Выявление и генотипирование патогенных лептоспир, циркулирующих среди грызунов на территории Санкт-Петербурга
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2025-2-72-78
Аннотация
Цель – определение инфицированности различными геномовидами лептоспир диких и синантропных мелких млекопитающих, собранных на территории Санкт-Петербурга. Материалы и методы. Сбор диких и синантропных мелких млекопитающих проводился с сентября по октябрь 2021 г. с использованием ловушек типа Геро в Курортном и Кировском районах Санкт-Петербурга. Исследование образцов на наличие ДНК Leptospira spp. проводилось методом ПЦР с использованием праймеров, подобранных по фрагменту гена lipL32. Генотипирование образцов проводили с использованием праймеров по фрагментам генов secY и rpoB. Результаты и обсуждение. ДНК патогенных лептоспир выявлена в 8 образцах, что составило (4,2±1,5) % от общего количества образцов (190). Инфицированность серых крыс, собранных на территории Кировского района, составила (11,1±5,2) % (4/36). Инфицированность диких грызунов, собранных на территории Курортного района, – у желтогорлых мышей (3,7±2,6) % (2/54), а у рыжих полевок (2,0±1,4) % (2/100). По результатам анализа последовательностей, полученных при секвенировании, выявлена циркуляция двух патогенных видов лептоспир – L. interrogans и L. borgpetersenii. Полученные нами результаты подтверждают циркуляцию лептоспир как среди диких, так и среди синантропных мелких млекопитающих. Филогенетические виды патогенных лептоспир, выявленные в нашем исследовании, типичны и ассоциированы с исследованными грызунами. С целью профилактики заболевания людей необходимо продолжать исследования, направленные на выявление циркуляции возбудителей в популяциях диких и синантропных мелких млекопитающих. Необходимо проведение дератизационных мероприятий и мероприятий, направленных на разъяснение жителям Санкт-Петербурга мер защиты и профилактики.
Об авторах
Р. Р. БаимоваРоссия
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14
Е. Г. Рябико
Россия
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14
Д. И. Гречишкина
Россия
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14
И. А. Кармоков
Россия
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14
Э. С. Халилов
Россия
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14
И. С. Лызенко
Россия
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14
Г. А. Лунина
Россия
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14
Ю. В. Останкова
Россия
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14
Н. К. Токаревич
Россия
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14
И. Р. Желтакова
Россия
198035, Санкт-Петербург, ул. Невельская, 3
И. А. Чмырь
Россия
198035, Санкт-Петербург, ул. Невельская, 3
Список литературы
1. Her R., Crespin L., Etougbétché J., Groud K., Gnolonfoun M., Chapron A., Evenamia C., Houéménou G., Lurier T., Cappelle J., Dobigny G., Ayral F. Seroprevalence and renal carriage of pathogenic Leptospira in livestock in Cotonou, Benin. Vet. Med. Sci. 2024; 10(3):e1430. DOI: 10.1002/vms3.1430
2. Транквилевский Д.В., Киселева Е.Ю., Корзун В.М., Бренёва Н.В., Вержуцкая Ю.А., Зарва И.Д., Скударева О.Н., Балахонов С.В. Эпизоотолого-эпидемиологическая ситуация по лептоспирозам в Российской Федерации в период с 2013 по 2022 г. и прогноз на 2023 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2023; (3):43–50. DOI: 10.21055/0370-1069-2023-3-43-50.
3. Izquierdo-Rodríguez E., Fernández-Álvarez Á., MartínCarrillo N., Marchand B., Feliu C., Miquel J., Foronda P., Quilichini Y. Pathogenic Leptospira species in rodents from Corsica (France). PloS One. 2020; 15(6):e0233776. DOI: 10.1371/journal.pone.0233776.
4. Boey K., Shiokawa K., Rajeev S. Leptospira infection in rats: A literature review of global prevalence and distribution. PLoS Negl. Trop. Dis. 2019; 13(8):e0007499. DOI: 10.1371/journal. pntd.0007499.
5. Loan H.K., Van Cuong N., Takhampunya R., Kiet B.T., Campbell J., Them L.N., Bryant J.E., Tippayachai B., Van Hoang N., Morand S., Hien V.B., Carrique-Mas J.J. How important are rats as vectors of leptospirosis in the Mekong Delta of Vietnam? Vector Borne Zoonotic Dis. 2015; 15(1):56–64. DOI: 10.1089/vbz.2014.1613.
6. Vincent A.T., Schiettekatte O., Goarant C., Neela V.K., Bernet E., Thibeaux R., Ismail N., Mohd Khalid M.K.N., Amran F., Masuzawa T., Nakao R., Amara Korba A., Bourhy P., Veyrier F.J., Picardeau M. Revisiting the taxonomy and evolution of pathogenicity of the genus Leptospira through the prism of genomics. PLoS Negl. Trop. Dis. 2019; 13(5):e0007270. DOI: 10.1371/journal. pntd.0007270.
7. Баимова Р.Р., Рябико Е.Г., Останкова Ю.В., Токаревич Н.К. Оптимизация способа детекции и генотипирования патогенных лептоспир в биологических образцах. Клиническая лабораторная диагностика. 2025; 70(3):210–7. DOI: 10.51620/0869-2084-2025-70-3-210-217.
