В обзоре отражено развитие эпидемии, вызванной вирусом Эбола, в странах Западной Африки - Либерия, Сьерра-Леоне, Нигерия, Сенегал, Мали. Рассмотрена также эпидемия в Демократической Республике Конго, не связанная с отмеченными вспышками. Прослежены пути распространения и завозные случаи (контролируемые и неконтролируемые) в страны Европы и Америки. Проанализированы причины осложнений, с которыми пришлось столкнуться при ликвидации эпидемий, и причины, способствующие широкому распространению инфекции.

Цель данной работы - проиллюстрировать возможности исследования влияния коллективного иммунитета на последствия эпидемий с использованием универсальной модели локальных, то есть развивающихся в замкнутой популяции, эпидемий/вспышек особо опасных и социально значимых инфекций, разработанной в ГНЦ ВБ «Вектор». Результаты моделирования позволяют оценить эффективность предварительной и экстренной иммунизации для ликвидации эпидемии. Показано, что для моделируемых инфекций уровень коллективного иммунитета, формируемый до начала эпидемии, может играть существенную роль в минимизации ее последствий. Влияние массовой вакцинации, реализуемой параллельно с применением других мер противодействия при эпидемиях натуральной оспы и геморрагической лихорадки Крымской-Конго, гораздо менее заметно. Модель доступна по адресу http://vector-epimod.ru.

Важным показателем, влияющим на эпидемиологическую роль видов иксодовых клещей, является их способность присасываться к человеку (агрессивность). Цель сообщения - оценить агрессивность клещей, обитающих на юге Приморского края. Проанализирован материал с территории Партизанского района, собранный в 2012-2013 гг. Агрессивность клещей по отношению к человеку определяли путем сравнения структуры комплекса видов при сборе имаго на флаг с растений (изучено 3944 особи) и при удалении присосавшихся особей с людей (437 экз.). Выявлено пять видов: Ixodes persulcatus , Haemaphysalis соncinna , H. japonica douglasi, Dermacentor silvarum , являющихся массовыми, и редкий в Партизанском районе - I. pavlovskyi. Присасывания фиксировали с апреля по октябрь-ноябрь: наибольший период активности у I. persulcatus , наименьший - у H. соncinna. Доля I. persulcatus от суммы клещей, удаленных с людей, составила 86,3 %, а в сборах с растений - 44,9 %. Это наибольший показатель агрессивности. Высокая агрессивность наблюдается и у I. pavlovskyi , но так как он редко встречается, то не имеет эпидемиологической значимости в Партизанском районе. H. japonica присасывается чаще, чем H. соncinna. Для оценки различий между ними по эпидемиологической значимости, нужны исследования индивидуальной зараженности возбудителями инфекций. Регистрация D. silvarum среди клещей, удаленных с людей, ниже, чем в сборах с растений, и эпидемиологическая роль вида в настоящее время на юге Приморья относительно низкая.

На территории Киргизии в Тянь-Шаньском высокогорном природном очаге чумы с 1943 г. разрабатывались методы и проводились мероприятия по неспецифической профилактике с целью истребления основных носителей - серых сурков - и уничтожения переносчиков - блох. Установлено, что более эффективной в плане длительного подавления эпизоотической активности очага оказалась глубинная дустация нор сурков для уничтожения блох, нежели истребление самих зверьков. В настоящее время для поддержания стадии эпизоотического покоя осуществляются локальные обработки современными экологически безопасными пестицидами на участках стойкого сохранения возбудителя чумы и местах активизации эпизоотий.

Обобщен опыт взаимодействия учреждений Роспотребнадзора по обеспечению эпидемиологического благополучия по чуме в условиях обострения эпизоотической обстановки на территории Прикаспийского песчаного природного очага чумы в 2014 г. Комплекс противочумных мероприятий включал проведение эпизоотологического и эпидемиологического мониторинга, мер специфической и неспецифической профилактики, подготовку медицинских и ветеринарных работников, подготовку медицинских организаций (МО) по вопросам профилактики болезней, информационно-разъяснительную работу с населением. Для обеспечения эпидемиологического благополучия привито против чумы 4460 человек, проведена полевая дезинсекция на площади 50,5 км², полевая дератизация - 89,4 км², поселковая дезинсекция - 257,3 тыс. м², поселковая дератизация - 329,1 тыс. м². Финансовые затраты на проведение профилактических (противоэпидемических) мероприятий составили 23265,8 тыс. руб. Отмечена перспективность упреждающего планирования и проведения профилактических мероприятий на участках прогнозируемого обострения эпизоотической обстановки в природных очагах чумы Российской Федерации.

