Анализ генетической изменчивости штаммов Yersinia pestis средневекового биовара из природных очагов чумы Российской Федерации и Монголии
Аннотация
Проведен анализ генетических особенностей штаммов Yersinia pestis основного подвида, выделенных в природных очагах Российской Федерации и Монголии. Установлено, что в 7 из 9 очагов сусликового и песчаночьего типа циркулируют штаммы средневекового биовара, имеющие типичный генотип glpD1 napA2 rhaS1 . В Забайкальском степном очаге распространены штаммы античного биовара с генотипом glpD1 napA1 rhaS1. Аналогичный генотип имеют штаммы Y. pestis из Тувинского горного очага чумы, что коррелирует с наличием денитрифицирующей активности и отсутствием у них маркерной мутации средневекового биовара – замены единичного нуклеотида G→Т в позиции 613 гена napA и свидетельствует о принадлежности штаммов из этого очага к античному биовару. Среди штаммов Y. pestis , выделенных в Монголии, выявлены два атипичных штамма, не редуцирующие нитраты, но относящиеся к античному биовару.
Ключевые слова
возбудитель чумы,
средневековый биовар,
генотипы штаммов,
plague agent,
medieval biovar,
strain genotypes
Об авторах
А. И. Павлова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Г. А. Ерошенко
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Г. Н. Одиноков
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Л. М. Куклева
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Н. Ю. Шавина
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Я. М. Краснов
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
В. В. Кутырев
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Список литературы
1. Ерошенко Г.А., Одиноков Г.Н., Куклева Л.М., Павлова А.И., Краснов Я.М., Шавина Н.Ю. и др. Стандартный алгоритм молекулярного типирования штаммов Yersinia pestis. Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 2012; 3:25–35.
2. Куклева Л.М., Ерошенко Г.А., Куклев В.Е., Краснов Я.М., Гусева Н.П., Одиноков Г.Н., Кутырев В.В. Сравнение полной нуклеотидной последовательности гена rhaS у штаммов возбудителя чумы основного и неосновных подвидов. Пробл. особо опасных инф. 2008; 3(97):38–42.
3. Онищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. Лабораторная диагностика опасных инфекционных болезней. Практическое руководство. М: Медицина; 2009. 470 с.
4. Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I–IV групп патогенности: МУ 1.3.2569-09. М.; 2009. 42 с.
5. Одиноков Г.Н., Ерошенко Г.А., Видяева Н.А., Краснов Я.М., Гусева Н.П., Кутырев В.В. Структурно-функциональный анализ генов nap оперона у штаммов Yersinia pestis разных подвидов. Пробл. особо опасных инф. 2008; 4(98):40–2.
6. Онищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. Природные очаги чумы Кавказа, Прикаспия, Средней Азии и Сибири. М.: Медицина; 2004. 192 с.
7. Попов Н.В., Безсмертный В.Е., Матросов А.Н., Немченко Л.С., Вержуцкий Д.Б., Малецкая О.В. и др. Эпизоотическая активность природных очагов чумы Российской Федерации в 2010 г. и прогноз на 2011 г. Пробл. особо опасных инф. 2011; 1(107):31–7.
8. Deng W., Burland V., Plunkett G. et al. Genome sequence of Yersinia pestis KIM. J. Bacteriol. 2002; 184:4601–11
9. Motin V.L., Georgescu A.M., Elliot J.M. et al. Genetic variability of Yersinia pestis isolates as predicted by IS100 genotyping and analysis of structural genes encoding glycerol-3-phosphate dehydrogenase (glpD). J. Bacteriol. 2002; 184:1019–27.
10. Zhou D., Han Y., Song Y. et al. DNA microarray analysis of genome dynamics in Yersinia pestis: insights into bacterial genome microevolution and niche adaptation. J. Bacteriol. 2004; 186:5138–46.
Для цитирования:
Павлова А.И., Ерошенко Г.А., Одиноков Г.Н., Куклева Л.М., Шавина Н.Ю., Краснов Я.М., Кутырев В.В. Анализ генетической изменчивости штаммов Yersinia pestis средневекового биовара из природных очагов чумы Российской Федерации и Монголии. Проблемы особо опасных инфекций. 2012;(4(114)):49-53. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2012-4-49-53
For citation:
Pavlova A.I., Eroshenko G.A., Odinokov G.N., Koukleva L.M., Shavina N.Yu., Krasnov Y.M., Kutyrev V.V. Analysis of Genetic Variability of Yersinia pestis Strains (Medieval Biovar) Isolated in Natural Plague Foci of the Russian Federation and Mongolia. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2012;(4(114)):49-53. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2012-4-49-53
Просмотров: 90
Послать статью по эл. почте 