В статье приведены сведения об эпидемиологической обстановке в мире по COVID-19. Дана оценка основных эпидемиологических параметров (базовый репродуктивный показатель, летальность, инкубационный период и серийный интервал). Показана доля тяжелых случаев в разных возрастных группах и общая структура заболеваемости по тяжести клинического течения. Приведена типизация моделей реагирования в странах мира в зависимости от применяемого комплекса мероприятий на различных стадиях эпидемического процесса. Рассмотрены основные мероприятия по реагированию на распространение COVID-19 в различных странах мира и Российской Федерации, дана оценка их эффективности.

В работе представлен анализ заболеваемости Крымской геморрагической лихорадкой (КГЛ) в Российской Федерации в 2010–2019 гг., обобщены результаты эпизоотологического обследования территории природного очага КГЛ на юге европейской части России. В Российской Федерации сохраняется неблагоприятная эпидемиологическая обстановка по КГЛ, в 2010–2019 гг. выявлено 999 случаев заболевания КГЛ в девяти субъектах Южного и Северо-Кавказского федеральных округов. В 2019 г. отмечен рост уровня заболеваемости КГЛ в субъектах Южного и Северо-Кавказского федеральных округов по сравнению с 2017–2018 гг. Продолжается расширение территории с зарегистрированными эпидемическими проявлениями КГЛ. В 2010–2019 гг. сохранялась стабильно высокая численность имаго и преимагинальных фаз Hyalomma marginatum – основного переносчика вируса ККГЛ в Российской Федерации. Высокие показатели численности и инфицированности клещей H. marginatum могут способствовать развитию неблагоприятной эпидемиологической обстановки по КГЛ на юге Российской Федерации с возможным ростом заболеваемости в 2020 г.

Цель обзора состоит в комплексной оценке современного состояния эпизоотической активности и эпидемиологической значимости природных очагов туляремии на территории Российской Федерации, необходимой для составления и обоснования прогноза заболеваемости населения в 2020 г., а также планирования и проведения профилактических мероприятий, направленных на предупреждение заражения людей этой инфекцией. На территории Российской Федерации в 2019 г. зарегистрировано 42 случая инфицирования человека возбудителем туляремии, 85 % из которых приходится на три федеральных округа: Северо-Западный, Центральный и Сибирский. Эпизоотические проявления инфекции различной степени интенсивности выявлены в 51 субъекте России. На этом фоне спорадические случаи заболевания людей туляремией зарегистрированы в 17 регионах страны. Максимально выраженные эпидемические осложнения продолжаются на территории Республики Карелия – 9 больных. Выделено 17 культур Francisella tularensis subsp. holarctica из объектов окружающей среды в Тверской, Ярославской, Вологодской областях, в Алтайском крае и Республике Алтай. На основании анализа представленных данных можно сделать вывод о том, что в 2020 г. наиболее вероятны эпидемические осложнения в виде спорадических случаев заболевания среди невакцинированного населения на территориях Центрального федерального округа (Ярославская, Воронежская, Липецкая, Орловская, Рязанская области, г. Москва); Северо-Западного федерального округа (Архангельская область, Республика Карелия, г. Санкт-Петербург); Приволжского федерального округа (Республика Татарстан, Оренбургская область); Уральского федерального округа (Ханты-Мансийский автономный округ, Ямало-Ненецкая автономная область); Сибирского федерального округа (Новосибирская, Томская и Кемеровская области, Алтайский и Красноярский края).

Цель работы – анализ заболеваемости населения клещевым вирусным энцефалитом (КВЭ) и профилактики инфекции в округах и субъектах Российской Федерации в 2019 г., прогноз на 2020 г. на основе данных за 2010– 2019 гг. В обзоре показано, что в России сохранился тренд на снижение заболеваемости КВЭ, наблюдавшийся в последние годы. Тем не менее, случаи инфекции, как и ранее, зарегистрированы в 6 федеральных округах и 48 субъектах страны. Число больных составило 1559 человек (в относительных показателях 1,02 на 100 тыс. населения), 23 из них с летальным исходом. Возросла обращаемость в медицинские организации населения, пострадавшего от присасывания клещей. Меры специфической профилактики инфекции существенно не изменились по объему и направленности по сравнению с предшествующими годами. Вместе с тем площади акарицидных работ сократились. В работе приведены данные о вирусофорности переносчика, результатах лабораторного изучения клещей в округах и субъектах страны. Признано, что эпидемиологическая ситуация по КВЭ в Российской Федерации остается неблагополучной. Она требует постоянного внимания со стороны учреждений здравоохранения и Роспотребнадзора, а также принятия управленческих решений, направленных на дальнейшее снижение заболеваемости путем совершенствования мер профилактики, особенно в субъектах, характеризующихся высокой инцидентностью КВЭ.