В 2014 г. на центральном приморском участке Прикаспийского песчаного природного очага чумы произошла активизация эпизоотического процесса в смешанных поселениях грызунов. Целью исследований явилось выявление условий, которые привели к развитию интенсивных и экстенсивных эпизоотий чумы. В работе использовали оперативные данные Астраханской, Элистинской и Дагестанской противочумных станций, собственных исследований в очаге. В результате высокой исходной численности грызунов и блох, теплой зимы 2013-2014 гг., весной плотность носителей и переносчиков инфекции значительно превысила многолетний уровень. Общая численность зверьков составила 31,1 особи на 1 га, снизившись к осени до 17,8. Запас основного переносчика чумы - блохи N. laeviceps - был равен весной 350, осенью - 120 экз. на 1 га. Всего на протяжении 3 смежных сезонов выделено 56 культур Y. pestis: 17 штаммов - от грызунов и 39 - от их блох. Общая эпизоотическая площадь составила 2300 кв. км. Эпизоотии чумы регистрировались в зоне ее стойкой природной очаговости в границах Ильменно-Придельтового, Приморского и Черноземельского ландшафтно-эпизоотологических районов на административной территории Лиманского района Астраханской области, Лаганского и Черноземельского районов Республики Калмыкия и Тарумовского района Республики Дагестан. Результаты слежения за эпизоотическими проявлениями, динамикой численности носителей и переносчиков чумы легли в основу планирования и проведения противоэпидемических мероприятий, составления прогноза развития ситуации в очаге.

В статье дано научное обоснование привлечения дополнительных сил и средств для обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения в условиях массовых мероприятий с международным участием. Определены задачи и основные направления работы специализированной противоэпидемической бригады Роспотребнадзора в период подготовки и проведения XXVII Всемирной летней универсиады в Казани. Рассмотрены аспекты межведомственного взаимодействия сетевых структур и мобильных формирований санитарно-эпидемиологического и лечебно-профилактического профилей во время Универсиады-2013.

Исследование проведено с целью выявления уровня, структуры, динамики, территориального распределения природно-очаговых инфекционных болезней на территории Тульской области. В работе на основании анализа данных статистических отчетов ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Тульской области» за 1993-2013 гг. показано, что на территории Тульской области из числа природно-очаговых инфекционных болезней регистрируются в основном геморрагическая лихорадка с почечным синдромом, лептоспироз, иксодовый клещевой боррелиоз, туляремия в соотношении 60,2:33,6:5,5:0,7. Средний уровень заболеваемости населения геморрагической лихорадкой с почечным синдромом и лептоспирозом за исследуемый период превышает данный показатель по Российской Федерации в 1,3 и 4,9 раза; инцидентность иксодовым клещевым боррелиозом и туляремией, наоборот, в 9,2 и 2,1 раза ниже, чем в целом по стране. Динамика заболеваемости геморрагической лихорадкой с почечным синдромом и иксодовым клещевым боррелиозом характеризуется умеренной тенденцией к росту; инцидентность лептоспирозом и туляремией проявляет выраженную тенденцию к снижению. Наиболее значительное число случаев заболеваний геморрагической лихорадкой с почечным синдромом, лептоспирозом, иксодовым клещевым боррелиозом отмечается в северных, северо-западных, западных районах области; наибольшее число случаев туляремии зарегистрировано в двух восточных районах.

Включение в состав Российской Федерации Крымского федерального округа (КФО) в марте 2014 г. определило необходимость организации профилактических мероприятий, направленных на обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия в регионе. В статье представлены итоги деятельности специализированных противоэпидемических бригад ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт» и ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб» по оказанию помощи санитарно-эпидемиологической службе (СЭС) КФО, оперативной этиологической расшифровке вспышек инфекционных заболеваний. Выполнены лабораторные исследования 2407 проб клинического материала и объектов окружающей среды, при проведении 11518 исследований получено 676 положительных (нестандартных) результатов. Даны рекомендации по оптимизации работы учреждений СЭС КФО.

