Клещевой вирусный энцефалит – природно-очаговое инфекционное заболевание с поражением центральной нервной системы, вызываемое одноименным вирусом, переносимым несколькими видами иксодовых клещей. Природные очаги клещевого вирусного энцефалита (КВЭ) широко распространены в лесной, лесостепной ландшафтной зоне умеренного климатического пояса на обширной территории Евразии от Атлантического до Тихого океана. Недавно выявлены новые эндемичные по КВЭ территории в Японии, Нидерландах, а в 2019 г. – в Великобритании. Возрастающий риск заболевания в связи с развитием туризма и посещением природных очагов КВЭ стал международной проблемой общественного здравоохранения. Цель работы – выявить современные особенности динамики заболеваемости КВЭ в Российской Федерации, состояние лабораторной диагностики, профилактики и дать прогноз заболеваемости на 2021 г. Показано, что в России сохранился тренд на снижение заболеваемости КВЭ, наблюдавшийся в последние годы. Отличительной особенностью эпидемического сезона 2020 г. является значительное снижение случаев КВЭ: в 33 субъектах Российской Федерации (РФ) зарегистрировано 989 случаев болезни (показатель заболеваемости – 0,67 на 100 тыс. населения). Резкое снижение числа случаев КВЭ в 2020 г. по сравнению с 2019 г. на фоне снижения объемов вакцинации может быть объяснено наряду с природными факторами введением ограничительных мер во время эпидемии COVID-19. Отражена динамика заболеваемости, обращаемости населения в медицинские организации по поводу присасывания клещей, вирусофорности переносчика, объемов вакцинации, серопрофилактики, акарицидных обработок. Показан охват экспресс-диагностикой клещей на маркеры ассоциированных с ними возбудителей и ее доступность для населения. Признано, что эпидемиологическая ситуация по КВЭ в РФ остается неблагополучной. Она требует постоянного внимания со стороны учреждений здравоохранения и Роспотребнадзора и принятия управленческих решений, направленных на дальнейшее снижение заболеваемости путем совершенствования мер профилактики, особенно в субъектах, характеризующихся высокой инцидентностью КВЭ, мониторинга природных очагов, совершенствования профилактики и лечения КВЭ. Представлен прогноз заболеваемости на 2021 г. и значений 95 % доверительного интервала возможных колебаний показателя с учетом наличия или отсутствия трендов ее изменения на территории федеральных округов и субъектов РФ в 2011–2020 гг.

В обзоре представлен анализ эпидемиологической и эпизоотологической ситуации по Крымской геморрагической лихорадке (КГЛ) в Российской Федерации в 2020 г., в течение которого зарегистрировано 32 случая заболевания КГЛ, что является минимальным показателем с начала активизации природного очага КГЛ в 1999 г. Уровень летальности составил 3,1 %. Заболеваемость регистрировалась в Ростовской, Астраханской областях, Ставропольском крае, республиках Дагестан и Калмыкия, отмечено значительное снижение уровня заболеваемости КГЛ во всех субъектах Южного и Северо-Кавказского федеральных округов. Выявлен завозной случай КГЛ в г. Москве из Республики Крым. Сезонность заболеваемости, профессиональный, возрастной состав больных КГЛ, пути передачи возбудителя инфекции, особенности клинического течения болезни в 2020 г. соответствовали данным многолетних наблюдений. Эпизоотологический мониторинг территории природного очага КГЛ показал, что в 2020 г. на стационарных точках наблюдения численность имаго Hyalomma marginatum и процент положительных на наличие маркеров вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки (вируса ККГЛ) пулов иксодовых клещей соответствовали среднемноголетним показателям, что свидетельствует о сохраняющемся эпизоотологическом неблагополучии территории природного очага КГЛ в России. Сохраняющиеся высокие показатели численности и инфицированности клещей H. marginatum могут способствовать развитию неблагоприятной эпидемиологической обстановки на юге Российской Федерации с возможным ростом заболеваемости КГЛ в России в 2021 г.

