Сравнительный MLVA-анализ штаммов Vibrio cholerae классического биовара, выделенных в России и за рубежом
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2016-4-88-92
Аннотация
Цель работы. Определение филогенетического родства штаммов V. cholerae классического биовара, выделенных в период с 1937 по 1969 год в России, со штаммами из ближнего и дальнего зарубежья. Материалы и методы. В работе использовано 27 штаммов Vibrio cholerae классического биовара. ПЦР проводили на амплификаторе «БИС М112». Для секвенирования использовали генетический анализатор ABI 3500xl. MLVA-анализ вели по 5 MLVA-локусам (VC0147, VC0436-0437, VC1650, VCA0171, VCA0283). Питательные потребности и продукцию растворимой гемагглютинин/протеазы определяли чашечным методом. Результаты и выводы. Выявлено 8 MLVA-кластеров и 21 MLVA-тип. Установлено, что штаммы, выделенные в период атипичной вспышки холеры в России в 1942–1943 гг., фено- и генотипически неоднородны и относятся к двум различным группам, одна из которых родственна изоляту, выделенному при вспышке холеры в Хабаровске в 1938 г., а вторая – штаммам из Индии и Китая, вы- деленным в 1946 и 1949 гг. соответственно.
Об авторах
Н. Б. Челдышова
ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46
А. А. Крицкий
ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46
Ю. В. Лозовский
ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46
Н. П. Гусева
ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46
Список литературы
1. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Сучков И.Ю. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae. Биотехнология. 2001; 6:85–8.
2. Покровский В.И., редактор. Холера в СССР в период VII пандемии. М.; 2000. 472 с.
3. Смирнова Н.И., Кульшань Т.А., Краснов Я.М. MLVA- типирование клинических штаммов Vibrio cholerae, изолированных в разные периоды текущей пандемии холеры. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2015; 1:15–22. DOI: 10.3103/ S0891416815010085.
4. Смирнова Н.И., Челдышова Н.Б., Заднова С.П., Кутырев В.В. Молекулярно-генетические особенности штаммов Vibrio cholerae classica, вызвавших эпидемию азиатской холеры в России в 1942 г. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2001; 4:12–6.
5. Челдышова Н.Б., Крицкий А.А., Краснов Я.М, Смирнова Н.И. Анализ результатов фрагментарного и полногеномного секвенирования атипичных штаммов Vibrio cholerae классического биовара, вызвавших вспышку азиатской холеры в России. Эпидемиол. и инф. бол. 2015; 20(5):24–31.
6. Alam M., Islam M.T., Rashed S.M., Johura F.T., Bhuiyan N.A., Delgado G., Morales R., Mendez J.L., Navarro A., Gil A.I., Watanabe H., Morita M., Nair B., Cravioto A. Vibrio cholerae clas- sical biotype strains reveal distinct signatures in Mexico. J. Clin. Microbiol. 2012; 50 (7):2212–6. DOI:10.1128/JCM.00189-12.
7. Bakhshi B., Boustanshenas M., Mahmoudi-Аznaveh A. Emergence of Vibrio cholerae O1 classical biotype in 2012 in Iran. Lett. Appl. Microbiol. 2014; 58 (2):145–9. DOI:10.1111/lam.12167.
8. Choi S.Y., Lee J.H., Jeon Y.S., Lee H.R., Kim E.J., Ansaruzzaman M., Bhuiyan N.A., Endtz H.P., Niyogi S.K., Sarkar B.L., Nair G.B., Nguen B.M., Hien N.T., Czerkinsky C., Clemens J.D., Chun J., Kim D.W. Multilocus variable-number tandem re- peat analysis of Vibrio cholerae O1 El Tor strains harbouring clas- sical toxin B. J. Med. Microbiol. 2010; 59(7):763–9. DOI: 10.1099/ jmm.0.017939-0.
9. Dziejman M., Balon E., Boydet D., Fraser C.M., Heidelberg J.F., Mekalanos J.J. Comparative genomic analysis of Vibrio chol- erae: genes that correlate with cholera endemic and pandemic disease. Proc. Natl. Acad. Sci. 2002; 99:1556–61. DOI: 10.1073/ pnas.042667999.
10. Hase C.C., Finkelstein R.A. Cloning and nucleotide se- quence of the Vibrio cholerae hemagglutinin/protease (HA/Protease) gene and construction of an HA/Protease-negative strain. J. Bacteriol. 1991; 173:3311–17.
11. Kokashvili T, Elbakidze T, Jaiani E, Janelidze N, Kamkamidze G, Whitehouse C., Huq A., Tediashvili M. Comparative phenotypic characterization of Vibrio cholerae isolates collected from aquatic environments of Georgia. Georgian Med. News. 2013; 224:55–62.
12. Longini I.M. Jr., Yunus M., Zaman K., Siddique A.K., Sack R.B., Nizam A. Epidemic and endemic cholera trends over a 33-year period in Bangladesh. J. Infect. Dis. 2002; 186(2):246–51. DOI: 10.1086/341206.
13. Pun S.B. The first appearance of classical-like phenotype Vibrio cholerae in Nepal. N. Am. J. Med. Sci. 2014; 6(4):183–4. DOI: 10.4103/1947-2714.131248.
14. Rai K.R, Rai S.K, Bhatt D.R, Kurokuwa M, Ono K, Magar D.T. Study of medically important Vibrios in the sewage of Katmandu Valley, Nepal. Nepal Med. Coll. J. 2012; 14(3):212–5.
Рецензия
Для цитирования:
Челдышова Н.Б., Крицкий А.А., Лозовский Ю.В., Гусева Н.П. Сравнительный MLVA-анализ штаммов Vibrio cholerae классического биовара, выделенных в России и за рубежом. Проблемы особо опасных инфекций. 2016;(4):88-92. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2016-4-88-92
For citation:
Cheldyshova N.B., Kritsky A.A., Lozovsky Yu.V., Guseva N.P. Comparative MLVA-Analysis of Vibrio cholerae Strains of Classical Biovar, Isolated in the Russian Federation and Abroad. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2016;(4):88-92. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2016-4-88-92
Просмотров: 676
Послать статью по эл. почте 