Цель обзора – описать особенности эпидемиологической ситуации по клещевому вирусному энцефалиту (КВЭ) в Российской Федерации за 2016–2025 гг. и дать прогноз заболеваемости на 2026 г. для федеральных округов и субъектов наибольшего эпидемиологического риска. За 2016–2025 гг. число лиц, пострадавших от клещей, в среднем по РФ составляет 498 575,1. В 2020–2021 гг. в некоторых субъектах Приволжского, Северо-Западного и других федеральных округов сформировался тренд к росту показателя. Потепление климата сдвинуло начало активности клещей с первой недели апреля на последнюю неделю марта. Наблюдается удлинение эпидемического сезона. В 2025 г. выявлено 1807 больных КВЭ, показатель заболеваемости – 1,24 ⁰ /₀₀₀₀ (при среднемноголетнем – 1,17 ⁰ /₀₀₀₀). Пять субъектов с наибольшей инцидентностью: Кировская область, Красноярский край, республики Тыва и Хакасия, Пермский край. Зарегистрировано 44 летальных исхода (летальность – 2,4 %). По данным 2016– 2025 гг. выделено 17 субъектов наибольшего эпидемиологического риска, восемь из них в составе Сибирского федерального округа. Вирусофорность клещей (исследована методами ПЦР и ИФА) в среднем по РФ за 2025 г. не отличается от среднемноголетней. Сравнение генетической структуры выборок штаммов вируса клещевого энцефалита за 1937–1989 гг. и 1990–2025 гг. показало рост доли сибирского субтипа с 54,8 до 89,7 % при сохранении соотношения отдельных генетических линий внутри сибирского субтипа. Объемы мер специфической и неспецифической профилактики КВЭ в 2025 г. выросли по отношению к 2024 г. и во всех федеральных округах соответствуют плановым показателям. По прогнозу, инцидентность КВЭ составит в РФ в 2026 г. 1,14 ⁰ /₀₀₀₀ с доверительным интервалом от 0,95 до 1,32 ⁰ /₀₀₀₀. Увеличение заболеваемости возможно в Приволжском и Дальневосточном федеральных округах, а в остальных эпидемиологическая ситуация не изменится.

Представлен обзор эпидемиологической обстановки по иксодовым клещевым боррелиозам (ИКБ) в мире и Российской Федерации в 2025 г. в сравнении с многолетними данными, дан прогноз на 2026 г. В 2025 г. в РФ зарегистрировано максимальное число случаев ИКБ (9698) за последние 15 лет. Относительно среднемноголетних значений показатели заболеваемости ИКБ выросли в четырех федеральных округах: Центральном (ЦФО), Приволжском, Южном (ЮФО) и Северо-Кавказском (СКФО); значительно увеличился удельный вес ЦФО в общей структуре заболеваемости ИКБ (55,43 %); увеличилось до 84 число субъектов с регистрируемой заболеваемостью ИКБ, в половине из них отмечен рост инцидентности. На протяжении периода 2013–2025 гг. сохраняются особенности тенденций эпидемического процесса ИКБ на территориях различной степени эпидемиологического риска. В большинстве субъектов со среднемноголетним показателем заболеваемости (СМП) на 100 тыс. населения выше 8,4 ⁰ /₀₀₀₀ выявлена тенденция к снижению или относительная стабильность заболеваемости ИКБ, кроме г. Москвы и Калужской области, где отмечен выраженный тренд к росту. В 10 из 19 регионов с СМП от 4,2 до 8,3 ⁰ /₀₀₀₀ отмечена тенденция к росту, а в 8 – к снижению заболеваемости. Тренд к росту заболеваемости ИКБ выявлен в 14 из 24 субъектов с СМП от 1,6 до 4,1 ⁰ /₀₀₀₀ и в 19 из 29 регионов с низким СМП (до 1,5 ⁰ /₀₀₀₀). Проведенный анализ тенденций развития эпидемического процесса и расчеты вероятного уровня заболеваемости позволяют заключить, что для большинства федеральных округов уровень заболеваемости ИКБ в 2026 г. будет варьировать около доверительных интервалов среднемноголетних значений, за исключением ЦФО, ЮФО и СКФО, где возможен рост числа случаев ИКБ. Эффективный контроль эпидемической ситуации по ИКБ возможен при условии сохранения и совершенствования, а для таких регионов, как г. Москва, г. Санкт-Петербург, Московская, Воронежская, Липецкая, Нижегородская, Костромская, Рязанская, Тульская, Калужская, Брянская, Кировская, Курская, Орловская, Тверская, Тюменская, Пензенская и Иркутская области, Алтайский и Забайкальский края, республики Бурятия и Мордовия, субъекты ЮФО и СКФО, – увеличения объемов и повышения качества профилактических мероприятий, включая гигиеническое воспитание и обучение населения, усиление зоологоэнтомологического мониторинга активности и структуры природных очагов.