Целью обзора является характеристика современной эпидемиологической и эпизоотологической ситуации в природных очагах хантавирусных болезней в разных регионах мира, анализ литературных данных. В настоящее время хантавирусные болезни являются весьма актуальной угрозой санитарно-эпидемиологическому благополучию населения во всем мире, которая может серьезно осложнить эпидемиологическую ситуацию. Ежегодно во всем мире регистрируется около 200 тыс. случаев заболевания, при этом интенсивность и динамика заболеваемости значительно варьируют в разных регионах мира. В то время как в Китае – стране с наибольшим ежегодным количеством случаев заболевания во всем мире – общая динамика заболеваемости приобретает тенденцию к снижению, что, по-видимому, связано с широким применением средств специфической профилактики болезни, число случаев заболевания в европейских странах, наоборот, показывает явный рост. В Российской Федерации в настоящее время геморрагическая лихорадка с почечным синдромом (ГЛПС) является наиболее распространенной природно-очаговой болезнью вирусной этиологии. Данные о распространении хантавирусной инфекции в регионах Юго-Восточной Азии и Африканского континента требуют дальнейшего изучения, однако вполне очевидно, что хантавирусная инфекция является недооцененной проблемой общественного здравоохранения в этих регионах, а ее масштабы, в связи с широким распространением носителей, могут быть гораздо значительнее, чем известно на сегодняшний день.

Цель обзора состоит в оценке тенденции развития эпизоотической активности на различных территориях Российской Федерации для выявления регионов повышенного риска заражения населения возбудителем туляремии в 2021 г. и для планирования и проведения в этих субъектах высокоприоритетных мероприятий, таких как вакцинация, инвестиции в инфраструктуру водоснабжения, санитарии и гигиены, эпизоотологического мониторинга природных очагов и других мероприятий, направленных на подавление активности природных очагов и развитие невосприимчивости населения к данной инфекции. На территории Российской Федерации в 2020 г. зарегистрирован 41 случай инфицирования человека возбудителем туляремии, 60 % из которых приходится на Северо-Западный федеральный округ. Эпизоотические проявления инфекции различной степени интенсивности выявлены в 55 субъектах Федерации. На этом фоне спорадические случаи заболевания людей туляремией зарегистрированы в 14 регионах страны. Максимально выраженные эпидемические осложнения продолжаются на территории Карелии – 23 больных. Выделено 12 культур Francisella tularensis subsp. holarctica из объектов окружающей среды в Вологодской (3), Ростовской областях (6), в Ханты-Мансийском автономном округе (2) и в Санкт-Петербурге (1). На основании анализа представленных данных наиболее вероятны в 2021 г. эпидемические осложнения в виде спорадических случаев заболевания среди невакцинированного населения на территориях: Центрального федерального округа – в Орловской, Рязанской и Ярославской областях, а также в Москве; СевероЗападного федерального округа – в Архангельской и Ленинградской областях, Республике Карелия и в СанктПетербурге; Приволжского федерального округа – в Татарстане, Мордовии, Чувашии, Кировской и Оренбургской областях; Уральского федерального округа – в Ханты-Мансийском, Ямало-Ненецком автономных округах и Тюменской области; Сибирского федерального округа – в Новосибирской, Кемеровской, Томской и Омской областях, а также в Алтайском крае; Дальневосточного федерального округа – на отдельных территориях Камчатского и Хабаровского краев.

Цель работы – на основе данных мониторинга и анализа заболеваемости в мире за период 2011–2020 гг. дать оценку эпидемиологической ситуации по холере в 2020 г. и прогноз на 2021 г. За период с 2011 по 2020 год в 97 странах мира зарегистрировано 4413988 случаев холеры с общей тенденцией к снижению заболеваемости (коэффициент достоверности аппроксимации R²  – 0,5705). Однако в связи с продолжением эпидемических проявлений холеры в эндемичных странах Азии, Африки и Америки эпидемиологическая ситуация по холере на этих континентах в 2020 г. характеризовалась как неблагополучная. Отмечено появление среди эпидемически опасных штаммов Vibrio cholerae О1 новой, «постгаитянской» линии. В 2020 г. на территории РФ эпидемически опасных штаммов V. cholerae О1, О139 от людей не выделено. Из объектов окружающей среды изолировано 25 нетоксигенных штаммов V. cholerae О1 El Tor, восемь из которых (ctxА-, tcpА+), по данным ПЦР-INDEL-типирования и SNP-анализа сиквенсов, принадлежали к клональному комплексу. Результаты анализа биологических свойств и филогенетических связей между выделенными нетоксигенными штаммами являются основой для оценки эпидемиологической ситуации по холере в России в 2020 г. как стабильной и аналогичного прогноза ее развития в 2021 г. При этом нельзя исключить вероятность завоза этой инфекции из эндемичных стран и необходимость проведения комплекса дифференцированных противоэпидемических (профилактических) мероприятий в рамках государственного санитарно-эпидемиологического надзора с целью локализации и ликвидации завозного очага и недопущения распространения инфекции. 

