Прогноз по холере на 2019 г. на основании анализа эпидемиологической обстановки в мире, СНГ и России в 2009–2018 гг.

Проведен анализ заболеваемости холерой в период 2009–2018 гг. Выявлена тенденция роста в динамике заболеваемости в мире (относительно 2009 г.) со средним ежегодным темпом прироста – 5,352 %. В 2017 г., впервые за период 7-й пандемии, вызванной V. cholerae O1 El Tor, по данным ВОЗ , количество больных превысило 1 млн человек (1227391), из них 84,1 % (1032481) пришлось на Йемен, где продолжается война и одна из крупнейших в мире эпидемий. Имели место трансграничные эпидемиологические осложнения в ряде стран Африки. Сохраняются эндемичные очаги в странах Азии, Африки и Карибского бассейна. При эпидемиологическом надзоре в России из поверхностных водоемов изолировано 744 штамма V. cholerae О1 биовара Эль Тор ctxA– tcpA–, ctxA– tcpA+ и V. cholerae О139 ctxA– и tcpA– , а также единичные V. cholerae О1 биовара Эль Тор ctxA+ tcpA+. По данным INDEL- и ПЦР -генотипирования установлено выделение штаммов с идентичными и новыми генотипами. Для прогноза на 2019 г. проведена оценка риска активизации (продолжения) эпидемического процесса при холере в мире с учетом ЧС различного происхождения и факторов риска. Прогноз по холере на глобальном уровне и в России на 2019 г. – неблагоприятный.

1. Cholera prevention and control. Seventy-first world health assembly, Agenda item 11.2. 26 May 2018 [Электронный ресурс]. URL: http://apps.who.int/gb/ebwha/pdf_files/WHA71/A71_R4-en.pdf (дата обращения 23.10.2018 г.).

2. Cholera, 2009. Wkly Epidem. Rec. 2010; 85(31):293–308.

3. Cholera, 2010. Wkly Epidem. Rec. 2011; 86(31):325–40.

4. Cholera, 2011. Wkly Epidem. Rec. 2012; 87(31):289–304.

5. Cholera, 2012. Wkly Epidem. Rec. 2013; 88(31):321–6.

6. Cholera, 2013. Wkly Epidem. Rec. 2014; 89(31):345–56

7. Cholera, 2014. Wkly Epidem. Rec. 2015; 90(40):517–29.

8. Cholera, 2015. Wkly Epidem. Rec. 2016; 91(38):433–440.

9. Cholera, 2016. Wkly Epidem. Rec. 2017; 92(36):521–536.

10. Cholera, 2017. Wkly Epidem. Rec. 2018; 93(38):489–497.

11. Cholera, diarrhea & dysentery update: Africa, Asia [Электронный ресурс]. Archive Number: 20180107.5543138–20190109.6250233. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 20.01.2019 г.).

12. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Олейников И.П., Мишанькин Б.Н. INDEL-типирование штаммов V. cholerae. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2017; 22(4):195–200. DOI: 10.18821/1560-9529-2017-22-4-195-200.

13. Кругликов В.Д., Левченко Д.А., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б. ПЦР -генотипирование нетоксигенных штаммов холерных вибрионов как один из подходов их актуализации в плане эпидназора за холерой. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2018; 2:28–35. DOI: 10.18565/epidem.2018.2.28-35.

14. Simpson E.H. Measurement of diversity. Nature (London). 1949; 163(148):668. DOI: 10.1038/163688a0.

15. Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Molecular Biology and Evolution. 2011; 28:2731–39. DOI: 10.1093/molbev/msr121.

16. Савилов Е. Д., Мамонтова Л. М., Астафьев В. А., Жданова С. Н. Применение статистических методов в эпидемиологическом анализе. М.: МЕД пресс-информ; 2004. 112 с.

17. Cholera, diarrhea & dysentery update: Africa, Asia [Электронный ресурс]. Archive Number: 20190109.6250233. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 10.01.2019 г.)

