Современный этап трансформации архитектуры глобального здравоохранения диктует необходимость объединения международных усилий по созданию условий для сотрудничества и наращивания потенциала реагирования на различные угрозы биологического характера между всеми участниками на международной арене. В работе продемонстрированы преимущества российских подходов к организации санитарно-эпидемиологической службы для противодействия биологическим угрозам. Показаны наиболее яркие примеры участия страны в формирующейся архитектуре глобального здравоохранения, к которым относится участие Российской Федерации в реализации межгосударственных программ, направленных на ликвидацию опасных инфекционных болезней. Обозначена стратегия противодействия современным угрозам биологического характера, реализуемая Российской Федерацией на международной арене, ориентированная прежде всего на укрепление методологического, технологического, кадрового потенциала, усиление национальных возможностей по эпидемиологическому надзору и ответным мерам на чрезвычайные ситуации (ЧС) в области санитарно-эпидемиологического благополучия населения стран-партнеров. Рассмотрены основные направления сотрудничества со странами-партнерами. Приведены основные результаты совместных международных проектов как в ближнем, так и в дальнем зарубежье, отображающие существенные успехи в укреплении национального потенциала стран – партнеров Российской Федерации в сфере оперативного реагирования на возникающие угрозы в области биологической безопасности и обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия. Достигнутые результаты межгосударственного сотрудничества в области обеспечения глобальной биологической безопасности и активное участие Российской Федерации в разработке и реализации глобальных инструментов в области мониторинга и реагирования на ЧС в сфере общественного здравоохранения определяют существенный вклад Российской Федерации в современное формирование глобальной архитектуры здравоохранения.

При работе с возбудителями инфекционных болезней широко используются средства индивидуальной защиты (СИЗ) персонала, что является одним из значимых элементов обеспечения биологической безопасности. Проведен обзор и анализ действующей правовой и нормативно-методической базы обеспечения рабочей одеждой, обувью и СИЗ работников, осуществляющих деятельность с возбудителями инфекционных болезней в Российской Федерации. Выдача СИЗ при работе с опасными биологическими факторами – возбудителями инфекционных болезней – определяется нормативами в сфере охраны труда, технического регулирования, биологической безопасности и оказания медицинской помощи. Выявлены проблемы применимости отдельных положений действующих нормативов в сфере охраны труда и технического регулирования в отношении выдачи СИЗ при проведении работ с патогенными микроорганизмами. Среди них основными являются: расхождения в терминологии в документах, утверждаемых различными органами исполнительной власти; необходимость уточнения количественных норм выдачи некоторых СИЗ в зависимости от особенностей рабочего процесса и требований биологической безопасности; подтверждение соответствия в отношении защитной эффективности СИЗ от опасных воздействий биологического фактора; выбор СИЗ от воздействия патогенных биологических агентов в зависимости от свойств конкретного изделия, его конструктивных особенностей, модификации, направленных на снижение риска для персонала, населения и окружающей среды; выделение понятия «рабочая одежда» при выполнении работ с возбудителями инфекционных болезней. Решение лежит в развитии нормирования и методического обеспечения биологической безопасности.

В обзоре представлены результаты изучения популяции малого суслика – основного носителя возбудителя чумы – на территории очагов Северного и Северо-Западного Прикаспия. Рассматривается влияние различных факторов на динамику численности этого вида в Прикаспийском Северо-Западном и Волго-Уральском степных природных очагах чумы. Статистически обработаны и проанализированы данные ежегодного учета плотности малого суслика, показатели интенсивности размножения вида, среднемесячные показатели температуры воздуха по метеостанциям г. Элисты за период 1960–2024 гг., а также г. Харабали за период 1940–2024 гг. Подчеркивается, что динамика численности вида определяется целым комплексом природных и антропогенных факторов. Вместе с тем в условиях полупустыни для малого суслика лимитирующим является распределение температуры воздуха и осадков по сезонам и годам. Проанализировано воздействие температур в январе – феврале, провоцирующих выход малого суслика на поверхность при пробуждении от зимней спячки. Отмечается, что основной причиной снижения численности основного носителя чумы в глинистой полупустыне являются не абсолютные зимние температуры, а чередование теплых и холодных периодов в эти месяцы. Поэтому, если температуры января и февраля близки друг к другу, последствия повышения температуры могут иметь разный характер. Негативное влияние повышения зимних температур на физическое состояние животных проявляется в основном в те годы, когда январь «теплый», а февраль «холодный» или когда теплые и холодные периоды чередуются в течение месяца. При чередовании теплых и холодных периодов рано проснувшиеся грызуны гибнут в большом количестве из-за недостатка корма и холода.

