Preview

Проблемы особо опасных инфекций

Расширенный поиск

Внутривидовая дифференциация и определение очаговой принадлежности штаммов чумного микроба методом вычитающего рестрикционного фингерпринтинга

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2010-4(106)-28-31

Полный текст:

Аннотация

Проведено генетическое типирование штаммов чумного микроба методом вычитающего рестрикционного фингерпринтинга (ВРФ). Показана возможность внутривидовой дифференциации и определения очаговой принадлежности изученных штаммов чумного микроба. В некоторых очагах циркулируют штаммы с разными ВРФ профилями, что предполагает возможность использования данного метода генетического типирования при расследовании локальных вспышек.

Об авторах

А. В. Гаева
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


Е. Г. Булгакова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


М. Н. Киреев
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


Л. В. Анисимова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


Л. А. Новичкова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


В. В. Кутырев
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


Список литературы

1. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир; 1984. 479 с.

2. Guiyoule A., Grimont F., Iteman I., Grimont P. A., Lefevre M., Carniel E. Plague pandemics investigated by ribotyping of Yersinia pestis strains. J. Clin Microbiol. 1994; 32:634-41.

3. Huang X-Z., Chu M., Engelthaler D., Lindler L. Genotyping of a homogeneous group of Yersinia pestis strains isolated in the United States. J. Clin. Micobiol. 2002; 40(4):1164-73.

4. Kingston J., Tuteja U., Kapil M., Murali H. S., Batra H. V. Genotyping of Indian Yersinia pestis strains by MLVA and repetitive DNA sequence based PCRs. Antonie van Leeuwenhoek. 2009; DOI 10.1007/s10482-009-9347-2.

5. Li Y., Dai E., Cui Y., Li M., Zhang Y., Wu M. et al. Different region analysis for genotyping Yersinia pestis isolates from China. PLoS ONE. 2008; 3(5):e2166.

6. Michael G., Cardoso M., Rabsch W., Schwarz S. Phenotypic and genotypic differentiation of porcine Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby isolates. J. Vet. Microbiol. 2006; 118:312-8.

7. Michael G., Cardoso M., Schwarz S. Molecular analysis of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona isolated from slaughter pigs. J. Vet. Microbiol. 2006;112:43-52.

8. Pourcel C., Andre-Mazeaud F., Neubauer H., Ramisse F., Vergnaud G. Tandem repeats analysis for the high resolution phylogenetic analysis of Yersinia pestis. BMC Microbiol. 2004; 4:22.

9. Revazishvili T., Rajanna C., Bacanidze L., Tsertsvadze N., Imnadze P., O` Connell K. Characterization of Yersinia pestis isolates from natural foci of plague in the Republic of Georgia and their relationship to Y. pestis isolates from other countries. J. Clin. Microbiol. Infect. 2008; 14(5):429-36.

10. San Millán R., Garaizar J., Bikandi J. In silico simulation of fingerprinting techniques based on double endonuclease digestion of genomic DNA. In Silico Biology. 2005; 5(3):341-6.

11. Terletski V., Michael G.B., Schwartz S. Subtracted restriction fingerprinting - a new typing technique using magnetic capture of tagged restriction fragments. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2004; 41:1-8.

12. Terletski V., Schwartz S., Carnwath J. Subtracted restriction fingerprinting - a tool for bacterial genome typing. BioTechniques. 2003; 34:304-13.

13. Terletski V., Schwarz S., Carnwath J., Niemann H. Typing of Salmonella enterica subsp. enterica serovars Choleraesuis, Typhimurium, Dublin and laboratory strains of Escherichia coli using subtracted restriction fingerprinting (SRF) Microbiol. Res. 2003; 158:135-42.


Для цитирования:


Гаева А.В., Булгакова Е.Г., Киреев М.Н., Анисимова Л.В., Новичкова Л.А., Кутырев В.В. Внутривидовая дифференциация и определение очаговой принадлежности штаммов чумного микроба методом вычитающего рестрикционного фингерпринтинга. Проблемы особо опасных инфекций. 2010;(4(106)):28-31. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2010-4(106)-28-31

For citation:


Gaeva A.V., Bulgakova E.G., Kireev M.N., Anisimova L.V., Novichkova L.A., Kutyrev V.V. Intra-Species Differentiation and Determination of the Focal Belonging of Plague Microbe Strains Using Subtracted Restriction Fingerprinting. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2010;(4(106)):28-31. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2010-4(106)-28-31

Просмотров: 45


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)