В обзоре рассмотрены актуальные аспекты лабораторной диагностики бешенства. Приведены методы лабораторной диагностики рабической инфекции, стандартизованные ВОЗ в 2018 г., и их применение на территории Российской Федерации. Показана схема лабораторной диагностики бешенства, применяемая специалистами ФГБУ «48 ЦНИИ» Минобороны России для исследования поступивших проб биологического материала от погибших людей. В период 2002–2018 гг. изучение биоматериала проводили при помощи молекулярно-биологического, вирусологического методов диагностики и в некоторых случаях электронной микроскопии, что позволило выявить и идентифицировать возбудитель в 257 пробах от 71 человека, паспортизовать и депонировать новые изоляты вируса бешенства. Накопление и анализ опыта применения молекулярно-биологического метода диагностики бешенства позволяют рекомендовать к использованию наборы ОТ-ПЦР, ОТ-ПЦР-РВ (имеющие удостоверение о государственной регистрации) в практике здравоохранения и ветеринарии для идентификации возбудителя рабической инфекции. Применение молекулярно-биологических методов представляется перспективным в плане развития диагностики бешенства для совершенствования эпидемиологического надзора и повышения эффективности системы биологической защиты населения Российской Федерации. 

Целью работы является рассмотрение принципов и критериев формирования фондов сервисных микробиологических коллекций и специализированной Государственной коллекции патогенных бактерий (ГКПБ) ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб». Быстрые темпы описания, изучения, использования микробного разнообразия делают актуальной задачу разработки критериев отбора микроорганизмов для постоянного хранения в коллекциях. Количество и форма этих критериев определяются задачами, стоящими перед коллекционными центрами разного уровня и специализации. Сервисные коллекции формируют свои фонды посредством депонирования или приобретения типовых, референтных, учебных штаммов. В последние годы признана целесообразность расширения спектра штаммов, депонирование которых желательно в сервисных коллекциях. Это штаммы, характеризующиеся филогенетической, геномной, метаболической, экологической уникальностью; с полностью секвенированным геномом; известные и новые патогены растений, животных и человека, вызвавшие вспышки заболеваний; использованные в международных исследовательских проектах; имеющие биотехнологическое и экономическое значение. Главная задача ГКПБ как специализированной государственной коллекции патогенных бактерий I–II групп состоит в сохранении штаммов, характеризующих внутривидовое разнообразие и популяции патогенов, циркулирующих в природных очагах или на определенных территориях Российской Федерации, выделенные в период эпизоотий, локальных или эпидемических вспышек. Критериями отбора штаммов для постоянного хранения являются их экологические, фенотипические, генетические особенности. Сохранение такой коллекции важно для будущих исследований с использованием новых технологий и прослеживания эволюции патогенных бактерий – возбудителей особо опасных инфекционных заболеваний. 

Желтая лихорадка является острым инфекционным заболеванием вирусной природы, возбудитель которого передается трансмиссивным путем через укусы инфицированных комаров. Массовые эпидемии, вызванные вирусом желтой лихорадки, ежегодно отмечаются в странах Африки, Южной и Центральной Америки. Регистрируются завозные случаи и на неэндемичных территориях. В обзоре приведены имеющиеся в настоящее время литературные данные о распространении, строении и классификации вируса желтой лихорадки, выявлении его генетических вариантов в зависимости от географического распространения, а также о современных способах индикации и идентификации возбудителя в материале от больных и погибших людей. Рассматривается возможность применения вирусологических, иммуно-серологических и молекулярно-генетических методов для диагностики желтой лихорадки в разные периоды от начала болезни и при ретроспективных исследованиях. Приведены перечни диагностических препаратов отечественного и зарубежного производства для выявления маркеров возбудителей (антиген, РНК), а также специфических антител классов IgM и IgG, которые разрешены для применения на территории Российской Федерации и за рубежом. Показана актуальность дальнейшей разработки, совершенствования и внедрения в лабораторную практику наборов реагентов, позволяющих в короткие сроки, с высокой эффективностью и специфичностью обнаружить вирус желтой лихорадки в материале от больных людей, что поможет быстро установить диагноз и провести своевременные противоэпидемические мероприятия, а также определить уровень иммунной прослойки населения эндемичных регионов к возбудителю и оценить эффективность иммунизации для вакцинированного контингента. 