8. Киселева Е.Ю., Корзун В.М., Борисов С.А., Бренёва Н.В., Тимошенко А.Ф., Шаракшанов М.Б., Балахонов С.В. Современная эпизоотологическая ситуация по лептоспирозам в Прибайкалье. Acta Biomedica Scientifica. 2021; 6(5):57–67. DOI: 10.29413/ABS.2021-6.5.6.
9. Flores B., Sheleby-Elias J., Pérez-Sánchez T., Fischer R., Múzquiz J., Fuertes H., Halaihel N., Jirón W., Duttmann C. Leptospira spp. in Rodents from peridomestic sites in endemic regions of Nicaragua. Ecohealth. 2020; 17(4):469–76. DOI: 10.1007/s10393-021-01520-4.
10. Fischer S., Mayer-Scholl A., Imholt C., Spierling N.G., Heuser E., Schmidt S., Reil D., Rosenfeld U.M., Jacob J., Nöckler K., Ulrich R.G. Leptospira genomospecies and sequence type prevalence in small mammal populations in Germany. Vector Borne Zoonotic Dis. 2018; 18(4):188–99. DOI: 10.1089/vbz.2017.2140.
11. Vukićević-Radić O., Matic R., Kataranovski D., Stamenković S. Spatial organization and home range of Apodemus flavicollis and A. agrarius on Mt. Avala, Serbia. Acta Zoologica Academiae Scientiarum Hungaricae. 2006; 52(1):81–96.
12. Schmidt E., Obiegala A., Imholt C., Drewes S., Saathoff M., Freise J., Runge M., Jacob J., Mayer-Scholl A., Ulrich R.G., Pfeffer M. Influence of season, population and individual characteristics on the prevalence of Leptospira spp. in bank voles in NorthWest Germany. Biology (Basel). 2021; 10(9):933. DOI: 10.3390/biology10090933.
13. Chiani Y.T., Jacob P., Mayora G., Aquino D.S., Quintana R.D., Mesa L. Presence of Leptospira spp. in a mosaic of wetlands used for livestock raising under differing hydroclimatic conditions. Appl. Environ. Microbiol. 2023; 89(6):e0197122. DOI: 10.1128/aem.01971-22.
14. Shao J.W., Wei Y.H., Yao X.Y., Chen H.Y., Liu H., Sun J., Chen S.Y. Pathogenic Leptospira species are widely disseminated among wild rodents in urban areas of Guangzhou, Southern China. Microorganisms. 2022; 10(5):873. DOI: 10.3390/microorganisms10050873.
15. Cosson J.F., Picardeau M., Mielcarek M., Tatard C., Chaval Y., Suputtamongkol Y., Buchy P., Jittapalapong S., Herbreteau V., Morand S. Epidemiology of leptospira transmitted by rodents in southeast Asia. PLoS Negl. Trop. Dis. 2014; 8(6):e2902. DOI: 10.1371/journal.pntd.0002902.
16. Bulach D.M., Zuerner R.L., Wilson P., Seemann T., McGrath A., Cullen P.A., Davis J., Johnson M., Kuczek E., Alt D.P., PetersonBurch B., Coppel R.L., Rood J.I., Davies J.K., Adler B. Genome reduction in Leptospira borgpetersenii reflects limited transmission potential. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2006; 103(39):14560–5. DOI: 10.1073/pnas.0603979103.
17. Krijger I.M., Ahmed A.A.A., Goris M.G.A., Groot Koerkamp P.W.G., Meerburg B.G. Prevalence of Leptospira infection in rodents from Bangladesh. Int. J. Environ. Res. Public Health. 2019; 16(12):2113. DOI: 10.3390/ijerph16122113.
18. Ramli S.R., Bunk B., Spröer C., Geffers R., Jarek M., Bhuju S., Goris M., Mustakim S., Pessler F. Complete genome sequencing of Leptospira interrogans isolates from Malaysia reveals massive genome rearrangement but high conservation of virulenceassociated genes. Pathogens. 2021; 10(9):1198. DOI: 10.3390/pathogens10091198.
19. Obiegala A., Woll D., Karnath C., Silaghi C., Schex S., Eßbauer S., Pfeffer M. Prevalence and genotype allocation of pathogenic Leptospira species in small mammals from various habitat types in Germany. PLoS Negl. Trop. Dis. 2016; 10(3):e0004501. DOI: 10.1371/journal.pntd.0004501.
20. Xu J., Chen J., Xiong C., Qin L., Hu B., Liu M., Ren Y., Li Y., Cai K., Chen L., Hou W. Pathogenic Leptospira infections in Hubei Province, Central China. Microorganisms. 2022; 11(1):99. DOI: 10.3390/microorganisms11010099.
Рецензия
Для цитирования:
Баимова Р.Р., Рябико Е.Г., Гречишкина Д.И., Кармоков И.А., Халилов Э.С., Лызенко И.С., Лунина Г.А., Останкова Ю.В., Токаревич Н.К., Желтакова И.Р., Чмырь И.А. Выявление и генотипирование патогенных лептоспир, циркулирующих среди грызунов на территории Санкт-Петербурга. Проблемы особо опасных инфекций. 2025;(2):72-78. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2025-2-72-78
For citation:
Baimova R.R., Riabiko E.G., Grechishkina D.I., Karmokov I.A., Khalilov E.S., Lyzenko I.S., Lunina G.A., Ostankova Yu.V., Tokarevich N.K., Zheltakova I.R., Chmyr I.A. Identification and Genotyping of Pathogenic Leptospira Circulating among Rodents in the City of St. Petersburg. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2025;(2):72-78. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2025-2-72-78