Целью работы является обоснование прогноза эпидемиологической и эпизоотологической ситуации в природных очагах чумы Российской Федерации, стран ближнего и дальнего зарубежья на 2021 г. Дана характеристика распространения штаммов Yersinia pestis основного подвида (subspecies pestis) средневекового и античного биоваров, кавказского (ssp. caucasica) и центральноазиатского (ssp. central asiatica) подвидов по 45 природным очагам стран СНГ. Отмечено сохранение в текущем десятилетии разнонаправленной тенденции в динамике эпизоотической активности природных очагов стран СНГ с циркуляцией штаммов Y. pestis pestis средневекового биовара филогенетической ветви 2.MED1 и античного биовара филогенетических ветвей 0.ANT5, 4.ANT. Для Российской Федерации в 2021 г. прогнозируется развитие эпизоотий в Горно-Алтайском высокогорном и Тувинском горном природных очагах, обусловленных циркуляцией штаммов Y. pestis pestis античного биовара 4.ANT и Y. pestis алтайского биовара центральноазиатского подвида 0.PE4a. Для Республики Казахстан отмечена высокая вероятность сохранения эпизоотической активности в Северо-Приаральском, Приаральско-Каракумском, Прибалхашском, Мойынкумском, Таукумском пустынных и Илийском межгорном природных очагах с циркуляцией штаммов Y. pestis pestis средневекового биовара филогенетической ветви 2.MED1. Для Кыргызской Республики обоснован прогноз на развитие эпизоотий чумы, обусловленных штаммами Y. pestis pestis античного биовара филогенетической ветви 0.ANT5 в Сарыджазском и Верхненарынском высокогорных природных очагах. Отмечена высокая эпидемическая опасность эпизоотических проявлений, обусловленных высоковирулентными штаммами Y. pestis pestis античного биовара 0.ANT5, 4.ANT и средневекового биовара 2.MED1 для всей территории стран СНГ. Отмечена актуальность внедрения в практику прогнозов эпидемиологической обстановки, с учетом молекулярно-генетических и эпидемиологических характеристик штаммов Y. pestis, циркулирующих на участках ожидаемых эпизоотических проявлений чумы.

В работе представлен анализ заболеваемости лихорадкой Западного Нила в Российской Федерации в 2020 г., обобщены результаты и обозначены проблемные вопросы мониторинга за возбудителем. Проявления лихорадки Западного Нила в 2020 г. характеризовались низким уровнем заболеваемости (в 10 раз ниже среднемноголетнего значения) с регистрацией спорадических случаев на эндемичных территориях Южного (9 случаев) и Центрального (1 случай) федеральных округов. Показано несоответствие структуры заболеваемости (распределение по возрасту, полу, социальному статусу) тенденциям, сложившимся в России в последние годы. В целом анализ официально зарегистрированных случаев заболевания не характеризует эпидемический процесс по лихорадке Западного Нила в России в сезон 2020 г. Обобщенные результаты мониторинга циркуляции вируса Западного Нила в объектах внешней среды в 2020 г. свидетельствуют о снижении эффективности его проведения и низкой выявляемости маркеров возбудителя. Установлено сокращение объемов диагностических исследований по активному выявлению больных лихорадкой Западного Нила в эпидемический сезон (в 5,7 раза по сравнению с 2019 г.), а также серологического обследования выборочных групп здорового населения (в 1,6 раза). Результаты молекулярно-генетического исследования возбудителя показали, что на территории европейской части России циркулировал второй генотип возбудителя. Установлена циркуляция четвертого генотипа вируса в энзоотическом цикле в Республике Калмыкия. Получены последовательности геномов 11 изолятов вируса Западного Нила, выделенных в 2019 и 2020 гг. В результате филогенетического анализа показано, что все изоляты, выделенные в Волгоградской области, и изоляты из Ростовской и Астраханской областей принадлежат к волгоградской кладе второго генотипа вируса Западного Нила. На основании оценки абиотических и биотических факторов обоснованы возможные локальные подъемы заболеваемости лихорадкой Западного Нила в 2021 г. в субъектах Южного и Северо-Кавказского федеральных округов и на юге Западной Сибири.