Приведены результаты анализа эпидемиологической обстановки по сибирской язве в 2025 г. в мире, представлены динамика заболевания сибирской язвой в период 2016–2025 гг. и прогноз заболеваемости на 2026 г. в Российской Федерации. В 2025 г. в России зарегистрирована одна вспышка сибирской язвы в Нижегородской области Приволжского федерального округа с заболеванием семи голов мелкого рогатого скота, инфицирования людей не последовало. За последнее десятилетие (2016–2025 гг.) в сравнении с предыдущим (2006–2015 гг.) количество учтенных вспышек сибиреязвенной инфекции сократилось в 2,7 раза, число заболевших людей снизилось в 1,1 раза, а больных сельскохозяйственных животных увеличилось в 11,9 раза – за счет эпизоотии в ЯмалоНенецком автономном округе Уральского федерального округа. Неблагополучная обстановка по сибирской язве отмечалась в четырех государствах ближнего зарубежья: в Казахстане, Кыргызстане, Таджикистане и Грузии. Наиболее напряженная эпизоотолого-эпидемиологическая ситуация зафиксирована в странах Азии и Африки с масштабными эпизоотиями среди диких животных в африканских национальных парках. Случаи заражения людей обусловлены контактом с больными животными при проведении вынужденного убоя, обработкой и приемом в пищу контаминированного мяса. Уровень заболеваемости животных и людей сибирской язвой в Российской Федерации в 2026 г. будет определен полнотой выполнения комплекса профилактических мероприятий и при максимальной реализации ограничится единичными случаями. Сохраняется потенциальный риск осложнения эпидемиологической обстановки, обусловленный возможностью завоза в Россию больных животных, животноводческой продукции из неблагополучных по сибирской язве стран, в первую очередь из Центральной Азии, в приграничные субъекты Российской Федерации.

Цель обзора – описать эпидемиологическую ситуацию (ЭС) по геморрагической лихорадке с почечным синдромом (ГЛПС) в мире, провести сравнительный анализ ЭС по ГЛПС за 2000–2025 гг. в субъектах и федеральных округах Российской Федерации и дать прогноз заболеваемости на 2026 г. ГЛПС остается широко распространенным заболеванием в странах Западно-Тихоокеанского региона, Юго-Восточной Азии и Европы. В Российской Федерации основное количество заболевших ГЛПС регистрируется в Приволжском федеральном округе (ПФО), на долю которого приходится более 80 % всех случаев. В 2025 г. в Российской Федерации выявлено 4912 больных ГЛПС, что на 31 % выше, чем в предшествовавшем году (3396). Показатель заболеваемости (3,36 на 100 тыс. населения) ниже среднемноголетнего уровня за период 2013–2024 гг., без учета 2020, 2021 гг. (5,06). Зарегистрировано 12 летальных исходов (летальность – 0,24 %, смертность – 0,01 на 100 тыс. населения). Наиболее активно эпидемический процесс протекал на территории 11 субъектов ПФО: Республика Башкортостан, Удмуртская Республика, Кировская, Самарская, Пензенская, Нижегородская, Оренбургская, Ульяновская области, республики Марий Эл, Мордовия, Татарстан. В обзоре представлены результаты эпизоотологического мониторинга. С целью прогнозирования и дифференциации территорий по уровню заболеваемости проведено эпидемиологическое районирование субъектов РФ по величине показателя потенциальной эпидемической опасности на 2026 г. Выделены 6 групп территорий: с крайне высоким прогностическим риском, высоким, выше среднего, средним, низким и минимальным. К группе территорий с крайне высоким прогностическим риском заражения ГЛПС отнесены 6 субъектов: республики Башкортостан, Мордовия, Татарстан, Удмуртская, Чувашская республики, Ярославская область.

Цель работы – организация лабораторной диагностики сибирской язвы с использованием мобильной лаборатории, в том числе для верификации клинического диагноза «сибирская язва» в Республике Таджикистан.
Материалы и методы. Исследовано 17 проб клинического материала, 1 проба мяса крупного рогатого скота (КРС) с применением молекулярно-генетических (ПЦР, секвенирование) и бактериологического методов. Чувствительность выделенных культур Bacillus anthracis к антибактериальным препаратам определяли дискодиффузионным методом.
Результаты и обсуждение. Сложная эпидемиологическая и эпизоотологическая ситуация по сибирской язве в Республике Таджикистан обусловливает необходимость совершенствования эпидемиологического надзора за этой болезнью. До настоящего времени постановка диагноза «сибирская язва» в республике основывается на клинической картине, без обязательного лабораторного подтверждения. В 2024–2025 гг. при консультативно-практической поддержке российских специалистов диагностические исследования биологического материала на наличие возбудителя сибирской язвы были организованы в мобильных лабораториях, развернутых на базе медицинских учреждений. В 2024 г. при исследовании 5 проб клинического материала от больных, получающих лечение антибактериальными препаратами, ДНК B. anthracis не обнаружена, культура сибиреязвенного микроба не выделена. В 2025 г. при исследовании 12 проб, отобранных до начала лечения от 7 пациентов, и 1 пробы мяса КРС из очага инфекции во всех случаях обнаружена ДНК B. anthracis. Из проб клинического материала и мяса выделены и идентифицированы культуры возбудителя сибирской язвы, определены их чувствительность к антибактериальным препаратам и принадлежность к филогенетической группе A.Br.047. Полученные результаты позволили подтвердить клинический диагноз «сибирская язва», назначить адекватную этиотропную терапию, оперативно провести противоэпидемические мероприятия. Продемонстрирована эффективность использования мобильных лабораторий для оперативной диагностики сибирской язвы, особенно в условиях ограниченной инфраструктуры, удаленности территорий, дефицита специализированных стационарных лабораторий.