18. Cholera – Yemen: (Al Hudaydah) susp, fatal [Электронный ресурс]. Number: 20190117.6261122. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 20.01.2019 г.)

19. Rapport du Réseau National de Surveillance cholera. 02 semaine epidemiologique 2019. [Электронный ресурс]. URL: http://mspp.gouv.ht/site/downloads/Profil%20statistique%20Cholera%20%202SE%202019.pdf (дата обращения 24.01.2019 г.)

20. Cholera, diarrhea & dysentery update (02): Asia (Yemen) [Электронный ресурс]. Archive Number: 20190118.6265918. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 23.01.2019 г.).

21. Rabaan A. Cholera: an overview with reference to the Yemen epidemic. Frontiers of Medicine. 2018 Jun 22. DOI: 10.1007/s11684-018-0631-2.

22. Weill F-X., Domman D., Njamkepo E., Almesbahi A.A., Naji M., Nasher S.S., Rakesh A., Abdullah M. Assiri, Sharma N.C., Kariuki S., Pourshafie M.R., Rauzier1 J., Abubakar A., Carter J.Y., Wamala J.F., Seguin C., Bouchier C., Malliavin T., Bakhshi B, Abulmaali H.Н.N., Kumar D., Njoroge S.M., Malik M.R., Kiiru J., Luquero F.J., Azman A.S., Ramamurthy T., Thomson N.R., Quilici1 M-L. Genomic insights into the 2016–2017 cholera epidemic in Yemen. Nature. 2019; 565:230-3. DOI: 10.1038/s41586-018-0818-3.

23. Москвитина Э.А., Тюленева Е.Г., Кругликов В.Д., Титова С.В., Водопьянов А.С, Куриленко М.Л., Иванова С.М., Анисимова Г.Б., Водопьянов С.О., Олейников И.П. Холера: оценка эпидемиологической обстановки в мире и России в 2008–2017 гг. Прогноз на 2018 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2018;1:36–43. DOI: 10.21055/0370-1069-2018-1-36-43.

24. Cholera – India (14): (Punjab) fatal, school closure [Электронный ресурс]. Archive Number: 20181028.6114482. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 30.10.2018 г.)

25. С ommunicable disease threats report. Week 34, 19–25 Aug 2018. [Электронный ресурс]. URL: https://ecdc.europa.eu/sites/portal/files/documents/Communicable-disease-threats-report-25-aug-2018.pdf (дата обращения 20.08.2018 г.).

26. Young woman infected with cholera after Malaysia trip. The Standart. [Электронный ресурс]. URL: http://www.thestandard. com.hk/breaking-news.php?id=110278&sid=4 (дата обращения 11.07.2018 г.).

27. South Korea reports 1st imported cholera case of 2018. Outbreak news today. [Электронный ресурс]. URL: http://outbreaknewstoday.com/south-korea-reports-1st-imported-choleracase-2018 (дата обращения 07.07.2018 г.).

28. Cholera, diarrhea & dysentery update (35): Africa (Saudi Arabia, Algeria). [Электронный ресурс]. 20 Sep 2018. Archive number: 20180920.6039245. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 20.03.2018 г.)

29. Faruque S.M., Albert J. Genetic relation between Vibrio cholera O1 strains in Ecuador and Bangladech. Lancet. 1992; 339(8795):740–1. PMID: 1347603.

30. Hendriksen R.S., Price L.B., Schupp J.M., Gillece J.D., Kaas R.S., Engelthaler D.M., Bortolaia V., Pearson T., Waters A.E., Upadhyay B.P., Shrestha S.D., Adhikari S., Shakya G., Keim P.S., Aarestrup F.M. Population genetics of Vibrio cholerae from Nepal in 2010: evidence on the origin of the Haitian outbreak. MBio. 2011; 2(4):e00157–11. DOI: 10.1128/mBio.00157-11.