Полученные результаты анализа эпидемиологических, эпизоотологических и филогенетических данных позволяют предположить, что территория Восточно-Африканского плоскогорья является единым природным мегаочагом античного биовара 1.ANT основного подвида Yersinia pestis. Циркуляция различных геновариантов (1.ANT1, 1.ANT2, 1.ANT3) античного биовара основного подвида Y. pestis происходит в популяциях различных видов дикоживущих и полусинантропных крыс и их специфических эктопаразитов. В границах установленного ареала античного биовара 1.ANT основного подвида Y. pestis эпизоотические проявления приурочены к густозаселенным районам Демократической Республики Конго (ДРК), Уганды, Кении, Танзании, Замбии и Малави. К потенциально энзоотичным по чуме регионам следует относить территории Руанды и Бурунди, а также северные районы Мозамбика. В 2000–2024 гг. в восточноафриканских странах (ДРК, Замбия, Малави, Танзания, Уганда) зарегистрировано более 15,5 тыс. случаев инфицирования чумой, что составляет 54 % от общего числа заболевших на Африканском континенте. Максимальная эпидемическая активность (в среднем 1326 человек в год) восточноафриканских очагов отмечена в 2000–2009 гг. В 2010–2019 гг. показатели заболеваемости в ДРК, Уганде, Танзании значительно снизились (в среднем до 103 человек в год), в Замбии и Малави случаев инфицирования чумой не выявлено. В 2020–2024 гг. эпидемические осложнения по чуме продолжали регистрировать только на территории ДРК. Сохранение постоянных рисков инфицирования обусловлено высокой плотностью и интенсивностью контактов сельского населения с природно-очаговыми комплексами Восточно-Африканского плоскогорья. Высокая заболеваемость чумой определяется также вспышками антропонозной бубонной чумы, связанными с обилием блох Pulex irritans в сельских населенных пунктах.

Вирусы, поражающие холерный вибрион, или холерные бактериофаги, открыты в начале ХХ в., когда в Юго-Восточной Азии, на Дальнем и Ближнем Востоке и в Европе свирепствовала шестая пандемия холеры. Это открытие положило начало интенсивному изучению холерных бактериофагов как перспективного средства в борьбе с холерой. В обзоре освещены вопросы, связанные с историей открытия и изучения холерных бактериофагов, описаны особенности их строения и жизненного цикла. Представлена коэволюционная стратегия взаимодействия холерных бактериофагов с клетками холерного вибриона, получившая название «динамика Красной королевы». Согласно этой стратегии штаммы холерного вибриона и холерные бактериофаги для того, чтобы выжить, должны постоянно эволюционировать и приспосабливаться, приобретая всё новые системы защиты друг от друга. Также в обзоре изложены сведения об основных известных на сегодняшний день антифаговых системах холерного вибриона (мутационные изменения рецепторного аппарата, выброс везикул внешней мембраны, система рестрикции-модификации, PLE-элемент, SXT-элементы, система исключения бактериофага BREX и CRISPR/ Cas-системы, Abi-стратегия). Описаны фаговые системы контрзащиты (CRISPR/Cas-система, нуклеаза Odn, эпигенетическая модификация метилазой, система противодействия BREX). Проанализированы вопросы практического применения холерных бактериофагов в диагностике холеры (для идентификации, определения биовара возбудителя, его вирулентности и эпидемической значимости), приведены наиболее известные схемы фаготипирования. Охарактеризованы перспективные стратегии использования холерных бактериофагов в фаготерапии и фагопрофилактике холеры. Отдельно рассмотрены эффекты совместного использования фагов и антибиотиков в комплексной терапии.