В обзоре рассмотрена современная ситуация по высокопатогенному вирусу гриппа птиц в 2020 г. и сделан прогноз возможного дальнейшего распространения вирусов на территории России. В 2020 г. в мире отмечена циркуляция разнообразных вариантов вируса, имеющих важное эпизоотологическое и эпидемиологическое значение. Вспышки инфекционных заболеваний, вызванные высокопатогенными вирусами гриппа, зарегистрированы более чем в 30 странах. Помимо этого, зафиксированы случаи инфицирования людей вирусами гриппа подтипов A/H5Nx и A/H9N2. В России в 2020 г. зарегистрирована масштабная эпизоотия, которая затронула более десяти регионов. Вспышки заболевания среди диких и домашних птиц были вызваны высокопатогенным вариантом вируса гриппа A/H5N8 клады 2.3.4.4b. В результате эпизоотии погибло или было уничтожено более 1,5 млн голов сельскохозяйственной птицы. Выявлено, что некоторые штаммы вируса гриппа, выделенные в России, имели высокую степень идентичности со штаммами, циркулировавшими в Европе и Юго-Восточной Азии. Таким образом, в очередной раз показано, что территория России играет важную географическую роль в глобальном распространении вируса гриппа птиц. 

Представлен анализ заболеваемости людей бруцеллезом в мире в 2011–2020 гг. Дана оценка эпизоотологоэпидемиологической ситуации по бруцеллезу в Российской Федерации в 2020 г. Отмечено, что эпидемиологическая обстановка по бруцеллезу в России за последние десять лет характеризовалась как неблагополучная с динамикой к снижению уровня заболеваемости на фоне стойкого эпизоотологического неблагополучия по бруцеллезу среди крупного и мелкого рогатого скота. В период 2011–2020 гг. зарегистрировано 3507 случаев впервые выявленного бруцеллеза среди людей. Среднее многолетнее количество заболевших составляет 350 случаев в год, в том числе среди детей до 17 лет – 28 случаев. Среднемноголетний интенсивный показатель заболеваемости на 100 тыс. населения составил 0,24, среди детей до 17 лет – 0,1. В 2020 г. в России выявлено 119 случаев заболевания людей бруцеллезом (0,08), что указывает на сохранение тенденции на улучшение эпидемической обстановки по бруцеллезу. Наибольшее количество случаев бруцеллеза среди людей зарегистрировано в СевероКавказском (77,1 % от общероссийской заболеваемости бруцеллезом) и Южном федеральных округах (13,5 %). В период с 2010 по 2020 г. (9 мес.) в Российской Федерации зарегистрировано 4610 неблагополучных пунктов по бруцеллезу КРС и 422 – по бруцеллезу овец и коз. Анализ развития ситуации по бруцеллезу в России указывает, что в среднесрочной перспективе при сохранении существующих тенденций имеется реальный риск широкого распространения бруцеллеза среди сельскохозяйственных животных в субъектах Центрального, Приволжского, Дальневосточного и Сибирского федеральных округов, а также сохранение эпизоотологического неблагополучия в Северо-Кавказском и Южном федеральных округах. С учетом текущей эпизоотолого-эпидемиологической обстановки и многолетней динамики развития ситуации по бруцеллезу в Российской Федерации в 2021 г. можно прогнозировать заболеваемость людей бруцеллезом на уровне ниже средних многолетних значений – 0,13–0,18 на 100 тыс. населения. 