Целью исследований являлась оценка эпидемиологической и эпизоотологической ситуации в природных очагах чумы Российской Федерации, стран ближнего и дальнего зарубежья в 2019 г. Отмечено негативное влияние современного потепления климата на состояние паразитарных систем природных очагов с циркуляцией чумного микроба основного подвида средневекового биовара филогенетической ветви 2.MED1. В 2019 г. локальные эпизоотии чумы зарегистрированы на территории двух (Горно-Алтайского высокогорного и Тувинского горного) из 11 природных очагов чумы Российской Федерации. Общая площадь эпизоотии составила 2248,5 км2 . Всего изолирована 31 культура Yersinia pestis основного подвида античного биовара филогенетической ветви 4.ANT и 5 культур алтайского биовара центрально-азиатского подвида филогенетической ветви 0.PE4а. Обоснован прогноз на сохранение в 2020 г., равно как и в последующие 2021–2025 гг., напряженной эпидемиологической обстановки в природных очагах с циркуляцией основного подвида античного биовара филогенетической ветви 4.ANT: ГорноАлтайском высокогорном и Тувинском горном. В остальных девяти природных очагах на территории Российской Федерации эпизоотические проявления в 2020 г. маловероятны. Настоящий прогноз свидетельствует о возможности оптимизации использования кадровых и материальных ресурсов противочумных учреждений путем максимальной концентрации профилактических мероприятий на территориях эпизоотически активных природных очагов чумы. Отмечена необходимость внедрения в практику новой усовершенствованной классификации Y. pestis.

Тенденция повышения заболеваемости населения лихорадкой Западного Нила в Российской Федерации, зафиксированная в сезон 2018 г., сохранилась и в 2019 г. (показатель в 2 раза превысил среднемноголетний). Определены особенности проявлений эпидемического процесса ЛЗН в 2019 г.: ранняя регистрация случаев заболевания, активизация природных и природно-антропоургических очагов на территории Южного федерального округа (90 % от всей заболеваемости в Российской Федерации), увеличение доли нейроинвазивных форм, доминирование в структуре заболеваемости больных возрастной категории 50 лет и старше, позднее окончание эпидемического сезона. Установлено, что в сезон 2019 г. на европейской части России циркулировал 2 генотип вируса Западного Нила. На территории Волгоградской области выявлено одновременное присутствие в комарах Culex pipiens и Culex modestus вируса Западного Нила и вируса Синдбис. Показано, что наиболее значимыми факторами для прогнозирования эпидемиологической ситуации по лихорадке Западного Нила на территории Волгоградской области являются среднесезонная температура воздуха летом и среднемесячные показатели относительной влажности воздуха весеннего и летнего периодов; в Ростовской области – среднемесячные температуры воздуха весны и лета; в Астраханской области значимой корреляционной зависимости влияния рассматриваемых факторов на заболеваемость населения не установлено. Прогноз развития эпидемической ситуации в 2020 г. не исключает возможный рост заболеваемости на эндемичных по лихорадке Западного Нила территориях европейской части России и возникновение локальных вспышек в отдельных субъектах в случае совпадения комплекса благоприятных для вируса Западного Нила природно-климатических условий и социальных факторов.