Цель работы – изучение фенотипических и генетических свойств Escherichia marmotae и филогенетических взаимоотношений с ранее описанными штаммами данного вида.
Материалы и методы. Культуры микроорганизмов выращивали на агаре LB при 37 °С. Определяли биохимическую (API 20 E), каталазную, оксидазную и гемолитическую активность. Оценку чувствительности к антимикробным препаратам проводили дискодиффузионным методом. Подтверждение видовой идентификации осуществляли методом MALDI-TOF MS. На платформе MGI выполняли полногеномное секвенирование и последующий SNP-анализ.
Результаты и обсуждение. Исследуемый штамм имеет следующие характеристики: грамотрицательные короткие слабоподвижные палочки; на среде Эндо формирует мелкие, ярко-малиновые с металлическим блеском колонии, на кровяном агаре – γ-гемолиз; оксидазоотрицательный, каталазоположительный. В геноме присутствует ряд важных маркеров, определяющих патогенность: сидерофоры, фактор вирулентности virK, фимбрии I типа, yad-фимбрии, амилоидные белки curli, гены системы секреции 3-го типа. Выявлена фенотипическая резистентность к цефиксиму, имипенему, гентамицину, тобрамицину, амикацину. Генетически штамм наиболее близок к изоляту, выделенному в Китае в 2012 г., и не имеет близкого родства со штаммами, выделенными на территории РФ в 2021 г. Филогеномный анализ штаммов E. marmotae показал дисперсную структуру изолятов различного происхождения, без четких закономерностей относительно географического происхождения или принадлежности к определенным видам животных. Таким образом, штаммы вида E. marmotae являются практически неотличимыми по фенотипическим признакам от Escherichia coli. Надежная идентификация штаммов E. marmotae возможна с помощью MALDI-TOF MS, секвенирования 16S рРНК или полного генома.

В 2024 г. на территории Иркутской области зарегистрированы и этиологически расшифрованы два случая завоза из Таиланда внебольничных пневмоний (ВБП), в том числе впервые установленного в Российской Федерации острого мелиоидоза, который завершился летальным исходом. Во втором случае от больного ВБП выделена культура Acinetobacter radioresistens.
Цель работы – индикация и видовая идентификация возбудителей внебольничных пневмоний в биологическом материале от больных, прибывших из Таиланда в Иркутскую область.
Материалы и методы. Изучены культура микроорганизма, выделенная из аутоптата печени пациентки, предварительно идентифицированная методом масс-спектрометрии как возбудитель рода Burkholderia, клинический материал (кровь, мазок из зева, мокрота, моча) от больного с подозрением на мелиоидоз. Исследования проведены бактериологическим, бактериоскопическим, молекулярно-генетическим, протеометрическим, серологическими методами лабораторной диагностики.
Результаты и обсуждение. В первом завозном случае от больной с посмертным клиническим диагнозом внебольничной двухсторонней пневмонии выделена культура Burkholderia pseudomallei, экспресс-индикация возбудителя мелиоидоза проведена методами MALDI-TOF MS и ПЦР. С целью углубленной идентификации выделенная культура изучена спектром методов лабораторной диагностики мелиоидоза. Определена чувствительность выделенного штамма к антибактериальным препаратам. Во втором завозном случае ВБП в клиническом материале больного возбудитель мелиоидоза и его ДНК не обнаружены. Из пробы мочи больного выделена культура, идентифицированная методом масс-спектрометрии как Acinetobacter radioresistens. В связи с ростом числа завозных случаев экзотических для РФ инфекций, в том числе мелиоидоза, с целью установления этиологического диагноза, коррекции лечения необходимо повышать настороженность медицинского персонала, включать мелиоидоз в дифференциальную диагностику ВБП у лиц с «анамнезом путешественника», поддерживать готовность специализированных лабораторий, усилить информационно-разъяснительную работу среди лиц, выезжающих в эндемичные регионы, а также обеспечить эффективное межведомственное взаимодействие в рамках санитарной охраны территории России.