31. Cholera, diarrhea & dysentery update (56): Africa, Asia. [Электронный ресурс]. Archive number: 20131014.1999439. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 17.10.2018 г.)

32. Онищенко Г.Г., Беляев Е.Н., Москвитина Э.А., Резайкин В.И., Ломов Ю.М., Мединский Г.М. Холера в Дагестане: прошлое и настоящее. Ростов н/Д: Изд-во «Полиграф»; 1995. 120 с.

33. Онищенко Г.Г., Марамович А.С., Голубинский Е.П., Маслов Д.В., Вершкова Т.И., Урбанович Л.Я., Алленов А.В., Мурначев Г.П., Гарковенко Л.В., Воронок В.М. Холера на Дальнем Востоке России. Сообщ. 1. Эпидемиологическая характеристика вспышки холеры Эль Тор в г. В ладивостоке. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2000; 5:26–31. PMID: 11220959.

34. Онищенко Г.Г., Москвитина Э.А., Кругликов В.Д., Титова С.В., Адаменко О.Л., Водопьянов А.С., Водопьянов С.О. Эпидемиологический надзор за холерой в России в период седьмой пандемии. Вестник Российской академии медицинских наук.2015; 70(2):249–56. DOI: 10.15690/vramn.v70i2.1320.

35. Greig D.R., Schaefer U., Octavia S., Hunter E., Chattaway M.A., Dallman T.J., Jenkins C. Evaluation of whole genome sequencing for the identification and typing of Vibrio cholerae. [Электронный ресурс]. URL: https://jcm.asm.org/content/56/11/e00831-18.long. DOI: 10.1128/JCM.00831-18 (дата обращения 31.10.2018 г.).

36. Cholera, diarrhea & dysentery update (08): Africa, Asia. 22 Feb 2018 [Электронный ресурс]. Archive Number: 20180222.5640697. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 10.01.2019 г.)

37. Somalia Humanitarian Needs Overview, report from UN Office for the Coordination of Humanitarian Affairs. 3 Jan 2019 [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/sites/reliefweb.int/files/resources/Somalia_2019_HNO.PDF (дата обращения 10.01.2019 г.).

38. Cholera, diarrhea & dysentery update (36): Africa. [Электронный ресурс]. Archive Number: 20180921.6043549. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 30.09.2018 г.)

39. Cholera, diarrhea & dysentery update (10): Africa. [Электронный ресурс]. Archive Number: 20180301.5658608. URL: http://www.promedmail.org. (10.03.2018 г.)

40. Weekly bulletin on outbreaks and other emergencies. WHO Africa, week 8, 17–23.02.2018 г. [Электронный ресурс]. URL: http://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/260335/OEW8-1723022018.pdf;jsessionid=068FA681949EFE96697F6F449BB49EAA?sequence=1 (дата обращения 27.02.2018 г.).

41. UNICEF Angola Humanitarian Situation Report (August / September 2018). 30 Sep 2018 [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/sites/reliefweb.int/files/resources/UNICEF%20Angola%20Humanitarian%20Situation%20Report%20-%20September%202018.pdf (дата обращения 15.01.2019 г.).

42. Cholera, diarrhea & dysentery update (04): Africa. [Электронный ресурс]. Archive Number: 20180127.5567857. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 01.02.2018 г.)

43. Зарубежное эпидобозрение – холера (Зимбабве). [Электронный ресурс]. Архивный номер 20180910.6020568. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 10.10.2018 г.).

44. The five biggest emergencies in Africa we’ve responded to in 2018. 31 Dec 2018 [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/democratic-republic-congo/five-biggest-emergenciesafrica-we-ve-responded-2018. (дата обращения 15.01.2019 г.).

45. Tanzania: Floods - Emergency Plan of Action. 30 Apr 2018 [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/sites/reliefweb.int/files/resources/MDRTZ021do.pdf (дата обращения 15.01.2019 г.).