Цель работы – оценить встречаемость серологических и молекулярно-биологических маркеров ВИЧинфекции и парентеральных вирусных гепатитов В (ГВ) и С (ГС) у медицинских работников из Санкт-Петербурга. Материалы и методы. Материалом исследования служил 171 образец плазмы крови медицинских работников из Санкт-Петербурга. Методом ИФА проводили качественное определение антигена/антител (Аг/Ат) ВИЧ, HBsAg, антител к белкам HBs и HBcore (анти-HBs IgG, анти-HBcore суммарные) и анти-HCV IgG. Методом ПЦР выявляли РНК ВИЧ, РНК ВГС и ДНК ВГВ. Для всех выявленных образцов ВГВ проводили секвенирование и последующий анализ нуклеотидных последовательностей региона Pre-S1/Pre-S2/S. Результаты и обсуждение. Обследованная группа ранжирована по возрастам на следующие подгруппы: 21 год – 35 лет (28,07 %), 36–50 лет (26,90 %), 51 год – 65 лет (31 %) и старше 66 лет (13,45 %). Серологические маркеры ГВ выявлены у 91 (53,22 %) обследованного, ГС – у 2 (1,17 %). Маркеры ВИЧ-инфекции не обнаружены. Одновременно маркеры к вирусным гепатитам В и С обнаружены у 1 (0,58 %) человека. ДНК ВГВ выявлена у 4 (2,34 %) медицинских работников, РНК ВГС и ВИЧ не обнаружены. Определены достоверные различия в распространенности и распределении анализируемых серологических маркеров между возрастными группами. Все изоляты ВГВ относились к генотипу D, субгенотипам D1 (50 %) и D2 (50 %). Показана высокая вариабельность региона Pre-S1/Pre-S2/S ВГВ в обследованной группе. Полученные результаты свидетельствуют об относительно низкой распространенности вирусных гепатитов В и С в обследованной группе. Мониторинг распространенности гемоконтактных инфекций среди медицинских работников остается актуальной задачей, в первую очередь в отношении ГВ.

Цель работы – уточнение орографических и эдафических параметров пространственного распределения эпизоотических участков в Центрально-Кавказском высокогорном природном очаге чумы для проведения электронной паспортизации в рамках государственной программы «Обеспечение химической и биологической безопасности Российской Федерации. 2021–2024 годы», НИОКР «Электронная паспортизация природных очагов чумы и КГЛ на территории юга Российской Федерации». Материалы и методы. Данные о пространственно-временном распределении эпизоотических участков получены из архива ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора и включают 318 точек выявления эпизоотий чумы с 1984 по 2021 г. с пространственной привязкой в виде географических координат. В анализ включены четыре ландшафтно-эпизоотологических района (ЛЭР): Верхне-Кубанский, Кубано-Малкинский, Малко-Баксанский и Баксано-Чегемский. Чегемо-Черекский ЛЭР исключен, так как с его территории штаммы чумы не выявлялись ни разу. Эдафические и орографические факторы получены с сайтов https://www.fao.org/ (данные о почве, в том числе и названия), https://neo.gsfc.nasa.gov/, https://dwtkns.com/srtm30m/ (цифровая модель рельефа) и из архива ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора. Результаты и обсуждение. Эпизоотийные участки имеют выраженную приуроченность к высотам от 2000 до 2711 м над уровнем моря. В горно-степном поясе эпизоотийные участки чаще встречаются на склонах северо-северо-восточной – южной экспозиций, в альпийском и субальпийском поясах – северо-северозападной экспозиции. Предпочтительны средний, ближе к высокому уровень освещенности ландшафта и относительно ровные или не сильно пересеченные участки со следующими типами почв: дистрические и моллические лептозолы и дистрические камбизолы. Отсутствуют эпизоотийные участки на эвтрических камбизолах, хотя возможно, что это случайное явление.