Цель обзора – проанализировать эпидемиологическую ситуацию по иксодовым клещевым боррелиозам (ИКБ) в субъектах Российской Федерации в динамике за период 2010–2020 гг. с учетом особенностей 2020 г., связанных с распространением COVID-19, дать прогноз развития эпидемического процесса ИКБ на 2021 г. В 2020 г. в РФ зарегистрировано 4180 случаев заболеваний ИКБ, что в 1,93 раза меньше, чем в 2019 г., и в 1,73 раза меньше, чем среднемноголетний показатель за предыдущие десять лет. Значительное снижение отмечено во всех федеральных округах, за исключением Центрального федерального округа, где зарегистрировано более половины всех случаев ИКБ. По сравнению с 2019 г. снижение заболеваемости в 2020 г. произошло в 75 из 78 субъектов, при этом в 56 субъектах это снижение было статистически значимым. Кратность снижения заболеваемости ИКБ в 2020 г. по всем федеральным округам оказалась значительно больше, чем кратность снижения частоты контактов населения с клещами. Зараженность боррелиями иксодовых клещей различных видов в природных очагах в 2020 г. статистически значимо выше, чем в 2019 г. Вероятно, снижение регистрируемой заболеваемости ИКБ на фоне пандемии COVID-19 обусловлено не только снижением интенсивности контактов населения с природными очагами, но и резким перераспределением объемов оказания медицинской помощи в пользу больных COVID-19. Учитывая высокую степень значимости выявленных тенденций в динамике эпидемического процесса ИКБ в течение 2010–2020 гг., есть основания ожидать в 2021 г. роста заболеваемости в Брянской, Воронежской, Рязанской, Тульской и Саратовской областях, что требует особого внимания в плане усиления профилактических мероприятий и мониторинга активности и структуры природных очагов. В остальных субъектах РФ в краткосрочной перспективе в условиях сохранения прежних объемов профилактических мероприятий и при отсутствии аномальных природно-климатических явлений вероятно сохранение или некоторое снижение уровня заболеваемости ИКБ. 

Использовались данные оперативного мониторинга, осуществляемого Референс-центром по мониторингу за геморрагической лихорадкой с почечным синдромом (ГЛПС) ФБУН «Казанский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора, на основании официальных данных, представляемых учреждениями Роспотребнадзора в субъектах Российской Федерации. Статистическая обработка проведена стандартными методами вариационной статистики с применением программы Excel. За последние десятилетия хантавирусные болезни остаются актуальными и распространенными во всем мире. На территории Российской Федерации природные очаги ГЛПС расположены в европейской части страны, Западной Сибири и на Дальнем Востоке. Наиболее эпидемически активные очаги распространены в европейской части России. За последние десять лет интенсивный показатель заболеваемости ГЛПС в Российской Федерации составляет 3,0–9,5 на 100 тыс. населения, среднемноголетний – 5,2 на 100 тыс. населения. В 2020 г. зарегистрировано 3845 случаев заболевания ГЛПС (2,62 на 100 тыс. населения). Произошло снижение заболеваемости ГЛПС в 3,6 раза по сравнению с показателями 2019 г., что может быть связано с депрессией эпизоотического процесса в популяциях мелких млекопитающих – основных резервуарных носителей возбудителей ГЛПС, обусловленной природно-климатическими факторами. Характер распределения заболеваемости ГЛПС по территории Российской Федерации в 2020 г. был неоднороден. Статистическая обработка данных позволила выделить 5 групп территорий, отличающихся по уровню заболеваемости ГЛПС. К группам территорий с высоким и очень высоким уровнем заболеваемости отнесены почти все субъекты Приволжского федерального округа и Костромская область, относящаяся к Центральному федеральному округу. В 2021 г. прогнозируется осложнение эпидемиологической обстановки в летне-осенний период года на территории Приволжского федерального округа и четырех субъектов Центрального федерального округа. 

