Совершенствование диагностической системы в формате ОТ-ПЦР в реальном времени «Амплисенс EBOV (ZAIRE)-FL» для детекции РНК вируса Эбола Заир
Аннотация
С учетом опыта практического применения системы «Амплисенс EBOV(Zaire)-Fl» в условиях мобильной лаборатории СПЭБ проведено ее усовершенствование с целью сокращения времени проведения исследования и повышения предела аналитической чувствительности. Осуществленная модификация позволила увеличить значение аналитической чувствительности системы до уровня 200 копий в мл, что в 10 раз выше предыдущего показателя аналитической чувствительности, составлявшей 2·103 копий в 1 мл. Кроме того, удалось сократить время проведения исследования до 1 ч 25 мин, что на 25 % меньше времени, необходимого для проведения исследования по стандартной программе. Модификация диагностической системы «Амплисенс EBOV(Zaire)-Fl» будет способствовать совершенствованию надзорных мероприятий по пресечению распространения вируса Эбола Заир в Западной Африке и недопущению его завоза на территорию Российской Федерации.
Ключевые слова
Вирус Эбола Заир,
лихорадка Эбола,
ОТ-ПЦР в реальном времени,
Ebola virus Zaire,
Ebola fever,
real-time RT-PCR
Об авторах
В. Г. Дедков
Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии; Научно-исследовательский институт медицины труда РАН
Россия
Россия
М. В. Сафонова
Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии
Россия
Россия
С. А. Боднев
Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
А. С. Кабанов
Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
В. А. Сафронов
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
А. А. Лопатин
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
В. Е. Куклев
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Д. В. Уткин
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
В. В. Малеев
Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии
Россия
Россия
Г. А. Шипулин
Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии
Россия
Россия
Список литературы
1. Дедков В.Г., Сафонова М.В., Девяткин А.А., Долгова А.С., Пьянков О.В., Сергеев А.А., Агафонов А.П., Малеев В.В., Шипулин Г.А. Разработка диагностической системы в формате ОТ-ПЦР в реальном времени для выявления РНК вируса Эбола Заир. Эпидемиол. инф. бол. Акт. вопр. 2015; 2:26-32.
2. Ebola situation report. 26 August 2015. http://apps.who.int/ebola/current-situation/ebola-situation-report-26-august-2015 (дата обращения 02.09.2015).
3. Faye Ous., Bolle P., Heleze E., Faye Oum., Loucoubar Ch., Magassouba N., Soropogui B., Keita S., Gakou T., Bah I., Koivogui L., Sall A., Cauchemez S. Chains of transmission and control of Ebola virus disease in Conakry, Guinea, in 2014: an observational study. Lancet Inf. Dis. 2015; 15(3):320-6.
4. Gire K.S., Goba A., Andersen G.K. Sealfon R.S.G., Park D.J., Kanneh L., Jalloh S., Momoh M., Fullah M., Dudas G., Wohl S., Moses L.M.,Yozwiak N.L., Winnicki S., Matranga Ch.B., Malboeuf J.Q., Gladden A.D., Schaffner S.F., Jiang Y.X., Nekoui M., Colubri A., Coomber M.R., Fonnie M., Moigboi A., Gbakie M., Kamara F.K., Tucker V., Konuwa E., Saffa S., Sellu J., Jalloh A.A., Kovoma A., Koninga J., Mustapha I., Kargbo K., Foday M., Yillah M., Kanneh F., Robert W., Massally J.L., Chapman S.B., Bochicchio J., Murphy C., Nusbaum C., Young S., Birren B.W., Grant D.S., Scheiffelin J.S., Lander E.S., Happi Ch., Gevao S.M., Gnirke A., Rambaut A., Garry R.F., Humarr Khan S., Sabeti P.C. Genomic surveillance elucidates Ebola virus origin and transmission during the 2014 outbreak. Science. 2014; 345(6202):1369-72.
5. Maganga G.D., Kapetshi J., Berthet N., Kebela Ilunga B., Kabange F., Mbala Kingebeni P., Mondonge V., Muyembe J.J., Bertherat E., Briand S., Cabore J., Epelboin A., Formenty P., Kobinger G., González-Angulo L., Labouba I., Manuguerra J.C., Okwo-Bele J.M., Dye C., Leroy E.M. Ebola virus disease in the Democratic Republic of Congo. N. Engl. J. Med. 2014; 371(22):2083-91.
6. Oligonucleotide Properties Calculator. http://www.basic.northwestern.edu/biotools/OligoCalc.html (дата обращения 02.09.2015).
Для цитирования:
Дедков В.Г., Сафонова М.В., Боднев С.А., Кабанов А.С., Сафронов В.А., Лопатин А.А., Куклев В.Е., Уткин Д.В., Малеев В.В., Шипулин Г.А. Совершенствование диагностической системы в формате ОТ-ПЦР в реальном времени «Амплисенс EBOV (ZAIRE)-FL» для детекции РНК вируса Эбола Заир. Проблемы особо опасных инфекций. 2015;(3):55-57. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2015-3-55-57
For citation:
Dedkov V.G., Safonova M.V., Bodnev S.A., Kabanov A.S., Safronov V.A., Lopatin A.A., Kuklev V.E., Utkin D.V., Maleev V.V., Shipulin G.A. Improvement of Diagnostic System in a Real-Time RT-PCR “AmpliSens EBOV (ZAIRE)-FL” Format for Zaire ebolavirus RNA Detection. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2015;(3):55-57. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2015-3-55-57
Просмотров: 438
Послать статью по эл. почте 