Цель работы – изучение композиционного состава препаратов везикул (OMV) у штаммов Vibrio cholerae O1 El Tor (ctxAB^– tcpA^– ; ctxAB^– tcpA⁺ ) и О139 (ctxAB^– tcpA^– ) серогрупп, выделенных из различных источников. Материалы и методы. В работе использовали штаммы V. cholerae серогрупп О1 и О139, из которых были получены препараты OMV. Методом трансмиссионной электронной микроскопии (ТЭМ) изучали строение препаратов OMV. Полногеномное секвенирование ДНК проводили на платформе MiSeq. Нуклеотидные и соответствующие аминокислотные последовательности генов изучали c помощью биоинформационного анализа. Белковое профилирование проводили с помощью MALDI-TOF масс-спектрометрии. Ферментативные активности детектировали с использованием соответствующих сред и субстратов. Определение (поверхностных детерминант) липополисахарида (ЛПС) и белков наружной мембраны в составе OMV осуществляли методом иммуноферментного анализа. Анализ спектра жирных кислот (ЖК) проводили методом газожидкостной хроматографии масс-спектрометрии. Результаты и обсуждение. Получены препараты OMV из атоксигенных штаммов холерных вибрионов. ТЭМ выявлено, что OMV представлены структурами сферической формы около 40–200 нм. По данным полногеномного секвенирования установлено, что в составе OMV обнаружены фрагменты хромосом, содержащие гены штаммов V. cholerae серогрупп O1 и O139, из которых они выделены. Проведенный биоинформационный анализ выявил отличия в структуре гена ompT у исходных штаммов и у OMV, полученных из штаммов V. cholerae серогрупп O1 и O139. Ген ∆ompT препарата OMV V. cholerae O139-серогруппы был трункирован и образовывал пептид в 17 аминокислотных остатков (-LENHHQKNREPDKEFPY-). Анализ композиционного состава OMV выявил наличие в их составе ферментов (N-ацетил-β-D-глюкозаминидазы и ДНК-азы), белков наружных мембран (OmpT и OmpU), ЛПС, насыщенных, сis/trans-изомеров ненасыщенных ЖК и разветвленных ЖК. Обнаружены различия в композиционном составе OMV, полученных из атоксигенных штаммов V. cholerae серогрупп О1 и О139.

Аксайский высокогорный очаг входит в состав Тянь-Шаньского очага, который в последнее время проявляет постоянную эпизоотическую активность. В 2024 г. в Аксайском очаге впервые в XXI в. выделены культуры Yersinia pestis. Цель исследования – молекулярная идентификация штаммов Y. pestis, полученных в Аксайском очаге в 2024 г., их филогенетический анализ для установления происхождения и получение полногеномных последовательностей, референсных для этого очага в современный период. Материалы и методы. Геномы штаммов Y. pestis секвенировали на генетическом анализаторе MinIon (Oxford Nanopore Technologies, Великобритания). Библиотеки для секвенирования готовили с помощью набора Native Barcoding Kit 24 v14 (SQK-NBD114.24) и секвенировали на проточной ячейке R10.4.1. Коровые SNPs выявляли путем попарного выравнивания полученных полногеномных последовательностей на геном штамма Y. pestis CO92 с помощью программы Snippy v4.6.0. Дендрограмму Maximum Likelihood строили с применением PhyML 3.1. Результаты и обсуждение. По данным филогенетического анализа полногеномных последовательностей установлена принадлежность штаммов Y. pestis, полученных в 2024 г. в Аксайском очаге, к филогенетической ветви 0.ANT3 античного биовара. Штаммы Y. pestis 2024 г. принадлежат к политомии 0.ANT3, к которой также относятся все штаммы 0.ANT3 XX в. из Аксайского, Верхненарынского и Алайского высокогорных очагов и штаммы из провинции Синьцзян в Китае. Генетические отличия между штаммами 0.ANT3 текущего и прошлого века невелики, что доказывает непрерывность сохранения этой популяции в XX–XXI вв. и местном происхождении штаммов 2024 г. Штаммы 0.ANT3 были ранее выделены на значительных территориях Верхненарынского, Аксайского, Алайского очагов чумы и на сопредельных территориях Китая, что свидетельствует о существовании здесь мегаочага 0.ANT3 Y. pestis. Штаммы 0.ANT3 высоковирулентны и эпидемически значимы. Активизация Аксайского природного очага чумы требует усиления эпидемиологического надзора за этим автономным очагом чумы Тянь-Шаня.