Цель исследования – уточнение границ Центральноазиатского природного очага чумы Казахстана и современных границ ареала большой песчанки (Rhombomys opimus) в целях совершенствования эпизоотологического мониторинга и повышения эффективности профилактических (противоэпидемических) мероприятий.

Материалы и методы. Для анализа использовали данные эпизоотологического мониторинга популяций большой песчанки в 14 автономных очагах Центральноазиатского пустынного природного очага чумы Республики Казахстан в 2010– 2020 гг. Проведено эпизоотологическое обследование на площади 875350 км2 . При обработке данных использованы эпидемиологические, эпизоотологические, статистические методы исследования, а также ГИС-технологии.

Результаты и обсуждение. Установлено увеличение в 1990–2020 гг. общей площади Центральноазиатского пустынного природного очага чумы Республики Казахстан на 79710 км2 (9,98 %). Отмечено, что изменение площади энзоотичной по чуме территории явилось следствием пульсации ареала основного носителя возбудителя чумы – большой песчанки под влиянием климатических и антропогенных факторов. Наиболее значительные изменения установлены в юго-восточной части энзоотичной по чуме территории Республики Казахстан, в том числе для Бетпакдалинского (50 %), Прибалхашского (34,3 %), Таукумского (13,3 %) и Мойынкумского (0,32 %) автономных очагов. Площадь Арыскум-Дариялыктакырского автономного очага сократилась на 2100 км2 (4 %). В 2000–2002 гг. выявлены новые Приалакольский и Илийский межгорный автономные очаги общей площадью 26759 км2 . Показано, что вследствие регрессии Аральского моря произошло расширение ареала большой песчанки и увеличение площади Северо-Приаральского и Кызылкумского природных очагов чумы на 10500 км2 (29,2 %) и 560 км2 (0,4 %) соответственно. Площади Приаральско-Каракумского и Урало-Эмбинского пустынных автономных очагов, напротив, сократились на 2000 км2 (2,6 %) и 12300 км2 (17,6 %) соответственно. Выполнена паспортизация и ландшафтно-эпизоотологическое районирование территории Центральноазиатского пустынного природного очага чумы Республики Казахстан. 

Цель работы заключалась в конструировании и опытно-экспериментальных исследованиях набора реагентов для выявления спектра генов, детерминирующих резистентность к антибактериальным препаратам у штаммов Vibrio cholerae.

Материалы и методы. В работу были взяты штаммы V. cholerae, выделенные от людей и из объектов окружающей среды во время эпидосложнений и в благополучный по холере период. Чувствительность к антимикробным препаратам оценивали диско-диффузионным методом. Полногеномное секвенирование проведено на приборе Illumina MiSeq. Профиль генов резистентности определяли на основании сравнения с базой данных ResFinder. Проведены оптимизация температурного режима, состава реакционных смесей, подбор параметров реакции, определены специфичность, чувствительность и воспроизводимость сконструированного прототипа тест-системы.

Результаты и выводы. Для взятых в работу штаммов определен спектр устойчивости к антибиотикам и профиль генов резистентности. Для разработки мультиплексной ПЦР выбраны наиболее распространенные в популяциях V. cholerae гены, обусловливающие устойчивость к тетрациклину (tetA), стрептомицину (strA), флорфениколу/хлорамфениколу (floR) и триметоприму/сульфаметоксазолу (две формы гена дигидрофолатредуктазы: dfrA1 и dhfR), а также ген интегразы SXT-элемента (int). В реакции специфично выявляются маркеры в соответствии с геномным профилем резистентности, что коррелирует с фенотипическим проявлением устойчивости, определенным диско-диффузионным методом. Чувствительность разработанной панели праймеров и зондов для штаммов V. cholerae составила 103 –104  КОЕ/мл. Таким образом, учитывая специфичность, быстроту и простоту постановки реакции, разработанная система праймеров и зондов может быть успешно применена для предварительной оценки резистентности штаммов V. cholerae к антимикробным препаратам. 

