Разработка алгоритма идентификации культур возбудителя бруцеллеза методом MALDI-TOF масс-спектрометрии


https://doi.org/10.21055/0370-1069-2015-4-96-99

Полный текст:


Аннотация

В работе приведены результаты прямого белкового профилирования коллекции штаммов бруцелл с помощью времяпролетной масс-спектрометрии с матричной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF MS). Стандартизована методика обеззараживания культур возбудителя бруцеллеза и последующего анализа при использовании MALDI-TOF MS. Получены 59 репрезентативных белковых профилей представителей шести основных видов бруцелл ( B. melitensis , B. abortus , B. suis, B. canis, B. ovis, B. neotomae ), которые включены в электронную базу данных масс-спектров в среде программы Biotyper v 3.0 (Bruker Daltonics, Германия). При анализе масс-спектров исследованных штаммов бруцелл выявлены 17 родоспецифичных фрагментов в диапазоне масс 2000-20000 Да, совокупность которых в MALDI-TOF масс-спектрах может использоваться при идентификации Brucella spp. В работе также описаны фрагменты, специфичные для отдельных видов и штаммов бруцелл, представляющие интерес в качестве маркеров для внутривидовой дифференциации возбудителя. На основании полученных данных разработан стандартизированный алгоритм идентификации и дифференциации культур возбудителя бруцеллеза методом MALDI-TOF масс-спектрометрии.

Об авторах

Д. В. Ульшина
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


Д. А. Ковалев
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


О. В. Бобрышева
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


Г. И. Лямкин
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


А. А. Худолеев
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


Ю. В. Сирица
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


А. Н. Куличенко
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


Список литературы

1. Марри Р., Греннер Д., Мейес П., Родуэлл В. Биохимия человека. М.: Мир; 1993. Т. 2. 415 с.

2. Wilkins C.L., Lay J.O. Identification of microorganisms by mass spectrometry. Wiley-Blackwell; 2006. 376 p.

3. Ferreira L., Vega S., Sanchez-Juanes F., Gonzalez M., Herrero A., Muñiz M.C., Gonzalez-Buitrago J.M., Munoz J.L. Identifying bacteria using a matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometer. Comparison with routine methods used in clinical microbiology laboratories. Enferm. Infecc. Microbiol. Clin. 2010; 28:492- 7.

4. Lista F., Reubsaet F., De Santis R., Parchen R., de Jong A., Kieboom J., van der Laaken A., Voskamp-Visser I., Fillo S., Jansen H-J., van der Plas J., Paauw A. Reliable identification at the species level of Brucella isolates with MALDI-TOF-MS. BMC Microbiology. 2011; 11:267. DOI: 10.1186/1471-2180-11-267.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Ульшина Д.В., Ковалев Д.А., Бобрышева О.В., Лямкин Г.И., Худолеев А.А., Сирица Ю.В., Куличенко А.Н. Разработка алгоритма идентификации культур возбудителя бруцеллеза методом MALDI-TOF масс-спектрометрии. Проблемы особо опасных инфекций. 2015;(4):96-99. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2015-4-96-99

For citation: Ul’Shina D.V., Kovalev D.A., Bobrysheva O.V., Lyamkin G.I., Khudoleev A.A., Siritsa Y.V., Kulichenko A.N. Development of Algorithm for Identification of Brucellosis Agent Cultures Using MALDI-TOF Mass-Spectrometry. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2015;(4):96-99. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2015-4-96-99

Просмотров: 168

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)