Популяционный иммунитет является определяющим фактором в отношении распространения различных вариантов вируса гриппа, поэтому имеет большое значение для прогнозирования эпидемий, характеристики эпидемического процесса и оценки эффективности вакцинальных кампаний. Целью работы явился мониторинг маркеров сезонных вирусов гриппа и вирусов гриппа птиц в сыворотках крови жителей Российской Федерации в 2023–2024 гг. Материалы и методы. Образцы сывороток крови здоровых доноров собраны в Сибирском федеральном округе (СФО) Российской Федерации в октябре – ноябре 2023 г. Кроме того, в реакции торможения гемагглютинации (РТГА) и вируснейтрализации исследованы сыворотки крови людей, имевших контакт с больной и/или погибшей птицей, и жителей регионов, расположенных на путях миграции дикой водоплавающей птицы. Результаты и обсуждение. Показано, что накануне эпидемического сезона 2023/2024 гг. в СФО популяционный иммунитет к гриппу был на уровне, рекомендованном Всемирной организацией здравоохранения, – не менее 50 % иммунного населения. Однако среди лиц, имевших контакт с больной и/или погибшей птицей, гуморальный иммунитет к сезонному гриппу был существенно ниже – от 5 до 30 % серопозитивных в зависимости от региона. В РТГА с вирусами гриппа птиц A/H5Nx и A/H9N2 положительными были 0 и 3,7 % образцов соответственно. Риск возникновения пандемического вируса гриппа можно снизить путем 75–100%-й вакцинации против сезонного гриппа и контроля уровня антител у работников птицефабрик и других организаций, непосредственно связанных с разведением и переработкой птицы.

Цель работы – ретроспективная молекулярная экспертиза вспышек чумы, произошедших на северном побережье Аральского моря в середине прошлого века, и филогенетический анализ вызвавших их штаммов Yersinia pestis. Материалы и методы. Использованы полногеномные последовательности 39 штаммов Y. pestis из очагов Северного Приаралья, выделенных в 1945–1974 гг. Полногеномное секвенирование выполняли в системе Ion S5 XL System (Thermo Fischer Scientific, США). Обработку данных и сборку последовательностей проводили с помощью Ion Torrent Suite software package, v5.12, FastQC v0.12.0, unicycler v0.5.0. Филогенетическую реконструкцию проводили методом полногеномного SNP-анализа, построение дендрограммы осуществляли алгоритмом Maximum Likelihood с применением программы PhyML v3.1. Молекулярное типирование штаммов осуществляли методом MLVA25. Результаты и обсуждение. Штаммы Y. pestis, выделенные в Северном Приаралье с 1945 по 1974 г., относятся к филогенетической ветви 2.MED1 средневекового биовара основного подвида. Вспышки чумы в Северном Приаралье в 1945, 1955, 1966 и 1969 гг. вызваны штаммами каспийской подветви 2.MED1, а вспышка 1967 г. – штаммами центральноазиатской подветви, последовательно достигшими этого региона из Северного Прикаспия и Прибалхашья. Показано, что источниками заражения людей были эпизоотии, протекавшие на северном побережье Аральского моря. Установлено, что в 1960-е гг. на территории Северного Приаралья одновременно циркулировали штаммы Y. pestis каспийской и центральноазиатской подветвей 2.MED1 средневекового биовара. Характерной особенностью вспышки чумы 1945 г. было наличие большого числа специфических для каждого штамма SNPs, возможно обусловленных процессом быстрой адаптации штаммов каспийской подветви 2.MED1 к условиям природного биоценоза Северного Приаралья. В дальнейшем скорость эволюции возникшей северо-приаральской популяции 2.MED1 значительно снизилась, что сопровождалось формированием отдельных кластеров штаммов с небольшим количеством индивидуальных SNPs.

