В статье проанализированы особенности эпизоотологии и эпидемиологии чумы на о. Мадагаскар в 1898-2010 гг., выполнен анализ развития вспышек легочной чумы 2011 г. Обобщены данные литературы и собственных экспериментальных исследований, характеризующих свойства штаммов Yersinia pestis, выделенных на о. Мадагаскар в XX столетии. Подтверждена циркуляция здесь штаммов Y. pestis, представляющих собой третью ветвь иррадиации ее восточного биовара (1.ORI3) Обоснована возможность появления здесь новых вариантов с измененными свойствами, в том числе с множественной лекарственной устойчивостью.

В работе представлен впервые разработанный алгоритм оценки уровня профессиональной подготовленности персонала, допускаемого к работам с патогенными биологическими агентами I-II групп. Определены содержание, требования к организации и порядок оценки показателей, определяющих наличие профессиональных знаний и навыков, необходимых для безопасного, качественного и эффективного выполнения должностных обязанностей.

Ландшафтно-географические и климатические особенности Ставропольского края, высокая численность клещей и комаров, разнообразный видовой состав диких млекопитающих и птиц, развитое животноводство и инфраструктура создают благоприятные условия не только для циркуляции арбовирусов и хантавирусов, но и возможности развития заболеваний инфекциями вирусной этиологии, вызывающими в ряде случаев серьезные эпидемические осложнения. В настоящее время на территории Ставропольского края активно функционирует природный очаг КГЛ, кроме того, выявлено наличие возбудителей лихорадки Западного Нила, клещевого энцефалита, лихорадки Батаи и антител к ним, а также возбудителя геморрагической лихорадки с почечным синдромом.

На модели чумного эпизоотического процесса в поселении больших песчанок (Rhombomys opimus) показано, что эпизоотия чумы может развиваться при низком уровне эпизоотического контакта. При этом величина эпизоотического участка и количество «зараженных» колоний будет слишком мало для выявления эпизоотии при стандартном эпизоотологическом обследовании.

Для обоснования мер по обеспечению биобезопасного функционирования мобильных лабораторий (МЛ) специализированных противоэпидемических бригад (СПЭБ) применен набор рискологических методик, заимствованных из других отраслей и рекомендуемых для оценки биологической опасности и риска при работе с патогенными биологическими агентами. Полученные данные представляют основу для управления биориском при функционировании МЛ СПЭБ.

Высокая защитная эффективность фильтров (фильтр-элемент тонкой очистки, ФЭТО), используемых в системах вентиляции микробиологических лабораторий, является важным элементом обеспечения биологической безопасности. Перед их использованием предусмотрена проверка на стендовых установках. Существующие модели этих установок позволяют проверить за рабочий день не более 8 фильтров, требуют значительных физических усилий. Предлагаемая автоматизированная установка позволяет проверить до 33 фильтр-элементов за рабочую смену, значительно снижая физические нагрузки работающего персонала.

Проведено исследование признака пигментации у 214 штаммов чумного микроба и 68 псевдотуберкулезного микроба. Выявлено, что штаммы чумного микроба разных подвидов и псевдотуберкулезного микроба проявляют разную способность к сорбции гемина и кислых красителей. Проведен ПЦР-анализ и определение нуклеотидной последовательности генов hms-оперона у типовых штаммов пяти подвидов и таласской группы штаммов чумного микроба и штамма O1 серотипа псевдотуберкулезного микроба. Выявлены единичные нуклеотидные замены во всех генах оперона штаммов чумного микроба по сравнению с опероном штаммов псевдотуберкулезного микроба. Определены единичные нуклеотидные замены, перспективные для внутривидовой дифференциации штаммов чумного микроба.

Разработан способ идентификации и внутривидового типирования штаммов чумного микроба с определением их потенциальной вирулентности. Показана возможность внутривидовой дифференциации и определения очаговой принадлежности изученных штаммов чумного микроба в монолокусной VNTR-ПЦР и выявления основных детерминант вирулентности (области пигментации хромосомы и гены плазмиды кальцийзависимости) в мультиплексной ПЦР.

С помощью DFR-типирования [6] набора из 275 штаммов Y. pestis, выделенных преимущественно в природных очагах чумы стран СНГ, определены «геномовары» (DFR-типы), характерные для 27 очагов. Выявлено 64 новых DFR-типа Y. pestis (из 96, описанных к настоящему времени) и установлено, что на территории стран СНГ и в Монголии циркулирует не менее 56 геномоваров. Показано, что все исследованные методом DFR-типирования штаммы кластеризуются в соответствии с филогенетической схемой, предложенной на основании данных сочетанного SNP- и IS100-типирования [1], и дифференцируются до уровня подвидов, популяций и даже штаммов, циркулирующих на территории определенных природных очагов.

Для детекции интегронов класса 1 у Burkholderia pseudomallei, B. mallei и B. thailandensis использована ПЦР с праймерами, специфичными фланкирующим последовательностям области вставки генных кассет и 3'-консервативному сегменту интегронов. Последовательности 3'-сегмента In1 обнаружены у половины исследованных штаммов B. pseudomallei. Размер области кассетной вставки интегронов у B. pseudomallei составил 2300 п.н. (1 штамм), 500 и 900 п.н. (1 штамм) и 120 п.н. (2 штамма). Секвенирование ампликонов 3'-сегмента показало наличие генов qacEdelta1 и sul1 - детерминант устойчивости к четвертичным аммонийным соединениям и сульфонамидам соответственно.

