Опыт использования геномного анализа в условиях мобильного комплекса СПЭБ
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2014-2-113-114
Аннотация
В работе описан первый опыт использования геномного анализа в условиях мобильного комплекса СПЭБ во время проведения XXVII Всемирной летней Универсиады-2013 в Казани. В результате было проведено 16S рРНК секвенирование штамма Salmonella enterica , выделенного от больного. Для этого использовали набор «MicroSEQ 500 16S rDNA Bacterial Identification Kits» (Applied Biosystems, США), позволяющий секвенировать фрагменты ДНК (500 пар нуклеотидов) гена 16S рРНК исследуемых бактерий.
Ключевые слова
мобильный комплекс СПЭБ,
геномный анализ,
сальмонеллы,
SAET mobile complex,
genome analysis,
Salmonella
Об авторах
Е. В. Найденова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
С. А. Портенко
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Е. С. Казакова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
И. Г. Карнаухов
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
А. В. Черкасов
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
С. А. Щербакова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
В. В. Кутырев
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Список литературы
1. Baddam R., Thong K.L., Avasthi T.S., Shaik S., Yap K.P., Teh C.S., Chai L.C., Kumar N., Ahmed N. Whole-genome sequences and comparative genomics of Salmonella enterica serovar Typhi isolates from patients with fatal and nonfatal typhoid fever in Papua New Guinea. J. Bacteriol. 2012; 194:5122-3.
2. Guibourdenche M., Roggentin P., Mikoleit M., Fields P.I., Bockemühl J., Grimont P.A.D., Weill F.-X. Supplement 2003-2007 (No. 47) to the White-Kauffmann-Le Minor scheme. Res. Microbiol. 2010; 161:26-9.
3. Hellberg R.S., Haney C.J., Shen Y., Cheng C.M., Williams-Hill D.M., Martin W.B. Development of a custom 16S rRNA gene library for the identification and molecular subtyping of Salmonella enterica. J. Microbiol. Methods. 2012; 91(3):448-58.
4. Hendriksen R.S. A global Salmonella surveillance and laboratory support project of the World Health Organization. 4th Ed. April 2003.
Рецензия
Для цитирования:
Найденова Е.В., Портенко С.А., Казакова Е.С., Карнаухов И.Г., Черкасов А.В., Щербакова С.А., Кутырев В.В. Опыт использования геномного анализа в условиях мобильного комплекса СПЭБ. Проблемы особо опасных инфекций. 2014;(2):113-114. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2014-2-113-114
For citation:
Naidenova E.V., Portenko S.A., Kazakova E.S., Karnaukhov I.G., Cherkasov A.V., Shcherbakova S.A., Kutyrev V.V. Experience in Genome Analysis Use in SAET Mobile Complex Facilities. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2014;(2):113-114. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2014-2-113-114
Просмотров:
583
Послать статью по эл. почте 