Цель – проанализировать заболеваемость сибирским клещевым тифом (СКТ) в Российской Федерации в период с 2010 по 2019 год, астраханской пятнистой лихорадкой (АПЛ) и средиземноморской лихорадкой (СЛ) с момента официальной регистрации, дать прогноз развития эпидемического процесса при эндемических риккетсиозах на 2020 г. Материалы и методы. Проведен анализ заболеваемости СКТ, АПЛ и СЛ в России за периоды 2010–2019, 2013–2019 и 2014–2019 гг. соответственно в сопоставлении с результатами зоолого-энтомологических наблюдений. Результаты и обсуждение. Среднемноголетний показатель заболеваемости СКТ за 2010–2019 гг. в целом по России составил 1,1 ⁰ /₀₀₀₀ (ДИ₉₅ 1,05÷1,08) при отсутствии тенденции к изменению. Максимальная относительная инцидентность СКТ характерна для Сибирского федерального округа (СФО), где среднемноголетний показатель заболеваемости за 2010–2019 гг. составил 6,28 на 100 тыс. населения. На втором месте Дальневосточный федеральный округ (ДФО) – 5,17 ⁰ /₀₀₀₀, на третьем Уральский федеральный округ (УФО) – 0,1 ⁰ /₀₀₀₀. При оценке десятилетней динамики относительной инцидентности СКТ выявлена значимая тенденция к ее повышению в ДФО, стабилизации в СФО и к снижению в УФО. Достоверная тенденция к росту заболеваемости СКТ выявлена в Республике Алтай и Хабаровском крае. Значительный тренд к снижению заболеваемости СКТ отмечен в Забайкальском и Красноярском краях, Курганской области и Республике Хакасия. Выраженная тенденция к повышению заболеваемости средиземноморской лихорадкой выявлена в Республике Крым. В Астраханской области и Республике Калмыкия наметилась выраженная тенденция к снижению заболеваемости астраханской пятнистой лихорадкой.

Цель работы – проведение анализа и разработка метода прогнозирования заболеваемости вирусного гепатита А (ВГА) с использованием план-графика Вальда. Материалы и методы. В работе использовали официальные статистические данные Роспотребнадзора по заболеваемости ВГА в Российской Федерации и в Москве в период 2010–2016 гг. Результаты и обсуждение. В результате проведенного исследования установлено, что в Российской Федерации в период 2010–2016 гг. в общей структуре зарегистрировано 67,7 % случаев ВГА среди взрослого населения и 32,3 % среди детей; для взрослого населения в Москве заболеваемость составила 79,8 %, детского населения – 20,2 %. Для оценки эпидемиологической обстановки по ВГА предложена методика прогнозирования заболеваемости с использованием план-графика Вальда. По результатам проведенного анализа в Москве среди взрослого населения пороговый уровень заболевания составил 38 случаев, колебания показателей средних значений зарегистрированы от 48 до 63 случаев. Показано, что суммарно минимальный и максимальный уровни заболеваемости взрослого населения в 2017 г. составят 180 и 624 случая соответственно. Прогноз числа случаев заболеваний среди детского населения определен по нарастающему итогу: минимальный помесячный уровень – 7 случаев, максимальный – 17. Помесячный прирост заболеваний установлен в 0,9 случаев. Установлено, что возможность суммарных минимального и максимального уровней заболеваемости среди детей в 2017 г. составит 84 и 204 случая соответственно. Предложенный метод план-графика Вальда для прогнозирования заболеваемости ВГА позволит определить на предстоящий период как помесячное минимальное, так и максимальное число случаев заболеваний и обеспечит своевременное планирование проведения противоэпидемических мероприятий.