Цель исследования – характеристика и молекулярно-генетическая идентификация штаммов Yersinia pseudotuberculosis, выделенных в Сарыджазском высокогорном очаге Тянь-Шаня.

Материалы и методы. Дифференциацию культур Y. pestis и Y. pseudotuberculosis проводили по чувствительности к диагностическим бактериофагам, подвижности, ферментации мочевины, продукции пестицина. Полногеномное секвенирование выполняли с помощью Ion S5 XL System (Thermo Fischer Scientific). Для обработки данных и сборки последовательностей сырых ридов de novo использовали Ion Torrent Suite software package, 5.12 и Newbler gsAssembler 2.6. Дендрограмму строили методом Maximum Likelihood с применением программы PhyML 3.1.

Результаты и обсуждение. Из смешанных с Y. pestis музейных культур, полученных от сурков в Сарыджазском высокогорном очаге, выделены штаммы Y. pseudotuberculosis. По данным полногеномного SNP-анализа они относятся к филогенетической группе O:3 серовара, широко распространенной по всему миру. Y. pseudotuberculosis часто присутствует в смешанных с Y. pestis культурах, выделяемых от грызунов, что следует учитывать при проведении лабораторной диагностики чумы в природных очагах. 

Цель. Создание экспериментальных образцов иммуноферментных тест-систем и иммунохроматографических наборов реагентов для выявления стафилококковых энтеротоксинов типов А и В.

Материалы и методы. В работе использованы гибридомы, продуцирующие моноклональные антитела к стафилококковым энтеротоксинам типов А и В, полученные в филиале ФГБУ «48 ЦНИИ» Минобороны России (г. Киров); мыши линии BALB/c; стафилококковые энтеротоксины типов А и В. Клетки гибридом культивировали в культуральных флаконах и в перитонеальной полости мышей линии BALB/с. Моноклональные антитела выделяли из асцитических жидкостей путем осаждения насыщенным раствором сульфата аммония с последующей очисткой ионообменной хроматографией. Полученные препараты моноклональных антител использовали для конструирования иммуноферментных тестсистем и иммунохроматографических наборов реагентов для выявления стафилококковых энтеротоксинов типов А и В. Специфические компоненты иммуноферментных тест-систем подвергали сублимационному высушиванию в защитной среде.

Результаты и обсуждение. Сконструированы иммуноферментные тест-системы и иммунохроматографические наборы реагентов, позволяющие выявлять стафилококковые энтеротоксины типов А и В в концентрациях 0,5 нг/мл и более, в том числе в пробах продуктов питания. 

Цель – совершенствование мониторинга природных очагов бешенства на основе использования современных технологий картографического анализа.

Материалы и методы. Проведено ретроспективное исследование по данным официальной регистрации бешенства в Забайкальском крае (Восточном Забайкалье) за 1950–2020 гг. Пространственное распространение бешенства среди животных сравнивали по двум отрезкам времени: 1972– 1978 гг. (n=157) и 2014–2020 гг. (n=61). Для картографирования использованы программы QGIS 3.16.0, ArcMap 10.8.1, ArcScene 10.8.1 и электронные ландшафтно-географические карты мира Natural Earth, OpenStreetMap. На картограммах выделены анализируемые территориальные единицы (АТЕ), привязанные к градусной сетке (0,5º × 0,5º). Связь локализации случаев бешенства с элементами ландшафта оценивали статистически, сравнивая благополучные и неблагополучные АТЕ.

