Preview

Проблемы особо опасных инфекций

Расширенный поиск

Современные лабораторные методы выявления возбудителя желтой лихорадки

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2021-2-24-32

Полный текст:

Аннотация

Желтая лихорадка является острым инфекционным заболеванием вирусной природы, возбудитель которого передается трансмиссивным путем через укусы инфицированных комаров. Массовые эпидемии, вызванные вирусом желтой лихорадки, ежегодно отмечаются в странах Африки, Южной и Центральной Америки. Регистрируются завозные случаи и на неэндемичных территориях. В обзоре приведены имеющиеся в настоящее время литературные данные о распространении, строении и классификации вируса желтой лихорадки, выявлении его генетических вариантов в зависимости от географического распространения, а также о современных способах индикации и идентификации возбудителя в материале от больных и погибших людей. Рассматривается возможность применения вирусологических, иммуно-серологических и молекулярно-генетических методов для диагностики желтой лихорадки в разные периоды от начала болезни и при ретроспективных исследованиях. Приведены перечни диагностических препаратов отечественного и зарубежного производства для выявления маркеров возбудителей (антиген, РНК), а также специфических антител классов IgM и IgG, которые разрешены для применения на территории Российской Федерации и за рубежом. Показана актуальность дальнейшей разработки, совершенствования и внедрения в лабораторную практику наборов реагентов, позволяющих в короткие сроки, с высокой эффективностью и специфичностью обнаружить вирус желтой лихорадки в материале от больных людей, что поможет быстро установить диагноз и провести своевременные противоэпидемические мероприятия, а также определить уровень иммунной прослойки населения эндемичных регионов к возбудителю и оценить эффективность иммунизации для вакцинированного контингента. 

Об авторах

Е. И. Кривошеина
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия

630559, Новосибирская обл., р.п. Кольцово



М. Ю. Карташов
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»; Новосибирский государственный университет
Россия

630559, Новосибирская обл., р.п. Кольцово;

Новосибирск



Е. В. Найденова
ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия

410005, Саратов, ул. Университетская, 46



Список литературы

1. WHO. [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/csr/don/archive/disease/yellow_fever/ru/ (дата обращения 07.06.2021).

2. Письмо Роспотребнадзора от 24.03.2021 № 02/56702021-32 «О профилактике желтой лихорадки». [Электронный ресурс]. URL: https://www.rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=17269 (дата обращения 12.05.2021).

3. Monath T.P. Yellow fever: an update. Lancet Infect. Dis. 2001; 1(1):11–20. DOI: 10.1016/S1473-3099(01)00016-0.

4. Покровский В.И., редактор. Инфекционные болезни: Руководство для врачей. М.: Медицина; 1996. 528 с.

5. Львов Д.К., редактор. Медицинская вирусология: руководство. М.: МИА; 2008. 655 с.

6. Amraoui F., Pain A., Piorkowski G., Vazeille M., CoutoLima D., de Lamballerie X., Lourenço-de-Oliveira R., Failloux A.-B. Experimental adaptation of the yellow fever virus to the mosquito Aedes albopictus and potential risk of urban epidemics in Brazil, South America. Sci. Rep. 2018; 8(1):14337. DOI: 10.1038/s41598018-32198-4.

7. Федорова М.В., Швец О.Г., Юничева Ю.В., Медяник И.М., Рябова Т.Е., Отставнова А.Д. Современные границы распространения инвазивных комаров Aedes (Stegomyia) aegypti (L., 1762) и Aedes (Stegomyia) albopictus (Skuse, 1895) на юге Краснодарского края России. Проблемы особо опасных инфекций. 2018; 2:101–5. DOI: 10.21055/0370-1069-2018-2-101-105.

8. Ганушкина Л.А., Дремова В.П. Комары Aedes aegypti L. и Aedes albopictus skuse – новая биологическая угроза для юга России. Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2012; 3:49–55.

9. Beck A., Guzman H., Li L., Ellis B., Tesh R.B., Barrett A.D.T. Phylogeographic reconstruction of African Yellow fever virus isolates indicates recent simultaneous dispersal into east and west Africa. PLoS Negl. Trop. Dis. 2013; 7(3):e1910. DOI: 10.1371/journal.pntd.0001910.

10. Bryant J.E., Holmes E.C., Barrett A.D.T. Out of Africa: a molecular perspective on the introduction of yellow fever virus into the Americas. PLoS Pathog. 2007; 3(5):e75. DOI: 10.1371/journal. pntd.0001910.

11. WHO. Eliminate yellow fever epidemics (EYE) strategy 2017–2026. [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/initiatives/eye-strategy (дата обращения 12.05.2021).