Лихорадка Ку представляет определенную проблему у нас в стране и за рубежом. В Российской Федерации разработан и утвержден новый базовый нормативный документ - санитарно-эпидемиологические правила профилактики коксиеллеза. Впервые в мире в нашей стране введен регламентированный надзор за внебольничными пневмониями, который улучшит диагностику данной патологии. Качество борьбы с лихорадкой Ку зависит от оснащения лабораторий, подготовки медицинского персонала и межведомственного взаимодействия, позволяющего проводить оценку ситуации, принимать противоэпидемические меры и осуществлять прогноз в целях обеспечения биологической безопасности Российской Федерации.

Проведена оценка эффективности используемого для дифференциации и кластеризации штаммов чумного микроба метода MLVA25 в отношении возбудителя псевдотуберкулеза, а также поиск штаммов Y. pseudotuberculosis наиболее филогенетически близких Yersinia pestis с помощью варианта этого метода с использованием не 25, а 14 VNTR локусов. При сравнительном исследовании 71 изолята Y. pseudotuberculosis и пяти штаммов Y. pestis вариантами метода MLVA25 и MLVA14 выявлено 75 и 54 генотипа соответственно. Штаммам псевдотуберкулезного микроба отдельных сероваров соответствовали определенные MLVA типы. По данным MLVA14, наиболее близкими к чумному микробу из 221 исследованного штамма Y. pseudotuberculosis оказались представители кластеров, включающих изоляты псевдотуберкулезного микроба MLST типов ST19 (серовар O:3) и ST43 (серовар O:1b).

Нами проведено полногеномное секвенирование 20 штаммов Yersinia pestis из всех 11 природных очагов чумы в России и части очагов сопредельных государств. Филогенетический анализ на основе выявленных 1918 коровых SNPs в геномах этих штаммов и 16 штаммов Y. pestis из NCBI GenBank установил наличие 5 кластеров близкородственных штаммов, с учетом которых нами усовершенствована подвидовая классификация возбудителя чумы. Новая классификация включает пять подвидов: основной (ssp. pestis ), кавказский (ssp. caucasica ), улегейский (ssp. ulegeica ) и два новых - центральноазиатский (ssp. central asiatica ) и ангольский (ssp. angola ). Центральноазиатский подвид объединяет эволюционно родственные штаммы, ранее отнесенные к алтайскому и гиссарскому подвидам, а также штаммы из Таласского высокогорного очага в Киргизии и Узбекистане и штаммы microtus из Китая. В составе центральноазиатского подвида выделено три биовара - алтайский, гиссарский и microtus. Предложено удобное обозначение штаммов: 0.PE4a для алтайских, 0.PE4h для гиссарских, 0.PE4t для таласских штаммов и 0.PE4m для штаммов microtus, а также 0.PE5 для штаммов улегейского подвида.

Цель исследования состояла в проведении экспериментов по изучению выживаемости токсигенных штаммов геновариантов V. cholerae биовара Эль Тор в автоклавированной речной воде и организме лабораторных животных в сравнении с типичными штаммами. В результате установлено, что в автоклавированной речной воде геноварианты так же, как и типичные Эль Тор вибрионы выживали длительное время (свыше пяти месяцев). При этом количество микробных клеток в популяции типичных штаммов со временем уменьшалось, в то же время в штаммах геновариантов в период между 7-ми и 21-ми сутками наблюдался рост штаммов. На 7-е сутки КОЕ штаммов геновариантов превышало количество бактерий типичных штаммов в 1,5-2,5 раза, на 21-е - в 1,8-3,0 раза. Селективное преимущество геновариантов было также подтверждено при постановке конкурентной пробы in vitro (речная вода) с типичными штаммами. Геноварианты доминировали над типичными штаммами V. cholerae биовара Эль Тор и в смешанной популяции in vivo (биопробные животные). Так, КОЕ штаммов геновариантов при высеве кишечного содержимого и гомогената кишечной стенки превышало число клеток типичных штаммов в 1,25-84,0 раза. Высказано предположение, что одной из причин селективного преимущества геновариантов может быть их более высокий уровень адаптации в результате изменения метаболической активности клеток. Выявленная способность токсигенных штаммов геновариантов не только длительное время сохраняться в водоемах нашей страны, но и размножаться в них создает неблагоприятный прогноз по холере.

