-последовательность Bacillus subtilis . В работе были проанализированы 30 штаммов Bacillus anthracis и близкородственных бацилл. Культуры выращивали на L-агаре и в L-бульоне при температуре 37 °С. ДНК выделяли из вегетативных культур B. anthracis и Bacillus spp. с использованием лизоцима и фенольной депротеинизации. Для однопраймерной ПЦР был сконструирован праймер ChiBs - 5`-CTAGGAGCGGG-3`. Однопраймерную амплификацию (30 циклов) проводили при температуре отжига 47 °С. Сравнительный анализ индивидуальных электрофоретических профилей ампликонов, полученных в реакции ПЦР с помощью праймера, содержащего chi-последовательность B. subtilis, позволяет выявлять генетическую внутривидовую вариабельность и проводить дифференциацию штаммов B. anthracis от атипичных штаммов и близкородственных видов бацилл.

/кл. c использованием поддерживающей среды 199 с добавлением 0,1 % человеческого сывороточного альбумина либо 2 % сыворотки крупного рогатого скота. Оптимальный объем среды в роллерной бутыли при культивировании вируса бешенства штамма «Москва 3253» составляет от 200 до 400 мл и зависит от площади ростовой поверхности. Подобные условия обеспечивают получение культуральной жидкости с титром вируса бешенства в иммуноферментном анализе от 1:256 до 1:512. Культуральный вирус рекомендован в качестве основы для приготовления иммунизирующего материала с целью получения антирабического иммуноглобулина из сыворотки крови лошади.

Проведена комплексная сравнительная оценка производственных и диагностических свойств сибиреязвенных бактериофагов Гамма А-26, Fah-ВНИИВВиМ, R/D-Ph-6, ВА-9, К ВИЭВ, Саратов, 186. Показано, что все бактериофаги обладают свойствами, необходимыми для производства их в виде препаратов: эффективно размножаются на жидких культурах авирулентного штамма Bacillus anthracis СТИ, в достаточной степени сохраняют специфическую активность при хранении при оптимальных температурах в течение двух лет и при кратковременных отклонениях температур от оптимальных значений. В большей степени выражены различия в диагностических свойствах изученных бактериофагов - специфической активности и специфичности. Выявлены группы бактериофагов, оптимальные для идентификации или для фаготипирования штаммов B. anthracis .

Представлены результаты микробиологического мониторинга судовых балластных вод в морских портах Ростовской области. Материалом для исследования на наличие Vibrio cholerae служили пробы балластной воды судов, отобранные в мае-сентябре 2010-2012 гг. Исследовано 179 проб, отобранных на 127 судах. Из 30 выделенных в 2010-2011 гг. штаммов V. cholerae non О1/ non О139, серологическая принадлежность установлена у 13 штаммов. Применение в 2012 г. MALDI-TOF масс-спектрометрии повысило информативность исследований, расширило спектр и частоту бактериологических находок. Обнаружение вибрионов свидетельствует о реальной возможности заноса возбудителя холеры в акваторию Азовского моря.

За период с 2009 по 2012 год в Республике Мордовия зарегистрирован 321 случай заболеваний геморрагической лихорадкой с почечным синдромом. В динамике эпидемического процесса ГЛПС наблюдается стойкая тенденция к росту заболеваемости, что связано с повышением качества и эффективности клинической и лабораторной диагностики, а также с активизацией природных очагов этого заболевания на территории Республики Мордовия. Анализ половозрастной структуры заболеваемости ГЛПС показал, что болеет преимущественно активное, трудоспособное население в возрасте от 20 до 50 лет. Заболеваемость мужского населения в 3 раза выше женской. В РМ к эпидемиологическим особенностям для ГЛПС относят цикличность эпидемиологических подъемов, осенне-зимнюю сезонность, преимущественное заболевание городских жителей, преобладание бытового типа заражения.

В работе описан первый опыт использования геномного анализа в условиях мобильного комплекса СПЭБ во время проведения XXVII Всемирной летней Универсиады-2013 в Казани. В результате было проведено 16S рРНК секвенирование штамма Salmonella enterica , выделенного от больного. Для этого использовали набор «MicroSEQ 500 16S rDNA Bacterial Identification Kits» (Applied Biosystems, США), позволяющий секвенировать фрагменты ДНК (500 пар нуклеотидов) гена 16S рРНК исследуемых бактерий.