12. Онищенко Г.Г., редактор. Специфическая индикация патогенных биологических агентов: Практическое руководство. М.: МП Гигиена; 2006. 288 с.

13. Drosten C., Kümmerer B.M., Schmitz H., Günther S. Molecular diagnostics of viral hemorrhagic fevers. Antiviral Res. 2003; 57(1–2):61–87. DOI: 10.1016/s01663542(02)00201-2.

14. Найденова Е.В., Куклев В.Е., Яшечкин Ю.И., Щербакова С.А., Кутырев В.В. Современное состояние лабораторной диагностики лихорадки денге (обзор). Проблемы особо опасных инфекций. 2013; 4:89–94. DOI: 10.21055/0370-1069-2013-4-89-94.

15. Mason R.A., Tauraso N.M., Spertzel R.O., Ginn R.K. Yellow fever vaccine: direct challenge of monkeys given graded doses of 17D vaccine. Appl. Microbiol. 1973; 25(4):539–44. DOI: 10.1128/am.25.4.539-544.1973.

16. Pato T.P., Souza M.C.O., Mattos D.A., Caride E., Ferreira D.F., Gaspar L.P., Freire M.S., Castilho L.R. Purification of yellow fever virus produced in Vero cells for inactivated vaccine manufacture. Vaccine. 2019; 37(24):3214–20. DOI: 10.1016/j.vaccine.2019.04.077.

17. Almeida M.A.B., Cardoso J. da C., Dos Santos E., da Fonseca D.F., Cruz L.L., Faraco F.J.C. Bercini M.A., Vettorello K.C., Porto M.A., Mohrdieck R., Ranieri T.M., Schermann M.T., Sperb A.F., Paz F.Z., Nunes Z.M., Romano A.P., Costa Z.G., Gomes S.L., Flannery B. Surveillance for yellow Fever virus in non-human primates in southern Brazil, 2001–2011: a tool for prioritizing human populations for vaccination. PLoS Negl. Trop. Dis. 2014; 8(3):e2741. DOI: 10.1371/journal.pntd.0002741.

18. Julander J.G. Animal models of yellow fever and their application in clinical research. Curr. Opin. Virol. 2016; 18:64–9. DOI: 10.1016/j.coviro.2016.03.010.

19. Higuera A., Ramírez J.D. Molecular epidemiology of dengue, yellow fever, Zika and Chikungunya arboviruses: An update. Acta Trop. 2019; 190:99–111. DOI: 10.1016/j.actatropica.2018.11.010.

20. Domingo C., Escadafal C., Rumer L., Méndez J.A., García P., Sall A.A., Teichmann A., Donoso-Mantke O., Niedrig M. First international external quality assessment study on molecular and serological methods for yellow fever diagnosis. PLoS One. 2012; 7(5):e36291. DOI: 10.1371/journal.pone.0036291.

21. Lanciotti R.S. Molecular amplification assays for the detection of flaviviruses. Adv. Virus Res. 2003; 61:67–99. DOI: 10.1016/s0065-3527(03)61002-x.

22. Карташов М.Ю., Чуб Е.В., Микрюкова Т.П., Найденова Е.В., Терновой В.А. Перспективы применения петлевой изотермической амплификации в диагностике опасных инфекционных болезней, вызванных вирусами I группы патогенности. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 2:22–30. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-2-22-30.

23. Nunes M.R.T., Vianez Jr.J.L., Nunes K.N.B., da Silva S.P., Lima C.P.S., Guzman H., Martins L.C., Carvalho V.L., Tesh R.B., Vasconcelos P.F.C. Analysis of a reverse transcription loopmediated isothermal amplification (RT-LAMP) for yellow fever diagnostic. J. Virol. Methods. 2015; 226:40–51. DOI: 10.1016/j.jviromet.2015.10.003.

24. Fischer C., Torres M.C., Patel P., Moreira-Soto A., Gould E.A., Charrel R.N., de Lamballerie X., Nogueira R.M.R., Sequeira P.C., Rodrigues C.D.S., Kummerer B.M., Drosten C., Landt O., Bispo de Filippis A.M., Drexler J.F. Lineage-specific real-time RT-PCR for yellow fever virus outbreak surveillance, Brazil. Emerg. Infect. Dis. 2017; 23(11):1867–71. DOI: 10.3201/eid2311.171131.

25. Kwallah A.O., Inoue S., Muigai A.W., Kubo T., Sang R., Morita K., Mwau M. A real-time reverse transcription loop-mediated isothermal amplification assay for the rapid detection of yellow fever virus. J. Virol. Methods. 2013; 193(1):23–7. DOI: 10.1016/j.jviromet.2013.05.004.