Цель обзора – проанализировать заболеваемость сибирским клещевым тифом (СКТ) в Российской Федерации в период с 2010 по 2020 год, астраханской пятнистой лихорадкой (АПЛ) и средиземноморской лихорадкой (СЛ) с момента официальной регистрации, дать прогноз развития эпидемического процесса при клещевых риккетсиозах на 2021 г. Проведен анализ заболеваемости СКТ, АПЛ и СЛ в России за периоды 2010–2020, 2013–2020 и 2014–2020 гг. соответственно, дан прогноз заболеваемости эндемическими риккетсиозами в европейской и азиатской частях России на 2021 г. Среднемноголетний показатель заболеваемости СКТ за 2010–2020 гг. в целом по России составил 1,04 (ДИ₉₅ 1,02÷1,05) ⁰/₀₀₀₀ при отсутствии тенденции к изменению. Максимальная относительная инцидентность СКТ характерна для Сибирского федерального округа (СФО), где среднемноголетний показатель заболеваемости за 2010–2020 гг. составил 6,20 (ДИ₉₅ 6,08÷6,31) на 100 тыс. населения. На втором месте Дальневосточный федеральный округ (ДФО) – 4,70 (ДИ₉₅ 4,53÷4,87) ⁰/₀₀₀₀, на третьем – Уральский федеральный округ (УФО) – 0,08 (ДИ₉₅ 0,07÷0,10) ⁰/₀₀₀₀. При оценке 11-летней динамики относительной инцидентности СКТ по федеральным округам выявлена тенденция к ее стабилизации в СФО и ДФО. В УФО выявлена значимая тенденция к ее снижению. Тенденция к росту заболеваемости по СКТ сохранилась в Республике Алтай. Значительный тренд к снижению заболеваемости СКТ сохранился в Курганской области, Забайкальском и Красноярском краях и Республике Хакасия. В Астраханской области и Республике Калмыкия наметилась тенденция к снижению заболеваемости астраханской пятнистой лихорадкой. В Республике Крым и г. Севастополе отсутствует тренд к повышению заболеваемости средиземноморской лихорадкой.

Проведен обзор эпизоотологической и эпидемиологической обстановки по сибирской язве в мире в 2020 г. В Российской Федерации зарегистрировано пять случаев заболевания людей кожной формой сибирской язвы в субъекте Северо-Кавказского федерального округа – Республике Дагестан. Напряженная ситуация по инфекции отмечена на территории приграничных государств – Азербайджана, Грузии, Казахстана, Кыргызстана и Украины. Эпизоотии сибирской язвы среди сельскохозяйственных и диких животных определены главным образом в странах Африки, при этом наибольшее количество подтвержденных случаев заболевания людей выявлено в Африке (Зимбабве, Кения) и Азии (Индонезия). Инфицирование людей возбудителем сибирской язвы связано прежде всего с приемом в пищу мяса больных и павших сибиреязвенных животных, контактом с животными при проведении вынужденного убоя, снятии шкур, обработкой контаминированного мяса. Уровень заболеваемости сибирской язвой на территории субъектов Российской Федерации в 2021 г. будет обусловлен комплексом запланированных объемов профилактических мероприятий и при условии их надлежащего выполнения ограничится выявлением спорадических случаев инфекции, которые потенциально возможны в пределах отдельных регионов России.

Цель работы – сравнение рисков вертикальной передачи вирусов гепатитов B (ВГВ) и C (ВГС), а также вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) в Гвинейской Республике.

Материалы и методы. Материалом исследования служили 305 образцов плазмы крови беременных женщин, проживающих на территории г. Conakry, Гвинейская Республика. Образцы обследовали на наличие серологических (HBsAg, антитела анти-HBs IgG, анти-HBcore IgG, анти-HCV IgG, Ag/Ab-HIV) и молекулярных (ДНК ВГВ, РНК ВГС, РНК ВИЧ) маркеров.

Результаты и обсуждение. При оценке общей распространенности серологических маркеров среди пациентов встречаемость маркеров ВГВ составила 76,06 %. Антитела к ВГС выявлены только в одном случае, что составило 0,32 %. Маркеры ВИЧ выявлены в трех случаях, что составило 0,98 %. В анализируемой группе распространенность HBsAg достоверно отличалась между группами беременных в возрасте 13–19 лет (17,33 %) и 20–24 лет (12,12 %), p<0,0001, RR=5,107 при 95 % ДИ: 2,458–10,612. При оценке общей распространенности молекулярно-биологических маркеров среди пациентов РНК ВИЧ не выявили, у одной пациентки определили РНК ВГС, что составило 0,32 %, в то время как встречаемость ДНК ВГВ составила 20 %. Среди HBsAg-позитивных лиц ДНК ВГВ выявили у 86,11 %, что составило 10,16 % от общей группы. Среди HBsAg-негативных лиц ДНК ВГВ выявили у 11,15 % (9,84 % от общей группы). Отметим, что в девяти случаях ДНК ВГВ выявили при отсутствии каких-либо серологических маркеров, что составило 14,75 %, т.е. 2,95 % от общей группы. Оценка распространенности гемоконтактных инфекций у беременных значима для последующей идентификации путей передачи патогенов с целью контроля и/или предотвращения распространения инфекции.