С целью выявления риска гемотрансфузионной передачи вируса Западного Нила на территории Саратовской области в ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб» проведено исследование 1760 образцов сывороток крови и 270 образцов крови доноров, проживающих на территории области, направленное на выявление маркеров, свидетельствующих о недавнем инфицировании этим вирусом. В результате исследования выявлены IgM и/или низкоавидные IgG, указывающие на недавний контакт с возбудителем. Полученные результаты показывают возможность реализации гемотрансфузионного механизма передачи вируса Западного Нила на территории Саратовской области в сезон его передачи. В дальнейшем планируется продолжить исследования с помощью 2 методов: ИФА и ПЦР-анализа, тестируя индивидуально биологический материал от каждого донора.

Представлена информация об этиологии, эпидемиологии, клинике и профилактике малоизвестного вирусного энцефалита Нипа. Дана характеристика возбудителя и его экология. Целью анализа является ознакомление отечественных специалистов (инфекционистов, эпидемиологов, неврологов, санитарных врачей) с новым опасным заболеванием, неизвестным в России. Метод исследования - аналитический. Инфекция вируса Нипа у людей впервые описана в Малайзии (1998-1999), затем - в Бангладеш (2004) и Индии (2006). Возбудитель идентифицирован как новый представитель парамиксовирусов в 1998 г. и затем вместе с родственным ему вирусом Хендра обособлен в новый род семейства Paramyxoviridae. Резервуар вируса в природе - рукокрылые крыланы, преимущественно плодоядные летучие лисицы 8 видов рода Pteropus, вторичный - домашние свиньи. Вирус Нипа высококонтагиозен для свиней, которые выступают как амплификатор и резервуар вируса. Для заболевания у людей характерны симптомы и признаки энцефалита и острой легочной недостаточности. Быстро развивается кома. Летальность - 38,5-92,0 %. Известны вспышки с передачей возбудителя от человека к человеку. Специфическое лечение не разработано. Профилактика - неспецифическая.

Определены полные нуклеотидные последовательности двух криптических плазмид - pCKF из Центрально-Кавказского высокогорного очага чумы и pTP33 из Тувинского горного очага чумы в России. Установлено, что размер плазмиды pCKF составляет 5,4 т.п.н., а ее состав Г+Ц пар равен 38,4 %. В плазмиде содержится 8 открытых рамок считывания, кодирующих функции транспорта и секреции, в частности, системы секреции IV типа. Размер другой криптической плазмиды pTP33 равен 33,8 т.п.н., а состав Г+Ц пар равен 50,3 %. В pTP33 содержится 52 открытые рамки считывания, большинство из которых идентифицировано как фаговые белки, из чего следует, что pTP33 является кольцевым геномом фага. В pTP33 присутствуют также два гена двухкомпонентной системы белков токсин-антитоксин YoeB/YefM, действующей на репликативный аппарат бактерий.

В экспериментах при интраназальном заражении 8-10-суточных аутбредных мышей ICR вирусом оспы обезьян (ВОО) в дозе 3,83 lg БОЕ/гол. (lg бляшкообразующих единиц на голову) определяли динамику накопления вируса в различных органах, клетках крови и сыворотке крови. Через 2 сут после заражения ВОО был обнаружен в клетках крови, носовой полости, легких, селезенке и двенадцатиперстной кишке, а через 5 сут - в головном мозге, трахее, печени, почках и в сыворотке крови. Установлено, что органами максимальной продукции ВОО являются легкие, носовая полость и головной мозг, соответственно титры вируса в 5 % гомогенатах этих органов были равны (5,7±0,1), (5,5±0,1) и (5,3±0,3) lg БОЕ/мл через 7 сут после заражения. В клетках крови вирус найден через 2, 5 и 7 сут после заражения, а в сыворотке крови - через 5 и 7 сут. Перенос ВОО кровью к вторичным органам-мишеням (печень, селезенка, двенадцатиперстная кишка, почки и др.), по-видимому, осуществляется активным способом за счет его размножения в форменных элементах крови. Полученные данные и разработанная на их основе схема диссеминации ВОО в организме могут быть использованы для поиска и создания терапевтических противооспенных препаратов с целенаправленной, адресной доставкой к органам-мишеням.