Цель исследования – филогеографический анализ штаммов Yersinia pestis основного подвида античного биовара филогенетической ветви 0.ANT, выделенных в XX – начале XXI вв. в очагах Тянь-Шаня и Памиро-Алая, для выяснения закономерностей пространственно-временной циркуляции возбудителя чумы на территории этих очагов. Материалы и методы. Проведен полногеномный SNPs-анализ штаммов Y. pestis античного биовара, выделенных в природных очагах чумы Кыргызской Республики в 1928–2016 гг. Филогенетический анализ выполнен на основе 1646 выявленных коровых SNPs у 51 включенного в анализ штамма различных филогенетических линий. Построение филогенетического дерева проводили с использованием алгоритма Maximum Likelihood, программы PHYML, модели HKY85. Результаты и обсуждение. Все 29 исследованных штаммов Y. pestis, выделенных в 1928–2016 гг. в очагах Тянь-Шаня и Памиро-Алая, относились к филогенетическим ветвям 0.ANT3 и 0.ANT5 античного биовара основного подвида. Штаммы 0.ANT3 получены преимущественно в Аксайском и Алайском очагах, а штаммы 0.ANT5 – в Верхненарынском и Сарыджазском очагах Тянь-Шаня. Штаммов филогенетических ветвей 0.ANT1 и 0.ANT2 в очагах Кыргызской Республики не выявлено. По результатам полногеномного SNP-анализа штаммов Y. pestis, выделенных в XXI в., установлена их принадлежность к филогенетической ветви 0.ANT5. К этой же ветви относится штамм, полученный от человека (летальный случай) в Сарыджазском очаге чумы в 2013 г. Генетическая однородность современных штаммов ветви 0.ANT5 и их широкое распространение по территории Сарыджазского и Верхненарынского очагов свидетельствуют о расширении ареала этой популяции античного биовара и активизации очагов Тянь-Шаня, вызванных потеплением климата. Впервые секвенированы геномы штаммов Y. pestis ветви 0.ANT5, выделенных в XXI в., включая клинический штамм 2013 г. Получена полногеномная последовательность штамма Y. pestis ветви 0.ANT3, вызвавшего вспышку легочной чумы в Тянь-Шане в 1928 г.

Цель. Определение микробиологическим методом эффективности дезинфекционных обработок фумигацией формальдегидом скрытых полостей и обратной стороны фильтров боксов микробиологической безопасности, расположенных в помещениях заразной зоны максимально изолированной лаборатории. Оценка эффективности работы экспериментальной установки для автоматизации процесса обработки формальдегидом лабораторных помещений. Материалы и методы. Оценка эффективности дезинфекционных обработок боксов микробиологической безопасности и помещений вирусологической лаборатории проводилась методом батистовых тест-объектов, контаминированных спорообразующей тест-культурой Bacillus thuringiensis. Результаты и обсуждение. Экспериментальным путем определено время обеззараживания, достаточное для полной инактивации особо опасных патогенных микроорганизмов, предположительно находящихся в скрытых полостях и на обратной стороне фильтров боксов микробиологической безопасности, расположенных в заразной зоне максимально изолированной лаборатории. В результате проведенных исследований удалось добиться полной инактивации спорообразующего тест-микроорганизма, находящегося на тест-объектах, размещенных в скрытых полостях и труднодоступных местах боксов микробиологической безопасности в концентрации 1·10⁶ клеток/см³ только при времени обеззараживания, равном 24 часам. Эффективное обеззараживание тест-объектов, контаминированных спорообразующей тест-культурой B. thuringiensis, размещенных в труднодоступных местах и на обратных сторонах оборудования в боксированном вирусологическом помещении, при использовании экспериментальной установки, производящей газообразный формальдегид, оказалось возможным только при использовании формалина в концентрации 40 мл/м³ помещения. В результате исследований установлено, что количество формалина, требуемое для достижения 100 % эффективности дезинфекционной обработки вирусологического боксированного помещения с помощью экспериментальной установки, производящей газообразный формальдегид, зависит от режима работы общеобменной приточно-вытяжной вентиляции, конфигурации лабораторного помещения, насыщенности его лабораторным и инженерным оборудованием.

Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом (ГЛПС) является актуальной угрозой санитарноэпидемиологическому благополучию населения Российской Федерации, занимая ведущее место в структуре заболеваемости природно-очаговыми инфекциями вирусной этиологии по стране. Наиболее неблагополучная ситуация по заболеваемости ГЛПС (более 80 % от общероссийской) наблюдается в субъектах Приволжского федерального округа (ПФО). Цель работы – дифференциация территории ПФО по уровню потенциальной эпидемической опасности природных очагов ГЛПС. Материалы и методы. В работе использована информация о заболеваемости ГЛПС по данным статистических форм отчетности № 1 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях» и данным об эпизоотической активности природных очагов ГЛПС из установленных форм обзоров и прогнозов состояния популяции и численности мелких млекопитающих за период 2014–2018 гг. Уровень потенциальной эпидемической опасности (ПЭО) оценивали в баллах по разработанной при участии авторов оригинальной методике. В качестве программного обеспечения использовали аналитическую платформу Deductor Professional и геоинформационную систему Arc GIS. Результаты и обсуждение. Среди субъектов ПФО крайне высокий уровень ПЭО по ГЛПС (6 баллов) установлен для Удмуртской Республики, республик Башкортостан, Татарстан, Мордовия и Чувашия. Высокий уровень ПЭО по ГЛПС (5 баллов) характерен для Самарской, Ульяновской, Нижегородской, Кировской, Саратовской, Оренбургской областей и Республики Марий Эл. Уровень ПЭО выше среднего (4 балла) по ГЛПС отмечен в Пензенской области, средний уровень ПЭО (3 балла) – в Пермском крае. Оперативное проведение комплекса неспецифических профилактических мероприятий на участках с выраженным ростом потенциальной эпидемической опасности по ГЛПС позволит значительно снизить уровень заболеваемости в ПФО и Российской Федерации в целом.

Цель – определение интенсивности циркуляции вируса Западного Нила в антропогенных биотопах на территории Саратовской области в 2012–2017 гг. Материалы и методы. Проведено изучение иммунной прослойки сельскохозяйственных животных в отношении данного вируса. Исследовано 1454 образца сывороток крови сельскохозяйственных животных из частных хозяйств и сельскохозяйственных кооперативов 14 районов области: 1111 образцов от лошадей и 343 образца от крупного рогатого скота. Сыворотки крови исследовали на наличие суммарных антител к ВЗН, используя зарегистрированную в Российской Федерации тест-систему для выявления антител к этому вирусу конкурентным иммуноферментным методом «ID Screen West Nile Competition Multispecies» («ID. Vet», Франция). Результаты и обсуждение. Уровень иммунной прослойки сельскохозяйственных животных к вирусу Западного Нила на территории Саратовской области за весь период изучения составил (14,0±0,9) %, в том числе у лошадей – (15,9±1,1) %, у крупного рогатого скота – (7,9±1,5) %. Наибольшие значения отмечены у лошадей. Высокий уровень иммунной прослойки сельскохозяйственных животных зафиксирован в районах, расположенных на левом берегу Волги: центральных – Энгельсском (36,4±5,5 %), Федоровском (29,0±4,6 %) и Советском (20,0±3,7 %); южных – Ровенском (74,3±5,3 %) и Краснокутском (15,7±4,4 %). Это подтверждает предположение о первоначальном проникновении вируса с приграничных территорий Волгоградской области на территорию левобережья, где имеются характерные околоводные биотопы, и происходила более активная циркуляция возбудителя. Полученные данные о выявлении иммунной прослойки сельскохозяйственных животных свидетельствуют о распространении вируса Западного Нила на территории изученных районов Саратовской области и, в частности, в антропогенных биотопах, что еще раз указывает на формирование здесь стойких природных и природно-антропоургических очагов лихорадки Западного Нила.

Цель исследования – анализ действующей нормативно-методической документации по вопросам безопасной работы с патогенными биологическими агентами (ПБА) III–IV групп патогенности. Материалы и методы. В работе использован аналитический метод. Проведен компаративный анализ положений действующих документов, утвержденных в разные сроки для разных ведомств, по вопросам оборудования систем очистки воздуха, использования боксов микробиологической безопасности, обеспечения лабораторий раковинами для мытья рук, проверки дезсредств, поступающих в лабораторию, и обеззараживания отходов. Результаты и обсуждение. В ходе анализа действующей документации рассмотрены положения, требующие доработки и уточнения в следующих изданиях санитарных правил. Большего внимания заслуживают два аспекта: проблема регламентирования устройства системы приточно-вытяжной вентиляции в лабораториях микробиологического профиля для работы с ПБА и проблема необходимости создания единой согласованной системы нормативной документации. Приведенные в статье примеры показывают необходимость соблюдения единого подхода к требованиям по обеспечению биобезопасности в документах различных ведомств, четких формулировок, согласованной системы нормативной и технической документации на лабораторное оборудование, определяющей основные характеристики боксов микробиологической безопасности и вентиляционных систем. Документы должны соответствовать требованиям различных ведомств. К обслуживанию инженерных систем должны привлекаться специалисты с соответствующим образованием на постоянной основе.

