Preview

Проблемы особо опасных инфекций

Расширенный поиск

Характеристика бактериальной микрофлоры, выделенной из проб мокроты больных пневмонией в Хабаровске и Хабаровском крае в начальный период пандемии COVID-19 (май–июнь 2020 г.)

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-43-49

Полный текст:

Аннотация

Цель исследования: изучить бактериальную микрофлору в мокроте больных пневмонией, вызванной SARS-CoV-2 или другими возбудителями.

Материалы и методы. Исследовали бактериальную микрофлору мокроты 173 больных пневмонией, госпитализированных в лечебные учреждения г. Хабаровска и   Хабаровского края в мае–июне 2020 г. Бактериологический анализ мокроты проводили с использованием дифференциально-диагностических сред, идентификацию выделенных патогенов – с помощью микробиологического анализатора Vitec 2 Compact. Выявление РНК вируса SARS-CoV-2 проводили методом ПЦР с тест-системой «Вектор-ПЦР РВ - 2019-nCoV-RG» (производство ФБУН «ГНЦ ВБ «Вектор», р.п. К ольцово). Определение ДНК  возбудителей микоплазмоза и хламидиоза проводили с тест-системой «АмплиСенс® Mycoplasma pneumoniae/Chlamydophila pneumonia» (производство ФБУН ЦНИИЭ ). Статистическую обработку данных выполняли с использованием программы Exсel.

Результаты и обсуждение. Обе группы больных (Covid-19+ и Covid-19–) характеризуются высоким уровнем выделения бактериальной флоры (81,4 и 74,7 %), в том числе обычных возбудителей внебольничных пневмоний, существенной частотой выделения грибов рода Candida и микробных ассоциаций. Группа больных Covid-19+ характеризуется более широким спектром возбудителей, выявлением полирезистентных грамотрицательных энтеробактерий, грамотрицательных неферментирующих полирезистентных бактерий, более выраженным проявлением микробных ассоциаций. В группе наблюдения Covid-19– лекарственно устойчивая флора представлена в основном стафилококками групп MRSA, MRSE. 

Об авторах

А. П. Бондаренко
ФБУН «Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии»
Россия

Российская Федерация, 680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2



В. А. Шмыленко
ФБУН «Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии»
Россия
Российская Федерация, 680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2


О. Е. Троценко
ФБУН «Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии»
Россия
Российская Федерация, 680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2


В. О. Котова
ФБУН «Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии»
Россия
Российская Федерация, 680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2


Л. В. Бутакова
ФБУН «Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии»
Россия
Российская Федерация, 680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2


Е. А. Базыкина
ФБУН «Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии»
Россия
Российская Федерация, 680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2


Список литературы

1. Чучалин А.Г., Синопальников А.И., Козлов Р.С., Тюрин И.Е., Рачина С.А. Внебольничная пневмония у взрослых: практические рекомендации по диагностике, лечению и профилактике: пособие для врачей. М.; 2010. 106 с.

2. Баязитова Л.Т., Тюпкина О.Ф., Чазова Т.А., Тюрин Ю.А., Исаева Г.Ш., Зарипова А.З., Патяшина М.А., Авдонина Л.Г., Юзлибаева Л.Р. Внебольничные пневмонии пневмококковой этиологии и микробиологические аспекты назофарингеального носительства Streptococcus pneumoniae в Республике Татарстан. Инфекция и иммунитет. 2017; 7(3):271–8.

3. Brun-Busson Ch. Des germes si ordinaires. Le recherché. 1994; 25:706–9.

4. Головерова Ю.А., Марьин Г.Г., Шабалина С.В., Тутельян А.В., Орлова О.А., Акимкин В.Г. Уровень заболеваемости инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, в отделениях высокого эпидемиологического риска инфицирования. Инфекционные болезни. 2019; 17(3):69–73.

5. Орлова О.А., Акимкин В.Г. Организация эпидемиологической диагностики вентилятор-ассоциированных инфекций дыхательных путей. Медицинский алфавит. 2017; 3(30):15–9.

6. Брико Н.И., Брусина Е.Б., Зуева Л.П., Ковалишена О.В., Ряпис Л.А., Стасенко В.Л., Фельдблюм И.В., Шкарин В.В. Госпитальный штамм – непознанная реальность. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2013; 1(68):30–5.

7. Брусина Е.Б. Эпидемиология инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, вызванных возбудителями группы сапронозов. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2015; 14(2):50–6.