Цель – генотипирование методом мультилокусного сиквенс-типирования (MLST) и проведение филогенетического анализа выборки из 40 штаммов Bacillus anthracis, выделенных на территории России и сопредельных государств.

Материалы и методы. В работе осуществлена сборка последовательностей семи генов домашнего хозяйства штаммов B. anthracis на основе данных полногеномного секвенирования нового поколения, после чего описаны выявленные мутации и их координаты. Полученные последовательности использованы для генотипирования исследуемой выборки методом MLST. Результаты сравнены с данными, представленными в базе данных PubMLST. Филогенетический анализ проведен для слитых in silico последовательностей семи локусов выявленных сиквенс-типов. Для построения дендрограмм использован программный пакет MEGA 7.0.

Результаты и обсуждение. В исследованной выборке обнаружено два сиквенс-типа (ST): 35 штаммов относились к ST-1, а пять штаммов, отличающихся одной общей мутацией в локусе glpF, – к ST-3 (согласно кодировке PubMLST), что подчеркивает генетическую обособленность данной группы штаммов. У одного штамма обнаружена уникальная мутация в гене gmk, находящаяся за пределами участка локуса, используемого для MLST. 

Цель работы – анализ особенностей эпизоотии чумы, обнаруженной в южной степной части плоскогорья Укок в 2020 г.

Материалы и методы. Эпизоотологическое обследование проведено в июле и августе 2020 г. на площади 1573 км2 . Исследовано на чуму 141 млекопитающее, 157 эктопаразитов, из них 152 блохи, 17 проб костных останков, 50 погадок хищных птиц.

Результаты и обсуждение. Фоновыми видами носителей чумного микроба в южной степной части плоскогорья Укок являются серый сурок, длиннохвостый суслик и даурская пищуха. Численность серого сурка высокая и составила (1,7±0,18) жилых бутана на 1 га (n=30) с 90 % заселенностью бутанов. Выделено 3 штамма Yersinia pestis ssp. pestis: от блох Oropsylla alaskensis с длиннохвостого суслика, трупа серого сурка, погадки хищных птиц. ДНК чумного микроба обнаружена в 14 объектах. Получено 8 положительных результатов серологического исследования. Площадь эпизоотии, подтвержденной изоляцией возбудителя чумы, составила 252 км2 . В результате проведенных исследований впервые установлена циркуляция Yersinia pestis ssp. pestis на плоскогорье Укок. В эпизоотию активно вовлечен промысловый вид – серый сурок, а также длиннохвостый суслик.

Цель – разработка и оценка эффективности способа выявления РНК вируса Луйо в пробах клинического и биологического материала с помощью одношаговой ОТ-ПЦР с учетом результатов в режиме реального времени.

Материалы и методы. Для подбора консервативных участков генома использовали доступные в базе данных GenBank (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank) последовательности вируса Луйо, выровненные с использованием программного пакета BioEdit 7.2.5 (IbisBiosciences, США). Для проведения ОТ-ПЦР в одном раунде использовали обратную транскриптазу и TaqF-полимеразу. Для создания положительного контрольного образца (ПКО) получали рекомбинантный штамм Escherichia coli XL1-Вlue, содержащий плазмиду pGEM-T со встроенным синтетически полученным фрагментом генома вируса. Сконструированные рекомбинантные плазмиды использовали для создания РНК-содержащего ПКО с защитной белковой оболочкой MS2-фага. Определение специфичности разработанного способа осуществляли с использованием контрольной панели РНК и ДНК 23 штаммов вирусов, относящихся к 10 семействам, чувствительности – панели биологических образцов, искусственно контаминированных ПКО. Дальнейшую апробацию проводили на базе лаборатории Российско-Гвинейского центра эпидемиологии и профилактики инфекционных болезней (г. Kindia, Гвинейская Республика) на 265 сыворотках крови практически здоровых людей, 110 сыворотках крови крупного рогатого скота, 83 суспензиях клещей, 165 суспензиях органов мелких млекопитающих, собранных на территории Гвинеи.