Обнаружение эпизоотии чумы в природном очаге – событие, близкое к случайному. Дифференциация территории природных очагов чумы по вероятности регистрации эпизоотий значительно повышает шанс ее обнаружения.
Цель работы – на примере Прикаспийского песчаного природного очага чумы (южная часть) рассчитать нормированный индекс эпизоотичности (ИЭ), дифференцировать обследованные сектора по вероятности регистрации эпизоотий, дать предложения по совершенствованию эпизоотологического обследования.
Материалы и методы. Обработана информация по 335 секторам, в основном с 1981 по 2024 г. Рассчитан традиционный ИЭ и нормированный, корректирующий искажения от эффекта предвзятости обнаружения.
Результаты и обсуждение. Подтвержден эффект предвзятости обнаружения при обследовании очаговой территории. Нормированный ИЭ в сравнении со стандартным показал увеличение малоэпизоотичных (низкий индекс нормированного ИЭ) секторов почти в полтора раза. Предложен математически обоснованный критерий выделения малоперспективных для поиска эпизоотий секторов (порог вероятности – 0,95), что позволяет перераспределить усилия с них на недостаточно обследованные сектора или с высоким нормированным ИЭ. Этот подход повышает эффективность эпизоотологического мониторинга, оптимизирует использование ресурсов и уточняет границы очага чумы.

Цель исследования – разработка и апробация технологии пространственного анализа эпидемиологического риска заражения инфекциями, передающимися клещами, на основе геокодированных данных экстренных извещений.
Материалы и методы. Проведен ретроспективный пространственный анализ сплошной выборки экстренных извещений по Иркутской области за 2023–2024 гг. о случаях присасывания клещей (n=21 585) и заболевания клещевым вирусным энцефалитом (n=171). Геокодирование мест жительства и предполагаемых мест экспозиции выполнялось автоматически с помощью программы на языке R через программный интерфейс сервиса DaData с последующим картографированием с использованием геоинформационных систем.
Результаты и обсуждение. Доля экстренных извещений, содержащих текстовую информацию, пригодную для геокодирования, составила 48,1 % для присасываний клещей и 52,0 % для случаев клещевого вирусного энцефалита (КВЭ). Совпадение муниципального образования места экспозиции с районом проживания пациента наблюдалось лишь в 29,6 % случаев присасывания и 30,3 % случаев КВЭ. В большинстве случаев муниципальный район предполагаемого места нападения клеща отличался от места проживания пациента. Предлагаемый подход к пространственному анализу выявил скрытые зоны риска инфицирования КВЭ на территориях, не входящих в официальный перечень эндемичных районов, и продемонстрировал несоответствие зон с высоким уровнем расчетной заболеваемости местам наибольшей концентрации фактов инфицирования. Разработанная технология повышает точность оценки территориального риска заражения клещевыми инфекциями. Внедрение функций геокодирования данных экстренных извещений в систему эпидемиологического надзора за клещевыми инфекциями обеспечит объективное районирование для планирования адресных профилактических мероприятий.

Цель работы – выявление генетических особенностей и определение филогенетических связей штамма Burkholderia pseudomallei И-16, выделенного из секционного образца в Иркутской области в 2024 г. при случае летального молниеносного мелиоидоза, завезенного из Таиланда.
Материалы и методы. Молекулярногенетический анализ генома B. pseudomallei И-16 в сравнении с 34 геномами из публичных баз данных проводили с использованием ресурсов PubMLST, IslandViewer 4, NGphylogeny и iTOL v6.
Результаты и обсуждение. Показано, что B. pseudomallei И-16 относится к достаточно редкому и ограниченно распространенному сиквенстипу ST23. Филогенетический анализ на основании анализа конкатенированных последовательностей схемы cgMLST показал кластеризацию B. pseudomallei И-16 в одну кладу со штаммами из Таиланда, Лаоса и Камбоджи; ближайшие штаммы DR10212A и 708а таиландского происхождения отличались от И-16 соответственно на 820 и 958 локусов основного генома. В составе генома B. pseudomallei И-16 обнаружены одна вероятная интегрированная плазмида и три профага. Проведенный анализ наличия вариабельно присутствующих у возбудителя мелиоидоза факторов вирулентности на предсказанных у B. pseudomallei И-16 MGEs показал наличие пар «эффектор – иммунитет» – T6SS-связанного эффектора TOX-REase-5 и нейтрализующего его белка, ДНК-дезаминазного токсина DddA и нейтрализующего белка CdiI. Кроме того, обнаружены кластеры генов T6SS и T4SS, эффекторы T3SS HrpK и ChbP, гены фактора вирулентности TspB и токсина Zot, адгезинов семейства YadA – BoaA и BpaС, дельта-токсина семейства Cry8Ea1 и его секреторного белка VirK, гены белка секреции/активации гемолизина семейства ShlB/FhaC/HecB и нитевидного гемагглютинина fhaB3. Таким образом, у исследованного штамма B. pseudomallei И-16 в геноме имеется достаточно представительный дополнительный набор генов факторов вирулентности, приобретенных путем горизонтального переноса, что является наиболее вероятной причиной его высокой вирулентности.