26. Chao D.Y., Davis B.S., Chang G.J. Development of multiplex real-time reverse transcriptase PCR assays for detecting eight medically important flaviviruses in mosquitoes. J. Clin. Microbiol. 2007; 45(2):584–9. DOI: 10.1128/JCM.00842-06.

27. Mantel N., Aguirre M., Gulia S., Girerd-Chambaz Y., Colombani S., Moste C., Barban V. Standardized quantitative RTPCR assays for quantitation of yellow fever and chimeric yellow fever-dengue vaccines. J. Virol. Methods. 2008; 151(1):40–6. DOI: 10.1016/j.jviromet.2008.03.026.

28. Nunes M.R., Palacios G., Nunes K.N., Casseb S.M., Martins L.C., Quaresma J.A., Savji N., Lipkin W.I., Vasconcelos P.F. Evaluation of two molecular methods for the detection of Yellow fever virus genome. J. Virol. Methods. 2011; 174(1–2):29–34. DOI: 10.1016/j.jviromet.11.02.025.

29. Domingo C., Yactayo S., Agbenu E., Demanou M., Schulz A.R., Daskalow K., Niedrig M. Detection of yellow fever 17D genome in urine. J. Clin. Microbiol. 2011; 49(2):760–2. DOI: 10.1128/JCM.01775-10.

30. Escadafal C., Faye O., Sall A.A., Faye O., Weidmann M., Strohmeier O., von Stetten F., Drexler J., Eberhard M., Niedrig M., Patel P. Rapid molecular assays for the detection of yellow fever virus in low-resource settings. PLoS Negl. Trop. Dis. 2014; 8(3):e2730. DOI: 10.1371/journal.pntd.0002730.

31. Rojas A., Diagne C.T., Stittleburg V.D., Mohamed-Hadley A., de Guillen Y.A., Balmaseda A., Faye O., Sall A.A., Harris E., Pinsky B.A., Waggoner J.J. Internally controlled, multiplex realtime reverse transcription PCR for dengue virus and yellow fever virus detection. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2018; 98(6):1833–6. DOI: 10.4269/ajtmh.18-0024.

32. Weidmann M., Faye O., Kranaster R., Marx A., Nunes M.R., Vasconcelos P.F., Hufert F.T., Sall A.A. Improved LNA probebased assay for the detection of African and South American yellow fever virus strains. J. Clin. Virol. 2010; 48(4):187–92. DOI: 10.1016/j.jcv.2010.04.013.

33. Bae H.G., Nitsche A., Teichmann A., Biel S.S., Niedrig M. Detection of yellow fever virus: a comparison of quantitative realtime PCR and plaque assay. J. Virol. Methods. 2003; 110(2):185–91. DOI: 10.1016/s0166-0934(03)00129-0.

34. Hughes H.R., Russell B.J., Mossel E.C., Kayiwa J., Lutwama J., Lambert A.J. Development of a real-time reverse transcription-PCR assay for the global differentiation of yellow fever virus vaccine – elated adverse events from natural infections. J. Clin. Microbiol. 2018; 56(6):e00323-18. DOI: 10.1128/JCM.00323-18.

35. Dash P.K., Boutonnier A., Prina E., Sharma S., Reiter P. Development of a SYBR green I based RT-PCR assay for yellow fever virus: application in assessment of YFV infection in Aedes aegypti. Virol. J. 2012; 9:27. DOI: 10.1186/1743-422X-9-27.

36. Chao D.Y., Davis B.S., Chang G.J. Development of multiplex real-time reverse transcriptase PCR assays for detecting eight medically important flaviviruses in mosquitoes. J. Clin. Microbiol. 2007; 45(2):584–9. DOI: 1010.1128/JCM.00842-06.

37. Domingo C., Patel P., Yillah J., Weidmann M., Méndez J.A., Nakouné E.R., Niedrig M. Advanced yellow fever virus genome detection in point-of-care facilities and reference laboratories. J. Clin. Microbiol. 2012; 50(12):4054–60. DOI: 10.1128/JCM.01799-12.


Для цитирования:


Кривошеина Е.И., Карташов М.Ю., Найденова Е.В. Современные лабораторные методы выявления возбудителя желтой лихорадки. Проблемы особо опасных инфекций. 2021;(2):24-32. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2021-2-24-32

For citation:


Krivosheina E.I., Kartashov M.Yu., Naidenova E.V. Advanced Laboratory Methods for Detecting Yellow Fever Pathogen. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2021;(2):24-32. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2021-2-24-32

Просмотров: 133


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)