Цель – определение современных эпизоотических и эпидемических особенностей лихорадки Западного Нила на юге европейской части России. Материалы и методы. Использовались карты эпидобследования очага инфекционного заболевания, ежегодные итоговые донесения (2009–2018 гг.), а также сведения об эпизоотологическом мониторинге, предоставленные Управлениями Роспотребнадзора и ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии» в субъектах Южного и Северо-Кавказского федеральных округов. Применяли описательные, аналитические методы и ретроспективный эпидемиологический анализ. Результаты и обсуждение. Активность природного очага лихорадки Западного Нила на территории Европейского Юга России подтверждена результатами ежегодного эпизоотологического мониторинга, а также ежегодными эпидемическими проявлениями болезни. На долю данного региона в период 2009–2018 гг. пришлось 74,15 % случаев заболевания природно-очаговыми вирусными лихорадками и все крупные вспышки лихорадки Западного Нила в стране. Подавляющее число больных в регионе (97,8 %) выявляют в Волгоградской, Астраханской и Ростовской областях. В остальных субъектах юга России в период с 2009 по 2018 год наблюдалась редкая спорадическая заболеваемость, в совокупности составляющая 2,2 % от числа случаев в данном регионе страны. У больных преобладали клинические формы средней тяжести без поражения центральной нервной системы. В целом за 10 лет зафиксировано 7 случаев заболевания (0,58 %) с летальным исходом. В период 2009–2018 гг. установлено значительное расширение ареала вируса Западного Нила и активизация природных очагов этой инфекции на юге России. Эпизоотический и эпидемический центр лихорадки Западного Нила расположен в Волгоградской, Астраханской и Ростовской областях, что подтверждено стойким эпизоотическим и эпидемическим неблагополучием. Современной особенностью лихорадки Западного Нила на Европейском Юге России является регистрируемая в последние 10 лет относительно низкая для этой болезни летальность (0,58 %).

Цель – анализ происхождения ctxAB^– tcpA⁺ Vibrio cholerae О1 El Tor из поверхностных водоемов на неэндемичной по холере территории, а также их филогенетического родства с различными по эпидемической значимости группами штаммов на основе исследования структуры генов жизнеобеспечения и полных геномов. Материалы и методы. В исследование включено 25 штаммов V. cholerae, выделенных в Сибири и на Дальнем Востоке, в том числе два ctxAB^– tcpA⁺ штамма из поверхностных водоемов (Алтайский край, 2011 г.; Хабаровский край, 2013 г.). Для филогенетического анализа использованы геномы 36 штаммов V. cholerae из GenBank. MLST проводилось по генам dnaE, cat, lap, pgm, recA, gyrB, chi, MLST in silico – по генам adk, gyrB, metE, mdh, pntA, purM, pyrC. Реконструкция филогении осуществлялась на основании анализа SNP в геномах V. cholerae с использованием программы PhyML 3.0. Результаты и обсуждение. При MLST ctxAB^– tcpA⁺ V. cholerae О1 El Tor из поверхностных водоемов формируют самостоятельный генотип в группе токсигенных штаммов и спонтанных мутантов токсигенных штаммов. В in silico MLST ctxAB^– tcpA⁺ изоляты демонстрируют принадлежность к SТ75, характерному для US Gulf филогенетической линии. При SNP-типировании штаммы ctxAB^– tcpA⁺ из поверхностных водоемов вошли в группу, основание которой представлено US Gulf V. cholerae, а изолят из Хабаровска (2013 г.) демонстрирует высокий уровень гомологии генома с US Gulf-подобным штаммом, выделенным в Китае (2009 г.). Установлена идентичность организации острова патогенности VPI-1 у штаммов из Хабаровска и Китая, а также наличие у них острова пандемичности VSP-I. Результаты свидетельствуют о принадлежности ctxAB^– tcpA⁺ V. cholerae из поверхностных водоемов Сибири и Дальнего Востока к US Gulf филогенетической линии и, в совокупности с данными эпидемиологического анализа, позволяют судить об их завозном происхождении.