Цель исследования – генотипирование штаммов Yersinia pseudotuberculosis, выделенных в России, с помощью мультилокусного сиквенс-типирования (MLST), сравнительный анализ результатов MLST с результатами INDEL-типирования. Материалы и методы. В работе анализировали 348 штаммов различных серотипов, выделенных в разных регионах мира, включая 59 российских штаммов. Из базы данных NCBI использовано 302 штамма. Определение нуклеотидных последовательностей штаммов проводили при использовании технологической платформы MiSeq. Для MLST-анализа применена авторская программа MLSTtyper. Результаты и обсуждение. Выяснено, что на территории России циркулируют штаммы как минимум 2, 9, 19, 26, 32, 42, 43 STтипов. Большинство изученных российских штаммов относились к ST2-типу (58 %). Филогенетический анализ, проведенный с помощью данных MLST, показал, что ряд кластеров содержат штаммы, которые циркулируют на территории России долгое время, а штаммы этих генотипов не встречаются за рубежом. Часть российских штаммов вошла в кластеры, содержащие штаммы, выделенные в различных регионах мира, и может быть отнесена к штаммам либо «азиатского», либо «европейского» типов. Данные, полученные с помощью программы MLSTtyper, совпали с данными зарубежных авторов при анализе методом MLST тех же самых штаммов. Сравнение результатов генетической дифференциации штаммов Y. pseudotuberculosis с помощью MLST и INDEL-типирования свидетельствует о том, что MLST обладает большей дискриминационной способностью, однако в ряде случаев INDEL-генотипирование позволяет дифференцировать те штаммы, которые имели один ST-генотип.

В условиях пандемии COVID-19 проблема биологической безопасности пациентов и персонала медицинских организаций вышла на новый уровень. Особенности функционирования инфекционных госпиталей для лечения больных COVID-19 привели к формированию искусственной экосистемы, в которой сформировались условия для активной циркуляции вирусных и бактериальных патогенов. Цель исследования – проведение анализа данных мониторинга соблюдения требований санитарного законодательства в инфекционных госпиталях Российской Федерации, где проходят лечение пациенты с COVID-19, за двухлетний период. Материалы и методы. Проведен ретроспективный эпидемиологический анализ базы данных, созданной в Microsoft Office Excel, объемом 8,73 МБ, сформированной по данным результатов еженедельного мониторинга соблюдения требований санитарного законодательства в инфекционных госпиталях Российской Федерации для лечения больных COVID19, в системе report.gsen.ru за период с 42-й недели 2021 г. по 42-ю неделю 2023 г. В анализ включены сведения о выполнении требований санитарного законодательства в 614 инфекционных госпиталях для лечения больных COVID-19 с общим коечным фондом 37 270 коек, в том числе 5 961 – реанимационных. Результаты и обсуждение. Обследование инфекционных госпиталей органами Роспотребнадзора проводилось преимущественно в рамках санитарно-эпидемиологических расследований, основные нарушения санитарного законодательства касались вопросов дезинфекции (27,7 %), обеспечения персонала средствами индивидуальной защиты (13,4 %) и разграничения потоков разной степени эпидемиологической значимости (12,3 %). Уровень контаминации объектов больничной среды инфекционных госпиталей SARS-CoV-2 и условно-патогенными микроорганизмами (УПМ) составил 0,3 и 0,6 % соответственно. Бактериальная микрофлора, выделенная из биологического материала пациентов и объектов больничной среды инфекционных госпиталей, была сопоставима между собой и представлена семействами Staphylococcus, Enterobacterales (Klebsiella, Enterobacter, Escherichia coli) и грамотрицательными неферментирующими бактериями (Acinetobacter baumanii, Pseudomonas aeruginosa). Таким образом, в условиях пандемии и повышенной нагрузки на инфекционные госпитали увеличиваются риски распространения инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП), среди персонала и пациентов. Результаты данного исследования необходимо учитывать при проведении контрольно-надзорных мероприятий, эпидемиологических расследований и организации учебно-тренировочных занятий по подготовке медицинских организаций к работе в условиях массового распространения инфекционных заболеваний.