Результаты и обсуждение. Установлены различия в ландшафтной приуроченности эпизоотий бешенства в Восточном Забайкалье в разные периоды времени. До 1983 г. преобладало бешенство собак, и эпизоотии распространялись за пределы лесостепной зоны. С 1984 по 2013 год бешенство среди животных не регистрировалось. В 2014–2020 гг. лисицы (Vulpes vulpes) служили основным источником вируса бешенства. Площадь эпизоотии сократилась более чем в два раза в сравнении с 1972–1978 гг. Основные проявления бешенства наблюдались на стыке равнинных и горных, степных и лесных участков. Неблагополучные по бешенству АТЕ отличались более выраженной вариабельностью элементов ландшафта. Выявлены вероятные пути трансграничного распространения вируса бешенства. Обсуждена связь особенностей распространения бешенства в Восточном Забайкалье в 1950–2020 гг. с генетическими вариантами вируса, изменениями климата, миграциями животных и антропогенными факторами. Результаты исследования предлагается использовать для корректировки программ барьерной оральной вакцинации лисиц. 

Цель исследования – определение динамики остаточной инфекционной активности вируса SARS-CoV-2 на различных типах поверхностей, в том числе на бумажных банкнотах и металлических монетах, в образцах питьевой дехлорированной воды и образцах, имитирующих морскую воду, с концентрацией солей по хлориду натрия 0,9 и 3,5 % при температуре 24–28 ºС.

Материалы и методы. Исследования проводили с использованием коронавируса SARS-CoV-2 штамм nCoV/Victoria/1/2020 из Коллекции штаммов микроорганизмов ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора, исходный титр – (6,0±0,2) lg ТЦД50/мл. В работе использована культура клеток Vero E6 из Коллекции клеточных культур ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора в виде 2-суточного монослоя с конфлюентностью 95–100 %, выращенная в 96-луночных культуральных планшетах.

Результаты и выводы. Коронавирус SARS-CoV-2 жизнеспособен как в пресной, так и морской воде, независимо от ее солености, на протяжении как минимум 48 часов, причем степень сохранности остаточной инфекционной активности вируса зависит от температуры воды: чем она ниже, тем лучше сохраняется вирус. Установлено, что коронавирус SARS‑CoV-2 при температуре 24–28 ºС способен сохранять инфекционную активность на всех исследованных типах тест-поверхностей в течение как минимум 48 часов, при этом степень сохранности остаточной инфекционной активности вируса зависит от типа поверхности, лучше всего вирус сохраняется на нержавеющей стали, пластике и стекле. Показано, что на поверхностях бумажных банкнот и металлических монет инфекционная активность вируса SARS-CoV-2 сохраняется более 24 часов. Проведенные исследования подтвердили способность коронавируса SARS-CoV-2 сохранять свою инфекционную активность в окружающей среде при благоприятных для него условиях и, соответственно, представлять эпидемиологическую опасность для населения. 

Цель исследования – комплексный анализ фенотипических и генетических свойств штаммов Yersinia pestis, выделенных в Сарыджазском и Верхненарынском высокогорных очагах Тянь-Шаня в 2019–2020 гг.; определение современной популяционной структуры и ареала этих высоковирулентных штаммов возбудителя чумы.

Материалы и методы. Проведены исследования биохимических свойств (ферментация углеводов, питательные потребности), вирулентности (in vitro и на лабораторных животных); молекулярно-генетический анализ и полногеномное секвенирование штаммов Y. pestis, выделенных в Сарыджазском и Верхненарынском высокогорных очагах в 2019–2020 гг. Для сравнения использованы штаммы Y. pestis из очагов Тянь-Шаня и Памиро-Алая 1928–2016 гг. Полногеномное секвенирование проводили в системе Ion S5 XL System. Филогенетический анализ выполнен на основе 1443 выявленных коровых SNPs у 36 включенных в анализ штаммов Y. pestis различных филогенетических линий. Построение дендрограмм проводили с использованием алгоритма Maximum Likelihood, программы PHYML, модели HKY85.