46. Москвитина Э.А., Тюленева Е.Г., Самородова А.В., Кругликов В.Д., Титова С.В., Иванова С.М., Ковалева Т.В., Анисимова Г.Б. Эпидемиологическая обстановка по холере в мире и России в 2007–2016 гг., прогноз на 2017 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2017; 1:13–20. DOI: 10.21055/0370-1069-2017-1-13-20.

47. Cholera, diarrhea & dysentery update (11): Africa. [Электронный ресурс]. Archive Number: 20180308.5672462. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 5.09.2018 г.)

48. Cholera, diarrhea & dysentery update (39): Africa (South Africa ex Zimbabwe). [Электронный ресурс]. Archive Number: 20181010.6081678. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 15.10.2018 г.)

49. Weekly bulletin on outbreaks and other emergencies. WHO Africa, week 46, 10–16.11.2018 [Электронный ресурс]. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/275935/OEW46-1016112018.pdf (дата обращения 16.11.2018 г.).

50. Cholera, diarrhea & dysentery update (15): Canada (BC). [Электронный ресурс]. Archive Number: 20180328.5715869. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 10.04.2018 г.).

51. Rapport du Réseau National de Surveillance cholera. 52 semaine epidemiologique 2018. [Электронный ресурс]. URL: http://mspp.gouv.ht/site/downloads/Profil%20statistique%20Cholera%2052SE%202018.pdf (дата обращения 17.01.2019 г.).

52. Cholera, diarrhea & dysentery update (37): Americas (Chile) non-toxigenic 21 Sep 2018. [Электронный ресурс]. Archive Number: 20180921.6044225. URL: http://www.promedmail.org(дата обращения 15.10.2018 г.).

53. У отдыхающего из Новомосковска заподозрили холеру. http://pro.berdyansk.biz/content.php?id=49178 (дата обращения 07.09.2018 г.).

54. Про результати моніторингу за циркуляцією збудника холери за період з 16.06. по 22.06.2018 року. [Электронный ресурс]. URL: http://www.oblses.zp.ua/comment.php?n_id=3365.(дата обращения 25.06.2018 г.).

55. Інформація щодо санепідситуації в Одеській області за період з 20.07. по 26.07.2018 р. [Электронный ресурс]. http://oolcmoz.at.ua/news/informacija_shhodo_sanepidsituaciji_v_odeskij_oblasti_za_period_z_20_07_po_26_07_2018r/2018-08-01-201 (дата обращения 01.08.2018 г.).

56. На пляжах Днепропетровщины обнаружили холеру. Новости Днепра. [Электронный ресурс]. URL: https://dnepr.news/news/na-plyazhah-dnepropetrovschiny-obnaruzhili-holeru. (дата обращения 11.07.2018 г.).

57. Сагиев, 3.A., Мусагалиева P.C., Абдирасилова A.A., Аязбаев Т.З., Кульбаева М.М., Молдагасимова А.Б., Жунусова А.С., Утепова И.Б., Бегимбаева Э.Ж., Избанова У.А., Омашева Г.М., Турлиев З.С., Иманбекова Ж.Ж., Ниязбеков Н.Ш. О завозных случаях холеры в город Алматы в 2017 г., Казахстан. Проблемы особо опасных инфекций. 2018; 3:83–7. DOI: 10.21055/0370-1069-2018-3-83-87.

58. Холера (завозные случаи) – Казахстан (Алматы). [Электронный ресурс]. Архивный номер: 20180209.5618941. URL: http://www.promedmail.org (дата обращения 01.03.2018 г.).

59. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Олейников И.П., Мишанькин Б.Н., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Зубкова Д.А., Ежова М.И. INDEL- и VNTR-типирование штаммов Vibrio cholerae, выделенных в 2013 году из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации. Бюллетень Здоровье населения и среда обитания. 2015; 5(266):41–4.