Молекулярная диагностика коронавирусной инфекции в Кыргызской Республике

Цель исследования – разработка эффективного метода пулирования проб для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 с помощью ПЦР, а также оценка данного подхода с различными тест-системами.

Материалы и методы. Выявление РНК коронавируса SARS-CoV-2 проводилось в пробах, содержащих образцы мазков из носа людей, помещенных в транспортную среду. Пять образцов объединяли в один пул для выполнения анализа. Оценку эффективности метода пулирования «в одной пробирке» для выполнения массовых исследований на COVID-19 проводили с помощью тест-систем «Вектор-ПЦРрв-2019-nCoV-RG-19» (Россия), «АртТест COVID- 19» (Республика Беларусь) и «BioSpeedy» (Турция).

Результаты и обсуждение. Всего исследовано 587 пулов образцов, составленных из 2935 исследуемых проб, в которых обнаружено и подтверждено методом ПЦР 56 образцов, содержащих РНК SARS-CoV-2. Результаты применения метода пулирования коррелировали с данными, полученными без пулирования образцов. Среднее значение отклонения цикла составляло в среднем 2 C_t, кривая флуоресценции положительных образцов соответствовала «S» форме.

1. Novel Coronavirus – China. Disease outbreak news. (Cited 01 Apr 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/csr/don/12-january-2020-novel-coronavirus-china/en/.

2. World Health Organization. Report of the WHO-China Joint Mission on Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). (Cited 01 Apr 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/who-china-joint-mission-on-covid-19-finalreport.pdf.

3. World Health Organization. Critical preparedness, readiness and response actions for COVID-19: interim guidance. (Cited 27 Mar 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/publications-detail/critical-preparedness-readiness-and-response-actionsfor-covid-19.

4. World Health Organization. Laboratory testing strategy recommendations for COVID-19: interim guidance. (Cited 10 Apr 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/publications-detail/laboratory-testing-strategy-recommendations-for-covid-19interim-guidance.