Результаты и обсуждение. Установлена принадлежность всех штаммов Y. pestis, выделенных в Сарыджазском и Верхненарынском высокогорных очагах в 2019–2020 гг., к филогенетической ветви 0.ANT5 античного биовара основного подвида. По данным полногеномного секвенирования выявлено наличие двух клонов 0.ANT5, первый из которых состоит из штаммов 2020 г. из бассейна р. Коойлу в Сарыджазском очаге. Второй мощный клон включает штаммы 2012–2020 гг., выделенные в Сарыджазском и Верхненарынском очагах. Показана высокая вирулентность выделенных штаммов. Сделан вывод о необходимости дальнейшего исследования территорий высокогорных очагов Тянь-Шаня и Памиро-Алая для установления современных границ ареала 0.ANT5, а также выявления участков циркуляции Y. pestis других филогенетических линий. 

Цель исследования – изучение иммунитета к SARS-CoV-2 среди медицинских работников г. Казани.

Материалы и методы. Материалом служили образцы сыворотки крови 348 медицинских работников из 10 медицинских организаций г. Казани, разделенных на группы по уровню предполагаемого риска инфицирования сотрудников. Для определения IgG использовался двухстадийный прямой вариант твердофазного ИФА и тестсистема «SARS-CoV-2-IgG-ИФА-БЕСТ» (Россия).

Результаты и обсуждение. На момент исследования и за предшествующие три месяца у обследуемых медицинских работников отсутствовали симптомы ОРВИ и инфекции дыхательных путей; были отрицательными результаты исследования мазков из носоглотки/ротоглотки на наличие РНК SARS-CoV-2. Серопревалентность по IgG к вирусу SARS-CoV-2 для различных медицинских организаций Казани варьировала в пределах 3,3–30,8 % и в среднем составила 16,4 %. Широкое варьирование значений серопревалентности может свидетельствовать о разном уровне интенсивности профессиональных контактов и эффективности противоэпидемических мероприятий в данных медицинских организациях. Среди серопозитивных медицинских работников отмечается превалирование доли лиц с очень высоким коэффициентом позитивности (49,1 %), что характеризует высокий уровень противовирусных антител. Наличие среди медицинских работников значительной доли серопозитивных лиц, перенесших бессимптомную форму COVID-19, подтверждает высокую интенсивность скрыто протекающего эпидемического процесса, что необходимо учитывать при организации профилактических мероприятий, в том числе вакцинации. 

Цель – ранжирование статистических моделей для оценки вклада ряда факторов, определяющих эпизоотическую ситуацию по природно-очаговым инфекционным болезням в сообществах несинантропных мелких млекопитающих (ММ) лесных массивов г. Екатеринбурга.

Материалы и методы. Обследование ММ проводили в течение трех лет в летне-осенний период. Животных отлавливали давилками на стандартную хлебную приманку, отработано 9705 ловушко-суток. Для выявления инфекций (геморрагической лихорадки с почечным синдромом, туляремии, лептоспироза, иерсиниоза, псевдотуберкулеза) использовано 333 экземпляра ММ (грызунов и землероек шести видов), случайным образом взятых из общей выборки. Для определения возбудителей использовали методы иммуноферментного анализа и полимеразной цепной реакции. Оценивали совокупную зараженность ММ всеми исследуемыми природно-очаговыми инфекциями. Статистическая обработка данных проведена с позиций мультимодельного подхода. Отбор моделей проводили с помощью информационного критерия Акаике с расчетом суммы весов моделей по их полному спектру (SW).

Результаты и обсуждение. В лесопарках г. Екатеринбурга выявлены носители всех вышеперечисленных инфекций, кроме псевдотуберкулеза. Согласно проведенному ранжированию, самый высокий вес получила модель с тремя предикторами: вид, год, обилие ММ предыдущего года в конкретном местообитании. Наиболее значимые предикторы по полному спектру моделей: год (SW=1), вид (SW=0,6), обилие животных в текущем и предыдущем году (SW=0,48). Распределение положительных проб по видам ММ соответствовало их ранжированию по обилию в сообществе. Влияние факторов «сезон» (лето или осень) и «район» (место отлова животных) оказалось незначительным в масштабе проведенных исследований (SW=0,3 и 0,16 соответственно). Процент инфицированных проб суммарно по всем инфекциям значительно варьировал по локалитетам и годам (0–60 %). Обсуждается возможное значение неучтенных факторов: ландшафтных особенностей и режима использования лесопарков, миграционной активности ММ. Сделан вывод о полезности мультимодельного подхода при анализе данных эпизоотологических исследований. 