Цель исследования – сравнительный анализ структуры и распространенности генов патогенности, лекарственной устойчивости и персистенции среди природных нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae биовара Эль Тор с генотипом ctxAB^– tcpA⁺.
Материалы и методы. Проанализированы полные геномы 73 токсигенных и 33 нетоксигенных штаммов холерных вибрионов с помощью методов мультилокусного сиквенс-типирования в онлайн-сервисе MLST2.0 на платформе CGE (Center Genomic Epidemiology) и филогенетического анализа с применением программы MrBayes v.3.2.7a.
Результаты и обсуждение. Выявлены новые геномные особенности природных нетоксигенных штаммов V. cholerae Эль Тор с генотипом ctxAB⁻tcpA⁺, относящихся к филогенетической линии L3. Установлено, что по ST-типу, наличию мобильных элементов ICE и VSP-II, аллельному профилю генов патогенности (tcpA, rtxA) и лекарственной устойчивости (gyrA и parC), а также присутствию гена VC2346 ряд штаммов из этой группы имели значительное генетическое сходство с токсигенными и были, видимо, производными типичных или генетически измененных штаммов возбудителя холеры. Филогенетический анализ подтвердил явную генетическую близость этих изолятов с токсигенными и показал их принадлежность к филогенетической линии эпидемически опасных штаммов, а именно к L2. Таким образом, среди природных нетоксигенных холерных вибрионов Эль Тор ctxAB⁻ tcpA⁺ обнаружены штаммы с генетическими маркерами возбудителя холеры, что указывает на их происхождение от этих штаммов и свидетельствует о необходимости разработки диагностических средств для дифференциации нетоксигенных штаммов с разным патогенным потенциалом.

Прекращение вакцинации после ликвидации натуральной оспы привело к снижению уровня коллективного иммунитета населения мира. В настоящее время риск национального и международного распространения Mpox оценивается как «высокий». Занос MPXV клады 1b может быть осуществлен наземным или воздушным транспортом гражданами иностранных государств или российскими туристами, возвращающимися после отдыха за рубежом.
Цель исследования – прогноз последствий заноса MPXV клады 1b на территорию России.
Материалы и методы. Использованы данные опубликованных зарубежных и отечественных научных работ о распространении Mpox, значения среднего коллективного иммунитета и среднего базового репродуктивного числа, а также данные, характеризующие длительность поствакцинального иммунитета в отношении ортопоксвирусных инфекций.
Результаты и обсуждение. Сделан прогноз развития вспышки при отсутствии противоэпидемических мероприятий в результате заноса MPXV клады 1b на территорию России для трех сценариев: единичный заносной случай с учетом величины иммунной прослойки населения, внутрисемейная вспышка, вспышка в замкнутом коллективе. Результаты прогноза позволяют сделать вывод, что занос MPXV клады 1b на территорию России может привести к возникновению чрезвычайной ситуации локального или муниципального характера. При любом из рассмотренных сценариев после изоляции больных и контактировавших с ними лиц вспышка прекратится.

Цель работы – определение филогенетического разнообразия субпопуляций штаммов Yersinia pestis из ВолгоУральского песчаного природного очага чумы (ВУППО) за периоды эпизоотической и эпидемической активности с 1912 по 2002 г. и определение их географического распространения.
Материалы и методы. В работе исследовано 103 штамма, выделенных на территории ВУППО с 1912 по 2002 г. Высокопроизводительное секвенирование проводили на платформе MGI (секвенатор DNBSEQ-G50RS, Китай) с использованием наборов реактивов MGIEasy Fast FS Library Prep Set и MGIEasy UDB Primers Adapter Kit A. Для обработки данных и сборки необработанных коротких прочтений генома de novo использовали Unicycler v0.4.9, FastQC v0.11.9. Анализ VNTR-локусов осуществляли с помощью программы TandemReapeatFinder, для иерархической кластеризации использовался метод агломеративной кластеризации (AgglomerativeClustering, бибилиотека scikit-learn v1.7.0). SNP-типирование осуществляли с помощью программы Snippy v4.6.0. Построение филогенетического дерева выполняли методом Maximum Likelihood с применением программы PhyML 3.1 с 500 бутстреп-репликами.
Результаты и обсуждение. По данным полногеномного SNP-анализа и филогенетической реконструкции популяционной структуры выявлены основные распространенные в ВУППО субпопуляции, установлены SNP-генотипы штаммов Y. pestis, определены их маркерные SNPs. На основании полученных данных предположено, что причиной вспышки в 1945 г. на территории ВУППО в Казахстане могли быть штаммы Y. pestis, относящиеся к SNP-генотипу Pricasp 2. По данным анализа локусов VNTR выявлены 57 MLVA25-генотипов, определены наиболее вариабельные локусы (ms46 и ms62) для штаммов возбудителя чумы с территорий ВУППО. Результаты SNP- и MLVA25-типирования штаммов, выделенных в ВУППО с 1912 по 2002 г., указывают на активное изменение внутриочаговых зон циркуляции штаммов Y. pestis, а также на последовательную эволюцию штаммов средневекового биовара филогенетической ветви 2.MED1 возбудителя чумы в этом очаге.