Цель работы – изучение молекулярно-генетической структуры изолятов вируса гепатита D, циркулирующих в регионе с высокой распространенностью суперинфекции вирусного гепатита (ВГ) В+ВГD. Материалы и методы. Материалом исследования послужили 64 образца сыворотки крови, полученные от жителей Кыргызской Республики, больных хроническим вирусным гепатитом В+D. Проводили секвенирование полных геномов вируса гепатита D с последующим филогенетическим анализом. Результаты и обсуждение. На основании филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей 64 образцов ВГD показано, что в обследованной группе преобладает вирус генотипа 1 (96,9 %), по сравнению с генотипом 2 (3,1 %). Полученные нуклеотидные последовательности полных геномов изолятов вируса гепатита Дельта депонированы в международную базу данных GenBank под номерами MN984407–MN984470. При оценке дивергенции исследуемых образцов генотипа 1 максимальное генетическое расстояние составило 12,49 %, а минимальное – 7,41 %, при этом, в пределах отдельных кластеров генетическое расстояние составляло от 2,6 до 8,5 %. Среди последовательностей, представленных в базе данных GenBank, наибольшее сходство с обнаруженными нами образцами ВГD-2 Kyr41 и Kyr43 (нуклеотидная идентичность 92,31 и 89,57 % соответственно) показано для вируса, описанного ранее в Якутии (AJ309880). Для исследования генетических взаимоотношений между анализируемыми вирусными штаммами генотипа 1 изучили предсказанную аминокислотную последовательность (111–214). Хотя профилактические меры против гепатита B, включая вакцинацию, привели к снижению распространенности гепатита D, не существует эффективного способа предотвращения этой инфекции у носителей ВГВ в эндемичных районах. Молекулярно-генетическая характеристика и филогенетический анализ последовательностей ВГD, представленные в настоящем исследовании, будут способствовать идентификации путей передачи патогена для контроля и/или предотвращения распространения инфекции.

Цель работы – выявление циркуляции возбудителя чумы и других зоонозов (туляремии, псевдотуберкулеза, лептоспироза, лихорадки Западного Нила, лихорадки денге, лихорадки Чикунгунья, Крым-Конго геморрагической лихорадки, лихорадки Ку, лихорадки Ласса, хантавирусов, клещевого энцефалита, моноцитарного эрлихиоза, гранулоцитарного анаплазмоза и боррелиоза) среди мелких млекопитающих и их эктопаразитов на территории семи северных провинций Социалистической Республики Вьетнам. Материалы и методы. Проведено эпизоотологическое обследование семи северных провинций Социалистической Республики Вьетнам (Дьенбьен, Лайтяу, Лаокай, Хазянг, Лангшон, Каобанг и Куангнинь). За период работы накоплено 3400 ловушко/ночей, добыто 179 экземпляров мелких млекопитающих, относящихся к 10 видам, собрано 213 блох, относящихся к семи видам, и 143 экземпляра гамазовых клещей двух видов. Собранный материал исследован методами иммуноферментного анализа и полимеразной цепной реакции на базе мобильной лаборатории мониторинга и диагностики. Результаты и обсуждение. При двукратном исследовании 136 проб крови мелких млекопитающих выявлены антитела к фракции 1 Y. pestis в 14 (10,3 %) пробах. Исследование 158 проб суспензий легких и почек мелких млекопитающих показало, что в 22 (13,9 %) образцах содержится 16S рРНК патогенных лептоспир Leptospira spp. При анализе 60 проб мозга мелких млекопитающих на наличие Leptospira spp. в трех (5,0 %) из них обнаружен возбудитель лептоспироза. Исследовано 25 проб гамазовых клещей на наличие ДНК возбудителей лихорадки Ку, чумы, туляремии и гранулоцитарного анаплазмоза, РНК возбудителя клещевого энцефалита, моноцитарного эрлихиоза, боррелиоза. В одной (4 %) пробе от гамазовых клещей Laelaps echidninus обнаружена РНК боррелий.

Памяти Микшис Наталья Ивановны.

Памяти Васенина Альфреда Семеновича.