Цель работы – изучить генетическое разнообразие и пространственно-временную генотипическую структуру Yersinia pestis subspecies central asiatica biovar altaica в Горно-Алтайском высокогорном природном очаге чумы при MLVA25-типировании.

Материалы и методы. Проведено MLVA25-типирование 330 штаммов Y. pestis ssp. central asiatica bv. altaica, изолированных в Горно-Алтайском высокогорном природном очаге чумы в 1961–2015 гг. Построение филогенетического древа осуществляли методами UPGMA и MST.

Результаты и выводы. На основе кластерного анализа исследованные штаммы дифференцированы на 34 MLVA-типа. Сформированные крупные группы штаммов имеют выраженную пространственную приуроченность. Выявлены три хорологические группировки возбудителя чумы, обладающие своеобразием генотипических характеристик, каждая из которых распространена в пределах популяции основного носителя – монгольской пищухи (Уландрыкской, Тархатинской, Курайской) – и, соответственно, в одноименном мезоочаге. MLVA25-структура чумного микроба в Уландрыкском и Курайском мезоочагах характеризуется стабильностью во времени; существенные изменения не обнаруживаются с начала их выявления в 1961 и 1999 гг. соответственно. В Тархатинском мезоочаге, известном с 1972 г., наблюдаются кардинальные изменения MLVA25-структуры. Здесь с начала 1990-х гг. произошло массовое распространение MLVA25-типов, до этого периода встречавшихся с небольшой частотой, и элиминация таковых, абсолютно доминирующих до 1980 г. Наиболее вероятно, что смена доминирующих генотипов обусловлена эффектом «бутылочного горлышка», произошедшим в результате резкого снижения эпизоотической активности очага в середине 1980-х гг. 

Цель исследования – сравнительный анализ иммуногенной активности вакцины чумной живой, полученной на различных питательных средах.

Материалы и методы. Объект исследования – кровь аутбредных белых мышей, иммунизированных сериями вакцины чумной живой на основе штамма Yersinia pestis EV линии НИИЭГ, изготовленной с использованием экспериментальной и регламентированной питательных сред. Исследована иммуногенная активность вакцин методом проточной цитометрии. Интенсивность антигенреактивности лимфоцитов определяли в клеточных тестах in vitro, анализируя маркер ранней активации CD25+ . Для специфической активации лимфоцитов использовался комплекс водорастворимых антигенов чумного микроба. Для выявления связи наличия протективного противочумного иммунитета с уровнем интенсивности экспрессии маркера ED50 исследуемых серий определяли традиционным методом.

Результаты и обсуждение. Проведен сравнительный анализ иммуногенной активности вакцины чумной живой, полученной на экспериментальной питательной среде с вакциной, выращенной на агаре Хоттингера. При иммунизации животных дозами 4·103 , 2·104 и 1·105 живых микробных клеток (регламентированные дозы) наивысший уровень экспрессии лимфоцитами маркера CD25 достигал максимальной отметки на 14-е сутки с последующим снижением на 21-е сутки после вакцинации. При определении иммуногенности традиционным методом установлена высокая степень прямой связи количества выживших животных с увеличением уровня лимфоцитов, экспрессирующих маркеры ранней активации. При сравнении выявлены общие закономерности: при введении наименьшей иммунизирующей дозы (8·102 ) не наблюдалась активация маркеров раннего иммунитета. При иммунизации бóльшими дозами на 7, 14 и 21-е сутки в крови у биомоделей отмечалось пропорциональное повышение количества CD25-позитивных лимфоцитов после стимуляции специфическим антигеном в условиях in vitro.