Представлен обзор литературных данных о недавно открытой системе кластрированных, равномерно удаленных друг от друга коротких палиндромных повторов, или системе CRISPR, которая участвует в защите от проникновения чужеродной генетической информации у прокариот. Описаны особенности строения и функции CRISPR, а также предполагаемый механизм действия. Также представлены данные о наличии этой системы у возбудителей особо опасных инфекций и возможности ее использования для молекулярного типирования.

Разработан алгоритм оценки качества противохолерных вакцин, базирующийся на возможности применения методов количественного учета формализованных признаков, характеризующих патологический или адаптивный процесс в кишечнике иммунизированных лабораторных животных. В качестве формализованных признаков отобраны показатели: количество межэпителиальных лимфоцитов (МЭЛ), морфофункциональное состояние апудоцитов и бокаловидных клеток. Для взаимосвязанной оценки отдельных звеньев гомеостаза, морфометрические параметры представлены в виде ассоциаций показателей в форме индексов и коэффициентов. Установлено, что если определяемые показатели не выходят за определенные у соответствующих контролей пределы, то состояние адаптации организма и изменения, описываемые при гистологическом исследовании, рассматриваются как доброкачественные, характеризующие безвредность или эффективность испытуемых противохолерных вакцин.

Получены экспериментальные препараты липополисахарида (ЛПС) Francisella tularensis четырех подвидов: tularensis, holarctica, mediasiatica, novicida методом твин-экстракции. Дана физико-химическая характеристика полученных препаратов. Изучено влияние ЛПС возбудителя туляремии разных подвидов на фагоцитарное звено иммунитета экспериментальных животных в условиях in vitro. Показано, что биомолекулы ЛПС проявляют слабое стимулирующее воздействие на кислород- и нитроксидзависимые бактерицидные системы и не обладают цитопатогенетическим свойством для активации апоптоза фагоцитов. Полученные результаты позволяют предположить, что такая инертность ЛПС возбудителя туляремии обусловлена особенностями его строения.

Для типирования штаммов V. cholerae, депонированных в музее микробных культур ФГУ «48 ЦНИИ Минобороны России», применен метод мультилокусного VNTR-анализа. Выбраны наиболее информативные локусы и фланкирующие их праймеры, составлены VNTR-профили и проведен анализ аллельного разнообразия исследованных штаммов, выпущены лабораторные серии тест-системы. Разработанная тест-система может быть использована для мониторинга эпидобстановки, при проведении эпидемиологических расследований, а также для паспортизации коллекционных штаммов.

Модернизирована ранее разработанная элективно-дифференциальная среда для культивирования V. cholerae. Показано, что модернизированная среда (СЭДХ-М) обладает необходимой чувствительностью и показателем прорастания. Рост на ней E. coli ингибировался полностью, а P. vulgaris - в значительной степени. Среда имеет выраженные дифференцирующие свойства: оранжевые колонии холерного вибриона четко отличаются от колоний сопутствующей микрофлоры. В лабораторных испытаниях среда СЭДХ-М продемонстрировала некоторые преимущества перед референс средой TCBS при выделении V. cholerae из контаминированных фекалий.

В обзоре представлены данные о применении методов УФ спектроскопии, спектроскопии в видимом диапазоне, ИК спектроскопии при проведении неспецифической индикации патогенных биологических агентов; ИК Фурье спектроскопии, Раман спектроскопии при их идентификации. Рассмотрены преимущества, недостатки и перспективы использования различных методов спектроскопии при мониторинге окружающей среды на наличие патогенных биологических агентов.

Данная работа является продолжением ранее проводимых на территории Саратовской области исследований сывороток крови людей с целью выявление специфических антител к арбовирусам. В работе представлены результаты исследований сывороток крови людей и сельскохозяйственных животных, собранных в различных природно-климатических зонах Саратовской области, на наличие иммуноглобулинов класса G к вирусам Тягиня, Батаи, Синдбис, а также клещевого энцефалита, ККГЛ и лихорадки Западного Нила.

Представлены данные по изучению физико-химических и биологических характеристик лиофилизированной формы гетерологичного антирабического иммуноглобулина. Проведен сравнительный анализ свойств сухой и исходной жидкой формы иммуноглобулина. Установлено, что лиофилизат сохраняет основные свойства в процессе длительного хранения.

Впервые для изготовления диагностического препарата чумного бактериофага Л-413С были использованы новые питательные среды на основе автолизата пекарских дрожжей. Экспериментальные среды обеспечивали высокую концентрацию фаговых частиц на этапе размножения и хорошую выживаемость при лиофилизации. Большую эффективность показали среды, в которых дрожжевой автолизат являлся питательной белковой основой, а не стимулирующей добавкой. Такие препараты сохраняли стабильность свойств в процессе хранения при температуре 4-8 °С, а также при повышенной температуре в «тесте ускоренного старения». Внедрение дрожжевых питательных сред в технологию изготовления бактериофага диагностического чумного Л-413С открывает хорошие перспективы для повышения эффективности производства и снижения себестоимости препарата.

Показана возможность применения метода ультрафильтрации по принципу «кросс-флоу» для концентрирования О-антигена штамма холерного вибриона М-41 Огава из безмикробного центрифугата. Проведена оптимизация технологического процесса концентрирования. Отработаны режимы консервации и очистки ультрафильтрационной установки. Определены перспективы внедрения метода ультрафильтрации по принципу «кросс-флоу» в технологию производства холерной бивалентной химической вакцины.