Результаты и обсуждение. В качестве мишени для детекции РНК вируса Луйо методом ОТ-ПЦР выбраны два консервативных фрагмента гена полимеразы. Экспериментально подобрано сочетание праймеров и зондов, установлен оптимальный состав реакционной смеси для проведения ПЦР, режим постановки ОТ-ПЦР, а также разработаны контрольные образцы К+, внутренний контрольный образец, положительный контрольный образец. Чувствительность предложенного способа составила 5·10³  ГЭ/мл, специфичность – 100 %. 

Заболеваемость иксодовыми клещевыми боррелиозами (ИКБ) на о. Русском (Приморский край) выше, чем на материке. На острове сложилась бидоминантная структура населения клещей с массовой встречаемостью Ixodes persulcatus и I. pavlovskyi. В силу более высокой инфицированности и агрессивности I. persulcatus высказано предположение о его ключевом значении в формировании высокой активности очага ИКБ на острове.

Цель исследования – на основе изучения структуры комплекса геновидов боррелий, изолируемых из клещей рода Ixodes на о. Русском, охарактеризовать роль I. pavlovskyi в боррелиозном эпизоотическом процессе.

Материалы и методы. Сбор клещей проведен с растительности на трех участках. Видовая принадлежность иксодид определена морфологически и методом ПЦР по митохондриальному гену сox1 и ядерному мультикопийному локусу ITS2. Проанализирована инфицированность 233 клещей с подтвержденной всеми методами видовой идентификацией. Геновиды боррелий определены методом мультиплексной двухраундовой ПЦР в присутствии праймеров, специфичных к фрагментам генов 5S и 23S рРНК комплекса Borrelia burgdorferi sensu lato.

Результаты и обсуждение. Подтверждено сосуществование на острове I. persulcatus и I. pavlovskyi с различным их соотношением в пространстве и постепенным возрастанием доли последнего вида. Выявлена циркуляция трех этиологических агентов ИКБ: Borrelia garinii (преимущественно в I. pavlovskyi), B. bavariensis и B. afzelii (в I. persulcatus). Таким образом, на острове сформировался активный природный очаг ИКБ, вероятно, включающий две не изолированные цепочки циркуляции боррелий. Одна объединяет I. persulcatus, а также мелких и крупных млекопитающих в качестве прокормителей клещей. Вторая – I. pavlovskyi, который может прокармливаться на млекопитающих и птицах. Благодаря пространственной изменчивости структуры населения иксодид на различных участках острова может меняться соотношение циркулирующих видов боррелий, а в районах абсолютного доминирования I. pavlovskyi этот вид становится основным переносчиком патогенных возбудителей. 

Появление различных геновариантов вируса SARS-CoV-2, характеризующихся более высокой, по сравнению с исходными вариантами, способностью к распространению и более тяжелыми клиническими проявлениями, требует проведения молекулярно-генетического мониторинга штаммов, циркулирующих на территории Российской Федерации.

Цель исследования – выявление геновариантов VOC SARS-CoV-2 на территории республик Башкортостан, Татарстан, Удмуртия и Самарской, Пензенской, Саратовской, Ульяновской, Оренбургской областей.

Материалы и методы. Выявление геновариантов и определение типа мутаций осуществляли методом секвенирования фрагментов по Сэнгеру.

Результаты и обсуждение. В работе исследовали 298 проб клинического материала, полученных из центров гигиены и эпидемиологии в республиках Башкортостан, Татарстан, Удмуртия, Самарской, Пензенской, Саратовской, Ульяновской, Оренбургской областях. В 17 % случаев наблюдали вариабельность вируса SARS-CoV-2 по одному или нескольким маркерам: в трех пробах выявлен новый коронавирус линии В.1.1.7 «Британский»; в ряде случаев у обнаруженного в пробах вируса детектировали наличие только одной мутации – делеции Y144 или замены D138Y, E484K, N501Y, крайне редко двух мутаций – делеции Y144 и замены E484K. Показано наличие в 10 % случаев у детектированных SARS-CoV-2 делеции L141-G142-V143, локализованной в рецидивирующем делеционном регионе S-гена RDR2. Получены данные, указывающие на гетерогенность в макроорганизме популяции нового коронавируса с делецией L141-G142-V143, которая приводит к изменению антигенной структуры вируса, что, вероятно, позволяет ему уклоняться от иммунного ответа.

