Опыт использования филогенетического анализа в эпидемиологическом расследовании случая заражения ВИЧ-инфекцией


https://doi.org/10.21055/0370-1069-2016-1-61-63

Полный текст:


Аннотация

Цель. Расследование криминального случая заражения ВИЧ-инфекцией с использованием молекулярно-генетического анализа образцов плазмы крови предполагаемого источника инфекции и реципиента для определения вероятности наличия эпидемиологической связи между ними. Материалы и методы. Проведены генотипирование и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей вариантов ВИЧ-1, выделенных от пациентов исследуемой группы и группы сравнения с помощью современных молекулярно-генетических методов. Построение филогенетического дерева и расчет генетической дистанции проводились путем анализа 36 образцов. Результаты и выводы. Варианты вируса, выделенные в исследуемых образцах, относятся к субтипу А ВИЧ-1. Проведенный филогенетический анализ показал, что нуклеотидные последовательности исследуемых образцов достоверно группируются на филогенетическом дереве, образуя общий кластер, отличный от образцов группы сравнения. Расчет генетической дистанции свидетельствует, что генетическая близость между образцами исследуемой группы выше, чем между образцами исследуемой группы и группы сравнения. С помощью филогенетического анализа было показано, что штаммы, полученные от предполагаемого источника инфекции и реципиента, генетически более близки друг с другом, чем со штаммами из группы сравнения. В связи с этим можно с большой долей уверенности утверждать о вероятности наличия эпидемиологической связи между ними.

Об авторах

Н. Н. Зайцева
Нижегородский научно-исследовательский институт имени академика И.Н.Блохиной
Россия


О. В. Парфенова
Нижегородский научно-исследовательский институт имени академика И.Н.Блохиной
Россия


О. Ю. Пекшева
Нижегородский научно-исследовательский институт имени академика И.Н.Блохиной
Россия


Е. И. Ефимов
Нижегородский научно-исследовательский институт имени академика И.Н.Блохиной
Россия


Л. П. Потемина
Центр-СПИД Саратовской области
Россия


Т. Л. Абрамян
Центр-СПИД Саратовской области
Россия


Список литературы

1. Нешумаев Д.А., Татьянина Е.А., Малышева М.А., Шевченко Н.М., Кокотюха Ю.А., Мейрманова Е.М., Виноградова М.Н., Уланова Т.И., Загрядская Ю.Е. Опыт совместного использования филогенетического анализа и определения давности инфицирования при расследовании внутрибольничного заражения ВИЧ-инфекцией. В кн.: Матер. VIII Всерос. конф. с междунар. участ. «Молекулярная диагностика - 2014». М.; 2014. Т. 1. С. 64-5.

2. Сандырева Т.П., Герасимова Н.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Куевда Д.А., Шипулин Г.А., Подымова А.С. Филогенетический анализ в эпидемиологических расследованиях случаев ВИЧ-инфекции. Эпидемиол. и инф. бол. 2014; 1:17-21.

3. Сандырева Т.П., Герасимова Н.А., Подымова А.С. Молекулярно-генетические методы в системе эпидемиологической диагностики ВИЧ-инфекции. В кн.: Матер. VIII Всерос. конф. с междунар. участ. «Молекулярная диагностика - 2014». М.; 2014. Т. 1. С. 41-2.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Пекшева О.Ю., Ефимов Е.И., Потемина Л.П., Абрамян Т.Л. Опыт использования филогенетического анализа в эпидемиологическом расследовании случая заражения ВИЧ-инфекцией. Проблемы особо опасных инфекций. 2016;(1):61-63. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2016-1-61-63

For citation: Zaitseva N.N., Parfenova O.V., Peksheva O.Y., Efimov E.I., Potemina L.P., Abramyan T.L. Experience in Utilization of Phylogenetic Analysis for Epidemiological Investigation of HIV Infection Case. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2016;(1):61-63. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2016-1-61-63

Просмотров: 266

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)