Изучены культурально-морфологические, биохимические и генетические свойства лиофилизированных культур вакцинного штамма F. tularensis 15 НИИЭГ, наработанных в течение 60 лет и депонированых в Государственной коллекции патогенных микроорганизмов ФГБУ «НЦЭСМП» Минздрава России. Проведенные исследования показали, что хранение штаммов в лиофилизированном состоянии при пониженной температуре не в полной мере предохраняет их от изменения генетических и фенотипических свойств. Установлено, что штамм F. tularensis 15 НИИЭГ1953, 1966, 1969, 2003 и 2012 гг. высушивания при культивировании на питательной среде Ft-агар с добавлением крови и без нее по степени диссоциации (87-99 %) SR-колоний сохранял свои иммуногенные свойства. При этом штамм 1990 г. содержал нормированное количество (не менее 80 %) иммуногенных колоний на питательной среде с добавлением крови и не соответствовал требованиям без крови. Выявленное снижение от 70 до 75 % SR-колоний у штамма 1987 г. при культивировании с добавлением крови и без нее свидетельствует о снижении его иммуногенных свойств. По данным RAPD и ERIC типирования, показана высокая стабильность генома лиофилизированных в разные годы культур F. tularensis 15 НИИЭГ. Вакцинный штамм туляремийного микроба имеет уникальные RAPD и ERIC профили, незначительное изменение которых отмечено при хранении субкультуры патогена в высушенном состоянии.

В работе приведены результаты прямого белкового профилирования коллекции штаммов бруцелл с помощью времяпролетной масс-спектрометрии с матричной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF MS). Стандартизована методика обеззараживания культур возбудителя бруцеллеза и последующего анализа при использовании MALDI-TOF MS. Получены 59 репрезентативных белковых профилей представителей шести основных видов бруцелл ( B. melitensis , B. abortus , B. suis, B. canis, B. ovis, B. neotomae ), которые включены в электронную базу данных масс-спектров в среде программы Biotyper v 3.0 (Bruker Daltonics, Германия). При анализе масс-спектров исследованных штаммов бруцелл выявлены 17 родоспецифичных фрагментов в диапазоне масс 2000-20000 Да, совокупность которых в MALDI-TOF масс-спектрах может использоваться при идентификации Brucella spp. В работе также описаны фрагменты, специфичные для отдельных видов и штаммов бруцелл, представляющие интерес в качестве маркеров для внутривидовой дифференциации возбудителя. На основании полученных данных разработан стандартизированный алгоритм идентификации и дифференциации культур возбудителя бруцеллеза методом MALDI-TOF масс-спектрометрии.

В статье рассмотрено внедрение современных фильтрационных технологий для масштабированного получения В-субъединицы холерного токсина, продуцируемой рекомбинантным штаммом Vibrio cholerae non O1 КМ93. Проведен выбор оптимального типа микро- и ультрафильтрационных мембран для использования в технологическом процессе. Исследованы свойства В-субъединицы холерного токсина, полученного по разработанной технологии. Разработанный способ масштабированного получения В-субъединицы холерного токсина делает процесс более технологичным за счет внедрения метода тангенциальной микро- и ультрафильтрации на этапах его очистки и концентрирования позволяет исключить трудоемкие операции хроматографической очистки и сохранить свойства В-субъединицы. Проведенные исследования позволяют получать В-субъединицу холерного токсина в производственных условиях с характеристиками, аналогичными при разработке технологии, и использовать ее в качестве компонента холерной химической вакцины.

Целью работы было создание иммунохроматографического устройства для индикации пяти видов токсинов в едином цикле анализа и изучение его возможностей при анализе смывов с объектов окружающей среды и в продуктах питания. Были получены конъюгаты моноклональных антител с наночастицами коллоидного золота и сформированы мембранные композиты для осуществления иммунохроматографии в «сэндвич-формате» для индивидуальных токсинов. На основе полученных индивидуальных тестов было сконструировано иммунохроматографическое устройство для осуществления мультианализа, содержащее в своем составе мультианалитный индикаторный элемент, тампон для смыва пробы с поверхностей и емкость с буфером анализа. Разработанное мультианалитное иммунохроматографическое устройство позволяет определять в едином цикле анализа ботулинические токсины типов А и В в концентрации 5 и 10 нг/мл соответственно, стафилококковый энтеротоксин типа В - 40 нг/мл, холерный экзотоксин - 500 нг/мл, рицин - 80 нг/мл. Показана возможность индикации токсинов в смывах с поверхности объектов окружающей среды, а также в продуктах питания. Описана предварительная подготовка проб продуктов питания к анализу.