В настоящее время холера остается актуальной инфекционной болезнью, требующей поиска новых альтернативных антимикробных агентов для лечения и профилактики, в роли которых могут выступать бактериофаги. Цель исследования – выделение нового бактериофага из культуры холерных вибрионов, изолированных от больного в Москве в 2023 г., и характеристика его биологических и генетических свойств. Материалы и методы. В работе использовали токсигенный штамм Vibrio cholerae O1 Ogawa 21197. Для изучения биологических свойств бактериофага (морфологии негативных колоний, чувствительности к высоким и низким температурам и хлороформу, литической активности и специфичности) использовали двухслойный агаровый метод Грациа. Морфологию фаговых частиц изучали в электронном микроскопе. Генетическая характеристика проведена на основе полногеномного секвенирования с использованием программ SeqAnalyzer, PhageAnalyzer 2.0, а также алгоритмов BLASTN 2.2.29 и BLASTX 2.12.0+. Результаты и обсуждение. Выделенный бактериофаг на питательных средах формирует прозрачные негативные колонии с неровным краем без вторичного роста и ореола. В электронной микроскопии выявлено, что бактериофаг имеет многогранную головку и короткий хвост. Фаг специфичен и обладает высокой литической активностью в отношении холерных вибрионов, выделенных от человека, чувствителен к нагреванию и устойчив к воздействию хлороформа и заморозке. Анализ результатов секвенирования показал, что бактериофаг принадлежит к классу Caudoviricetes семейства Zobellviridae, размер генома составляет 48 074 п.н. с содержанием G+C=42,7 %. Полученный геном проверен на гомологию нуклеотидной последовательности с последовательностями ДНК других бактериофагов. Обнаружено 9 геномов Vibrio phage семейства Zobellviridae класса Caudoviricetes с высоким процентом перекрытия, выделенных из воды в Индии.

Цель исследования – пространственно-временной ретроспективный и оперативный генетический анализ популяции возбудителя туляремии в Ростовской области (РО), Донецкой (ДНР), Луганской (ЛНР) народных респуб ликах и на Украине в период с 1943 по 2023 г. Материалы и методы. Использовали штаммы Francisella tularensis, выделенные на территории РО, ДНР, ЛНР и на Украине в период с 1943 по 2023 г. VNTR-генотипирование проводили по пяти локусам. Кластерный анализ и построение филогенетического дерева проводили с использованием программы GrapeTree (алгоритмы NJ и MST). Полногеномное секвенирование осуществляли на платформе MiSeq Illumina. Сборку геномов, представленных в виде ридов, проводили с использованием программы Spades. Результаты и обсуждение. Проведен сравнительный анализ VNTR-генотипов 72 штаммов F. tularensis, из них 35 штаммов, выделенных из различных природных очагов России и, в частности, в РО с 1928 по 2023 г., 11 штаммов – из ДНР и ЛНР (2022–2023 гг.) и 26 штаммов из коллекции Ростовского-на-Дону противочумного института, изолированных на территории Украины с 1949 по 1990 г. У изученных штаммов выявлено 20 индивидуальных генотипов, распределенных по трем клональным комплексам (СС1 – СС3). Молекулярно-генетический анализ штаммов F. tularensis позволил выявить три клональных комплекса возбудителя туляремии (СС1 – СС3), циркулирующих на изученных территориях. Все они присутствуют на территории РО и только комплекс СС2 проявляет географическую приуроченность к южным районам РО. Штаммы, выделенные на территории Западной Украины до 90-х гг. прошлого столетия, принадлежат исключительно к комплексу СС3. Судя по широте распространения и разнообразию генотипов, популяция штаммов комплексов СС3 и СС1 существует на изученных территориях длительное время. Штаммы одного генотипа могут обнаруживаться в эндемичных районах в течение 80 лет и на расстоянии около 1000 км друг от друга. Напротив, популяция комплекса СС2 является самой недавней по времени происхождения и территориально ограничена территорией РО. Географические данные о происхождении клонов – предшественников клональных комплексов возбудителя туляремии СС1 и СС3 позволяют предположить расширение генетического разнообразия популяции возбудителя туляремии с востока на запад.