8. Kreitmann L., Monard C., Dauwalder O., Simon M., Argaud L. Early bacterial co-infection in ARDS related to COVID-19. Intensive Care Med. 2020; 46(9):1787-9. DOI: 10.1007/s00134-020-06165-5.

9. Cucchiari D., Pericàs J.M., Riera J., Gumucio R., Coloma E., Nicolás D. Pneumococcal superinfection in COVID-19 patients: A series of 5 cases. Med. Clin. (Barc). 2020 Jun 5; S0025-7753(20)30349-3. DOI: 10.1016/j.medcli.2020.05.022.

10. Chaudhary W.A., Chong P.L., Mani B.I., Asli R., Momin R.N., Abdullah M.S., Chong V.H. Primary respiratory bacterial coinfections in patients with COVID-19. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2020; 103(2):917–9. DOI: 10.4269/ajtmh.20-0498.

11. Hughes S., Troise O., Donaldson H., Mughal N., Moore L.S. Bacterial and fungal coinfection among hospitalised patients with COVID-19: a retrospective cohort study in a UK secondary care setting. Clin. Microbiol. Infect. 2020; 26(10):1395–9. DOI: 10.1016/j.cmi.2020.06.025.

12. Слепакова С.А. Возбудители кандида-инфекций в отделениях реанимации и интенсивной терапии. Инфекция и иммунитет. 2012; 2(1–2):495.

13. Петрухина М.И., Мартынова А.М., Политова Н.Г., Старостина Н.В., Каира А.Н. Результаты микробиологического мониторинга циркуляции грибов рода Candida в детском и взрослом многопрофильных стационарах. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2018; 1(98):33–9.

14. Lansbury L., Lim B., Baskaran V., Lim W.S. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J. Infect. 2020; 81(2):266–75. DOI: 10.1016/j.jinf.2020.05.

15. Teng F., Liu X., Guo S.-b., Li Z., Ji W.-Q., Zhang F., Zhu X. Community-acquired bacterial co-infection predicts severity and mortality in influenza-associated pneumonia admitted patients. J. Infect. Chemother. 2019; 25(2):129–36. DOI: 10.1016/j.jiac.2018.10.014.

16. Борисова О.Ю., Алешкин В.А., Пименова А.С., Крюков А.И., Кунельская Н.Л., Гуров А.В., Шадрин Г.Б., Товмасян А.С., Ефимов Б.А., Кафарская Л.И. Микробный состав микрофлоры ротоглотки у больных с тонзиллярной патологией. Инфекция и иммунитет. 2015; 5(3):225–32.

17. Демиховская Е.В. Беседы с микробиологом. Болезни и антибиотики. 2011; 2(05):13–9.

18. Демиховская Е.В. Ванкомицин-резистентные энтерококки как возбудители внутрибольничных инфекций. Болезни и антибиотики. 2013; 1(8):68–71.

19. Симонова Е.В. Значение микробных ассоциантов в развитии госпитальных инфекций. Инфекция и иммунитет. 2012; 2(1–2):495.

20. Чезганова Е.А., Ефимова О.С., Созинов С.А., Ефимова А.Р., Сахарова В.М., Кутихин А.Г., Основа М.В., Исмагилов З.Р., Брусина Е.Б. Больничная пыль как потенциальный резервуар госпитальных штаммов. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2019; 19(4):82–92.

21. Sêkowska A., Bogiel T., Woźniak M., Gospodarek-Komkowska E. Raoultella spp. – reliable identification, susceptibility to antimicrobials and antibiotic resistance mechanisms. J. Med. Microbiol. 2020; 69(2):233–8. DOI: 10.1099/jmm.0.001150.


Для цитирования:


Бондаренко А.П., Шмыленко В.А., Троценко О.Е., Котова В.О., Бутакова Л.В., Базыкина Е.А. Характеристика бактериальной микрофлоры, выделенной из проб мокроты больных пневмонией в Хабаровске и Хабаровском крае в начальный период пандемии COVID-19 (май–июнь 2020 г.). Проблемы особо опасных инфекций. 2020;(3):43-49. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-43-49

For citation:


Bondarenko A.P., Shmylenko V.A., Trotsenko O.E., Kotova V.O., Butakova L.V., Bazykina E.A. Characteristics of Bacterial Microflora Isolated from Sputum of Patients with Pneumonia Registered in Khabarovsk City and Khabarovsk Territory in the Initial Period of COVID-19 Pandemic in May–June, 2020. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2020;(3):43-49. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-43-49

Просмотров: 45


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)