Клещевые риккетсиозы занимают одно из ведущих мест в структуре заболеваемости трансмиссивными инфекциями в Российской Федерации. На территории Саратовской области в 2021–2024 гг. в 8 видах иксодовых и 3 видах гамазовых клещей выявлены генетические маркеры возбудителей риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки / Spotted fever group (КПЛ / SFG), идентифицированные как Rickettsia raoultii, R. conorii и R. slovaca. При серологическом обследовании населения Энгельсского района в 2024 г. IgG к R. conorii зарегистрированы в 6,4 % образцов. Несмотря на это, официально очаги КПЛ и случаи заболевания в области не зарегистрированы.
Цель работы – выявление генетических маркеров риккетсий группы КПЛ в клещах и обследование населения на наличие специфических антител к возбудителям риккетсиозов группы КПЛ на территории отдельных районов Саратовской области в 2025 г.
Материалы и методы. Методом ПЦР исследовано 1411 экземпляров иксодовых, гамазовых и аргасовых клещей, собранных на территории 9 районов и МО «г. Саратов». Методом ИФА проанализировано 400 сывороток крови жителей 9 районов области и МО «г. Саратов».
Результаты и обсуждение. Наличие ДНК Rickettsia spp. SFG подтверждено в пробах суспензий клещей 6 видов. Клещи собраны на территории 8 районов и территории МО «г. Саратов». Генетические маркеры R. conorii выявлены в клещах 2 видов. По результатам исследования образцов сывороток крови на наличие антител к R. conorii в 46 образцах выявлены иммуноглобулины класса IgG, в 2 образцах – антитела класса IgM. Полученные результаты свидетельствуют о циркуляции риккетсий группы КПЛ на территории Саратовской области и возможном существовании природных очагов риккетсиозов группы КПЛ, что указывает на необходимость включения этой группы инфекций в систему эпидемиологического мониторинга.

Цель работы – изучение структуры генов системы секреции 6-го типа нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae О1-серогруппы биовара Эль Тор и выявление их конкурентных особенностей.
Материалы и методы. Исследования проведены на нетоксигенных штаммах, выделенных на территории РФ от больных или из внешней среды с 1981 по 2017 г., хранящихся в Государственной коллекции патогенных бактерий ФКУН Российский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора. Для биоинформатического анализа применяли алгоритмы BLAST v.2.15.0 и BioEdit v.7.0.9.0. Использовали нуклеотидные последовательности полных геномов, представленные в NCBI GenBank. Конкурентную пробу ставили в автоклавированной речной воде по методу R. Freter et al. (1981).
Результаты и обсуждение. Установлено, что состав кластеров системы секреции 6-го типа ctxA^– tcpА⁺-изолятов идентичен токсигенным штаммам V. cholerae О1 Эль Тор и включает большой кластер и три дополнительных – Aux-1, 2, 3. При этом Aux-3 по размеру и составу генов соответствует типу Aux-3^Р, характерному для токсигенных изолятов. Структура 88,9 % изученных локусов также является прототипной. Исключение составили три штамма, имеющие однонуклеотидную замену в гене, кодирующем эффектор VgrG-3. В штаммах ctxAB^–tcpA^– выявлен большой кластер и Aux-2. Кластер Aux-1 отсутствует в геноме 22 % штаммов, а в оставшихся присутствует только краевой ген, кодирующий гемолизин. Только два штамма ctxAB^–tcpA^– содержат Aux-3, который соответствует типу Aux-3^Е, характерному для водных вибрионов. Выявлена вариабельность структуры большинства изученных генов данных штаммов. При совместном культивировании штаммов ctxAB^–tcpA^– и ctxAB^–tcpA⁺ конкурентным преимуществом обладали практически все ctxAB^–tcpA⁺-изоляты. Исключение составил ctxAB^– tcpA^–-штамм V. cholerae М1337, продуцирующий повышенное количество экзополисахарида, что усиливало его конкурентные свойства. Показано сосуществование ctxAB^–tcpA⁺-изолятов и Aeromonas hidrofila 401, имеющего функциональную систему секреции 6-го типа.

Забайкальский край эндемичен по клещевому вирусному энцефалиту, иксодовым клещевым боррелиозам, риккетсиозам, регистрируются заболевания гранулоцитарным анаплазмозом человека и моноцитарным эрлихиозом человека.
Цель работы – провести анализ инфицированности иксодовых клещей возбудителями трансмиссивных инфекций и оценить эпидемиологические риски на территории Агинского, Дульдургинского, Кыринского, Калганского, Нерчинско-Заводского районов Забайкальского края.
Материалы и методы. Всего за три года (2022–2024 гг.) отловлено 2095 клещей трех видов: Ixodes persulcatus, Haemaphysalis concinna, H. japonica – из пяти районов Забайкальского края и 60 мелких млекопитающих из двух районов.
Результаты и обсуждение. При индивидуальном исследовании 2071 суспензии клещей методом ПЦР на четыре группы патогенов маркеры одного или более обнаружены в половине из них. Два и более патогена одновременно встречалось в 19,8 % суспензий членистоногих. Маркеры вируса клещевого энцефалита (вируса КЭ), анаплазм, эрлихий в два раза чаще встречались в сочетаниях, чем в моноварианте. Противоположная картина наблюдалась при выявлении ДНК боррелий, которые чаще встречались в моноварианте. Маркеры боррелий в среднем встречались у 51,1 % исследованных клещей, маркеры анаплазм – 16,9 %, эрлихий – 9,7 %, вируса КЭ – 3,2 %. РНК-изоляты байкальского субтипа из национального парка «Алханай» оказались генетически близки к ранее изученным штаммам вируса КЭ, что подтверждает сохраняющуюся на протяжении многих лет циркуляцию вируса КЭ на данной территории. При исследовании грызунов методом ПЦР на четыре группы патогенов маркеры одного или более обнаружены у шести из них. В одной красно-серой полевке удалось определить вирус КЭ байкальского субтипа. Эпидемиологическая обстановка по трансмиссивным инфекциям, передающимся иксодовыми клещами, на территории Забайкальского края остается напряженной.