Целью работы является применение зимографического и протеомного анализа для изучения состава и функций внутриклеточных и экстрацеллюлярных протеаз производственных штаммов Vibrio cholerae 569В серовара Инаба и М41 серовара Огава.

Материалы и методы. Образцы внутриклеточных протеаз получали из клеточных лизатов путем обработки бактериальных клеток ультразвуком в 9 М растворе мочевины. Фракцию экстрацеллюлярных протеаз осаждали из культуральной жидкости добавлением 50 % трихлоруксусной кислоты до конечной концентрации 10 % и инкубацией на льду. В качестве контроля протеолитической активности использовали лиофилизированные препараты протеиназы К и ферментного комплекса протеовибрина. Протеазы выявляли методом субстратного гель-электрофореза в 12,5 % полиакриламидном геле, импрегнированном 0,1 % желатином с последующей идентификацией состава белковых фракций лизатов и экзопротеинов обоих штаммов с помощью молекулярного масс-спектрометрического сканирования.

Результаты и обсуждение. Сравнительное исследование производственных штаммов V. cholerae 569В серовара Инаба и М41 серовара Огава с помощью зимографического и протеомного анализа показало, что наибольшая ферментативная активность выявлена в образце фракции экстрацеллюлярных протеаз штамма V. cholerae М41, где идентифицировано пять основных и четыре минорных зоны гидролиза желатина, причем зоны высокой интенсивности с МW 20–23 и 37‒40 кДа обнаружены также в препарате протеовибрина, выделенного из культуральной жидкости этого штамма. В результате протеомного анализа исследуемых штаммов достоверно идентифицированы 66 ферментов V. cholerae с различной функциональной активностью, среди которых 15 ферментов обладали протеазной активностью. Высокая информативность комплекса современных методов показала возможность выявления качественных и количественных различий состава внутриклеточных и экстрацеллюлярных протеаз производственных штаммов V. cholerae, что предлагает эффективное средство скрининга межштаммовых различий протеазного спектра у производственных штаммов.

Целью исследования является характеристика современной эпидемиологической ситуации по лептоспирозу в Республике Татарстан, изучение циркуляции возбудителей лептоспироза в популяции мелких млекопитающих и видового состава лептоспир, вызвавших заболевания у людей.

Материалы и методы. В работе использованы данные по заболеваемости населения лептоспирозом на территории Российской Федерации (РФ) за период с 2000 по 2018 год, на территории Республики Татарстан – с 1998 г., представленные управлениями Роспотребнадзора по субъектам РФ, материалы ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Республике Татарстан (Татарстан)» и Главного управления ветеринарии Республики Татарстан.

Результаты и обсуждение. Проведен анализ эпидемиологической ситуации в Республике Татарстан за период 1998–2018 гг. по административным территориям республики. Проанализирована заболеваемость лептоспирозом людей, вызванная различными серогруппами лептоспир. Всего за анализируемый период заболело лептоспирозом 112 человек. Приведены данные исследования мелких млекопитающих, обитающих в природных очагах лептоспироза на территории республики. Проведены лабораторные исследования 1565 проб от мышевидных грызунов на зараженность возбудителями лептоспироза, из них 1,9 % дали положительный результат. Доминирующими в Республике Татарстан являются серогруппы лептоспир Leptospira grippotyphosa и L. hebdomadis. Результаты лабораторных исследований на носительство лептоспир среди мелких млекопитающих и инфицированность ими объектов окружающей среды свидетельствуют о циркуляции возбудителей лептоспироза в популяции мелких млекопитающих, обитающих в лесокустарниковых, околоводных и луго-полевых стациях республики. Преобладает в данном сообществе рыжая полевка, средний индекс ее доминирования составляет 66,7 %. Данные эпизоотологического мониторинга указывают на скрыто протекающий эпизоотический процесс в сообществе мышевидных грызунов.

Цель – оценить вирусофорность популяции основного переносчика вируса Конго-Крымской геморрагической лихорадки (ККГЛ) клеща Hyalomma marginatum и ее влияние на уровень заболеваемости Крымской геморрагической лихорадкой (КГЛ) на территории Ставропольского края.

Материалы и методы. Всего исследовано более 22 тыс. экземпляров клещей этого вида, сформированных в 1546 пулов (пробы). Индикацию вируса ККГЛ в пулах клещей осуществляли методом ПЦР с использованием набора реагентов для выявления РНК вируса ККГЛ «АмплиСенс® CCHFV-Fl» (ЦНИИЭ, Москва). Для установления индивидуальной зараженности (вирусофорности) клещей в пулах использовали метод Беклемишева. Данные по заболеваемости и количеству укушенных лиц взяты из официальной статистической отчетности и ежегодных итоговых донесений по заболеваемости КГЛ, предоставленных Управлением Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Ставропольскому краю за период 2012–2018 гг.