Серологический мониторинг как один из компонентов эпидемиологического надзора является методом оценки интенсивности возможных контактов населения с возбудителем природно-очаговой болезни. Цель исследования – оценка вероятных контактов населения с возбудителем туляремии по результатам серологического исследования сывороток крови здорового населения, проведенного в 2023 г. на территориях Донецкой и Луганской народных республик, Запорожской и Херсонской областей. Материалы и методы. Серологическими методами РНГА/РТНГА проведено исследование 829 сывороток крови, полученных в 2023 г. от людей, проживающих на территориях повышенного риска осложнений эпидемиологической ситуации по туляремии, ранее не участвовавших в специфической профилактике против туляремии. Результаты и обсуждение. Положительные результаты на наличие противотуляремийных антител в РНГА/РТНГА по четырем исследуемым территориям составляли от 18,5 до 40,0 %. Анализ анкет, заполненных донорами, позволил определить условия возможного контакта человека с возбудителем в природных очагах инфекции. Контакты населения с компонентами природного очага туляремии на обследованных территориях можно оценить как интенсивные, так как наличие специфических антител к возбудителю туляремии у доноров всех исследуемых регионов в среднем составляет 24,4 %. Анализ данных проведенного анкетирования показал, что все пробы, в которых выявлены антитела к возбудителю туляремии, зарегистрированы у доноров, которые, возможно, имели контакт с носителями и переносчиками возбудителя инфекции. Согласно результатам исследования, наибольший вклад в вероятный контакт с возбудителем туляремии вносят мелкие млекопитающие.

Разработка и внедрение биологических лекарственных препаратов на основе бактериофагов является одним из направлений Стратегии предупреждения распространения антимикробной резистентности в Российской Федерации на период до 2030 года, утвержденной решением Правительства Российской Федерации от 25 сентября 2017 г. № 2045-р. Обязательным условием для осуществления задач Стратегии служит создание банков госпитальных штаммов микроорганизмов и банков актуальных бактериофагов. Цель работы – определить основные требования к порядку ведения коллекции производственных штаммов бактериофагов. Материалы и методы. Проведен анализ нормативно-правовых документов, в которых закреплены цели, задачи, правила создания и использования коллекций патогенных микроорганизмов и вирусов, определены требования к качеству лечебно-профилактических препаратов бактериофагов. Использованы информационные материалы, содержащие актуальные сведения о биологических свойствах бактериофагов, имеющих значение для их терапевтического применения. Результаты и обсуждение. Ведение производственной коллекции бактериофагов характеризуется определенными особенностями, которые необходимо учитывать при создании лечебно-профилактических препаратов бактериофагов, соответствующих современной динамике изменчивости клинических бактериальных штаммов. Для обеспечения клинической эффективности и генетической безопасности фаготерапии препараты бактериофагов должны иметь в своем составе бактериофаги, охарактеризованные по морфологическим, биологическим, генетическим характеристикам. Препараты бактериофагов должны быть адаптированы к эпидемиологически значимым возбудителям гнойно-воспалительных и кишечных инфекций.

В работе представлены краткие сведения об организации, становлении и развитии отдела образовательных программ и подготовки специалистов ФКУН Российский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора – первого в стране специализированного подразделения для подготовки кадров к работам с возбудителями особо опасных инфекций, участию в научно-исследовательской деятельности и противоэпидемических мероприятиях на территории России и за рубежом. Накопленный опыт позволил создать эффективную систему обучения специалистов по вопросам микробиологии, эпидемиологии, лабораторной диагностики особо опасных инфекций, сочетая традиционные принципы выработки практических умений и навыков безопасного выполнения манипуляций с патогенами и современные информационно-методическую и материально-техническую базы, минимизировав биориск образовательных технологий. В последнее десятилетие коллектив отдела активно участвует в международной деятельности по подготовке кадров для стран СНГ и дальнего зарубежья, в том числе в рамках функционирования Центра, сотрудничающего с ВОЗ по вопросам реагирования на чрезвычайные ситуации санитарно-эпидемиологического характера, при ФКУН Российский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора. Анализ современного этапа деятельности отдела позволил сформировать планы и перспективы совершенствования.