Цель исследования – выявление генетических особенностей и возможного происхождения штаммов Brucella abortus, вызвавших эпизоотическую вспышку бруцеллеза в Республике Бурятия в 2023–2024 гг.
Материалы и методы. Исследуемые штаммы B. abortus, выделенные из патологоанатомического материала от крупного рогатого скота в Республике Бурятия в 2023–2024 гг. на территории, пограничной с Монголией, изучили бактериологически, с последующим секвенированием ДНК возбудителя и биоинформатическим анализом геномов. Проведен байесовский филогенетический анализ в BEAST v2.7.5.
Результаты и обсуждение. Геномы штаммов охарактеризованы, проведен сравнительный анализ вариабельности штаммов с вакцинным B. abortus 82 и штаммами, выделенными в Монголии в 1999 и 2014 гг. Установлено, что все исследуемые штаммы относятся к одной клональной ветви B. abortus сиквенс-типа 2. Группа штаммов B. abortus вспышки 2023–2024 гг. появилась около 58 лет назад (95% HPD: 31,2–86,7) и близкородственна штаммам, выделенным на территории Монголии в 1999 и 2014 гг. Эволюционная скорость этой группы составила 1,8·10^–7 замен на сайт в год (95% HPD: 2,5·10^–8 – 1,84·10^–6 замен на сайт в год). Уникальной мутацией, отличающей группу штаммов вспышки от штаммов B. abortus 82 и штаммов из Монголии, является дефект гена rbsB, вызванный мутацией с появлением стоп-кодона внутри рамки считывания. Этот ген участвует в энергозависимом переносе внеклеточной D-рибозы внутрь клетки и потенциально может снижать способность бактерии размножаться внутри клеток хозяина. В результате проведенного молекулярно-генетического исследования установлены причины и пути возникновения вспышки бруцеллеза среди крупного рогатого скота в Республике Бурятия в 2023–2024 гг.

Цель работы – сравнительный анализ информативности диагностических методов при исследовании различных объектов окружающей среды на наличие маркеров возбудителя туляремии; молекулярно-генетическая характеристика штаммов возбудителя туляремии.
Материалы и методы. Проведен сравнительный анализ эффективности методов диагностики туляремии (ПЦР, РНАт, ИХ-тест) в различных образцах полевого материала из очагов Ростовской области, Луганской (ЛНР) и Донецкой (ДНР) народных республик, Запорожской и Херсонской областей за период с 2020 по 2023 г. Молекулярно-генетическую характеристику штаммов, выделенных из различных источников, получали с помощью VNTR-типирования с последующим построением дендрограммы методом NJ.
Результаты и обсуждение. Сравнительный анализ эффективности используемых методов диагностики показал, что биологический метод остается золотым стандартом для обнаружения живых бактерий Francisella tularensis в полевом материале. Серологические методы, основанные на выявлении специфических антигенов, являются надежным маркером циркуляции возбудителя в очаге туляремии в случаях, когда не удается выделить живые бактерии. При сомнительных результатах РНАт дополнительно эти пробы исследовались с помощью иммунохроматографических тестов. Как установлено при исследовании материала из гнездово-норового субстрата, погадок птиц и помета хищных млекопитающих, наиболее информативным методом является РНАт. В то же время, согласно полученным нами данным, для проб из таких объектов окружающей среды, как сено, зерно, фураж, вода и др., наиболее адекватными являются методы ПЦР-диагностики. Изученная 31 культура F. tularensis представлена шестью индивидуальными VNTR-генотипами. Наибольшее число генотипов (4 из 6) выявлено среди мелких млекопитающих, два генотипа обнаружено у клещей и один – в водном источнике. Сочетанное использование серологических и молекулярно-биологических методов позволяет повысить достоверность и точность выявления возбудителя туляремии в объектах окружающей среды.