Результаты и обсуждение. Из 1546 пулов иксодовых клещей в 161 выявлена РНК вируса ККГЛ. Общий показатель спонтанной инфицированности клещей H. marginatum в исследованных пробах за изучаемый период составил 10,4 %. Наиболее высокие показатели зараженности (20 %) отмечены при исследовании проб, сформированных из нимф. Зараженность пулов, сформированных из самцов, составила 11 %, в то время как среди самок зараженными оказались всего 8,5 % пулов. Циркуляция вируса подтверждена на большей части территории края. Средняя вирусофорность в популяции клеща H. marginatum за период 2012–2018 гг. составила 1,54 %, варьируя по годам от 0,23 % в 2014 г. до 2,97 % в 2017 г. Установлено, что уровень вирусофорности клещей не влияет на заболеваемость КГЛ в Ставропольском крае. Вероятно, определяющим уровень заболеваемости КГЛ фактором является не процент зараженных клещей, присутствующих в популяции, а их общая численность.

Цель – изучение особенностей биологических свойств штаммов холерных вибрионов, обнаруженных в объектах окружающей среды (ООС) на территории Ростова-на-Дону с 1989 по 2018 год.

Материалы и методы. Бактериологическими, молекулярно-биологическими и статистическими методами изучены 73 штамма холерных вибрионов О1, О139 и 1702 штамма nonО1/nonО139 серогрупп, выделенные за 30-летний период.

Результаты и обсуждение. Установлено, что в Ростове-на-Дону выделено 78,0 % токсигенных штаммов от всех изолированных из ООС на территории России, среди которых 2 – генетически не измененные. Обнаружен штамм Vibrio cholerae О1 classical и 72 штамма V. cholerae El Tor, из которых 70 % относились к серовару Огава, а 3 % нетоксигенных штаммов оказались чувствительны к классическому фагу. Статистически выявлена «очень слабая прямая связь» между выделением штаммов V. cholerae O1, О139 и V. cholerae nonO1/nonO139, у которых определены доминирующие серогруппы (О67, О76, О75, О53, О16), а у 18 % штаммов показана атипичность по агглютинабельности. Выявление биологических особенностей штаммов V. cholerae способствует оптимизации мониторинговых исследований.

Цель работы – оценка степени контаминации холерной химической вакцины на этапах приготовления и определение путей ее снижения.

Материалы и методы. В работе использовали жидкие и лиофилизированные компоненты холерной химической вакцины: холероген-анатоксин и О-антигены штаммов Vibrio cholerae 569В и Vibrio cholerae М-41, а также вспомогательные вещества (сахароза, тальк, кальция стеарат, крахмал). Гранулирование осуществляли на аппарате, работающем по принципу псевдоожиженного слоя, GPCG 2 фирмы GLATT (Германия). Последующее таблетирование смеси проводили с помощью пресса MiniTabT фирмы LUXNER (Германия). Проведены исследования по оценке показателя «микробиологическая чистота» на стадиях изготовления холерной химической вакцины, таблеток, покрытых кишечнорастворимой оболочкой. Наличие или отсутствие роста микроорганизмов на чашках Петри с питательными средами оценивали визуально.

Результаты и обсуждение. Выявлена динамика изменения микробной загрязненности на отдельных технологических стадиях производства вакцины. Показано, что растворы антигенов в процессе выделения подвержены микробной контаминации, что связано с использованием при осаждении антигенов сульфата аммония и нестерильной воды на стадии диализа. Стерильность полуфабрикатов достигалась двухэтапной фильтрацией холерогена-анатоксина и стерилизацией О-антигенов V. cholerae 569В и V. cholerae М-41 текучим паром при (100±1) °С в течение 30 мин. Для снижения микробной контаминации на технологической стадии гранулирования установлены дополнительные фильтры тонкой очистки в системе подачи воздуха. Далее провели сравнительное определение микробиологической чистоты серий вакцины, полученных методами прямого прессования и с предварительным гранулированием. Экспериментально показано, что применение гранулирования компонентов таблеточной смеси холерной вакцины приводит к снижению уровня бактериальной контаминации и улучшает показатели микробиологической чистоты в готовой лекарственной форме.