Цель работы – получить хроматографически очищенный противооспенный иммуноглобулин из сыворотки крови лошадей и оценить его свойства.
Материалы и методы. В работе использована сыворотка крови лошадей, содержащая антитела к вирусу вакцины, штамм Л-ИВП. Хроматографическую очистку сыворотки проводили на препаративном хроматографе Akta Avant (GE HealthCare, Швеция), контроль молекулярных параметров на стадиях получения иммуноглобулина осуществляли на системе высокоэффективной жидкостной хроматографии LC-20ad (Shimadzu, Япония). Биологические свойства иммуноглобулина оценивали на кроликах, белых мышах, морских свинках. Уровень специфических вируснейтрализующих антител определяли в реакции нейтрализации на хорионаллантоисной оболочке (ХАО) 12-суточных куриных эмбрионов.
Результаты и обсуждение. Разработана технология получения хроматографически очищенного противооспенного иммуноглобулина из сыворотки крови лошади. На начальном этапе иммунную сыворотку крови лошадей очищали фильтрованием через стекловолоконные фильтры кассетного типа от фибринового осадка, остаточного количества липидов и липопротеинов, а затем осаждали иммуноглобулиновую фракцию насыщенным раствором сульфата аммония. На следующем этапе с помощью ионообменной хроматографической очистки из рабочего раствора удаляли соли аммония, низкомолекулярные фракции, остаточные количества альбуминов и эуглобулины. На заключительном этапе, используя гель-фильтрацию, избавлялись от димеров, полимеров и агрегатов иммуноглобулинов. Приготовленные по разработанной технологии опытные серии иммуноглобулина характеризовались высокой степенью очистки. Содержание мономеров в готовом препарате составляло не менее 99 %, а специфическая активность по уровню специфических вируснейтрализующих антител – не менее 1:16000.

Эхинококкозы остаются актуальными паразитарными заболеваниями, представляющими серьезную медикосоциальную проблему. Особый интерес имеют эпидемиологические особенности, факторы риска и вопросы профилактики эхинококкоза и альвеококкоза, которые характеризуются хроническим течением и могут приводить к инвалидности и летальному исходу.
Целью исследования являлась оценка серопревалентности эхинококкоза, а также анализ поведенческих факторов риска заболевания эхинококкозами среди населения Жети-Огузского района Иссык-Кульской области Кыргызской Республики.
Материалы и методы. Проанализированы данные анкетирования и результаты серологического обследования 826 человек, проживающих в 10 населенных пунктах Жети-Огузского района Иссык-Кульской области Кыргызской Республики. ИФА использовали для выявления признаков текущей или ранее перенесенной инфекции и оценки распространенности заболевания в исследуемой популяции. Исследование имело одномоментный (cross-sectional) дизайн и включало социологический опрос, серологические методы и статистический анализ. Обработку полученных данных проводили с применением программных пакетов Microsoft Excel и SPSS.
Результаты и обсуждение. В исследовании среди 826 жителей района общая серопревалентность эхинококкоза составила 8,2 %, при этом наибольшие показатели отмечены в возрастной группе 60–69 лет (14,3 %) и среди женщин (66,2 %). Анализ поведенческих факторов (наличие и содержание домашних животных, дегельминтизация, контакт с собаками и их кормление внутренностями забитых животных) не выявил статистически значимых ассоциаций с серопозитивностью (OR 0,395–1,215; 95% ДИ включали единицу; p>0,05), что указывает на сложный характер передачи инфекции. Полученные данные подчеркивают необходимость целевых профилактических и образовательных программ, скрининговых обследований и контроля за санитарной безопасностью в эндемичном регионе.

Бактерия Yersinia pseudotuberculosis – этиологический агент псевдотуберкулеза, природно-очагового заболевания, регистрируемого в разных регионах мира. Штаммы псевдотуберкулезного микроба характеризуются значительным генетическим разнообразием и отличаются по патогенности и способности вызывать групповые и спорадические заболевания у человека. С 2022 г. на территории Российской Федерации выявлено 1090 случаев заражения псевдотуберкулезом, однако уровень заболеваемости остается все еще недооцененным. Современный уровень развития молекулярно-генетических технологий способствует разработке высокоэффективных методов детекции и дифференциации штаммов Y. pseudotuberculosis.
Цель исследования – разработка эффективной системы MLVA14-типирования для проведения внутривидовой генетической дифференциации Y. pseudotuberculosis, основанной на мультилокусном VNTR-анализе.
Материалы и методы. Проведен молекулярно-генетический и филогенетический анализ, а также O-генотипирование in silico 94 штаммов Y. pseudotuberculosis на основе их нуклеотидных последовательностей, депонированных в базе данных NCBI RefSeq.
Результаты и обсуждение. Установлена серологическая принадлежность, определен набор факторов патогенности и отношение к генетической группе, охарактеризованы филогенетические связи использованных в работе штаммов Y. pseudotuberculosis. Выявлено 14 ранее не описанных VNTR-локусов, отличающихся по свойствам и дискриминационной способности. При помощи веб-сервиса Primer-BLAST для обнаруженных молекулярных мишеней сконструированы фланкирующие праймеры. Методом in silico проведено MLVA-типирование штаммов и построена кладограмма родственных связей, показывающая, что разработанный способ MLVA14 дискриминирует близкородственные штаммы Y. pseudotuberculosis на те же группы, что и полногеномный SNP-анализ, но при помощи меньшего количества молекулярных мишеней. Разработанный способ MLVA14-типирования имеет высокую эффективность для проведения внутривидовой генетической дифференциации штаммов возбудителя псевдотуберкулеза.