Санитарно-карантинный контроль (СКК) на границе России – первая преграда на пути завоза и последующего распространения заболеваний на территории страны. С каждым годом число регистрируемых вспышек инфекционных болезней в странах мира увеличивается, что влечет за собой рост публикуемой информации, часть из которой требует верификации. При этом на фоне развития международного туризма и увеличения пассажиропотока многократно возрастает риск завоза инфекционных болезней на территорию России, что формирует потребность в модернизации информационного и технического обеспечения СКК. В связи с вышесказанным целью данной работы является разработка научно обоснованной системы информатизации и цифровизации СКК, итогом которой стало внедрение автоматизированной системы оценки рисков, связанных с завозом опасных инфекционных болезней (АИС «Периметр»), во всех санитарно-карантинных пунктах (СКП). Материалы и методы. Информационная система создана с использованием программных платформ Laravel и VueJs. В качестве источников информации об инфекционной заболеваемости в странах мира использованы данные сайтов министерств здравоохранения соответствующих стран, региональных бюро Всемирной организации здравоохранения, центров профилактики и контроля заболеваний (CDC) и системы ProMED-mail. Результаты и обсуждение. В результате внедрения АИС достигается максимально возможная оперативность в информировании должностных лиц СКП об эпидемиологической обстановке в мире, формируется эффективный инструмент отслеживания ситуации на федеральном уровне в режиме реального времени, облегчается работа специалистов СКП по выполнению стандартных операционных действий за счет значительного снижения объема рутинных процедур по ведению отчетности. Предложенная в АИС экспертная оценка риска завоза инфекционных болезней позволяет сотрудникам СКП, основываясь на достоверных сведениях, своевременно принимать решения о необходимости проведения СКК и исключить ошибочные действия в необходимом комплексе мероприятий в рамках осуществления СКК, при этом позволяя минимизировать субъективизм в отношении принятия решения.

Обзор посвящен средствам индивидуальной защиты людей от кровососущих членистоногих, главным образом от иксодовых клещей. Индивидуальная (личная) защита человека является важным компонентом неспецифической профилактики природно-очаговых трансмиссивных заболеваний. В работе проанализированы статистические данные, описывающие уровень важности и актуальности информации об инфекциях, передающихся иксодовыми клещами: клещевом вирусном энцефалите, иксодовом клещевом боррелиозе и др. Даны характеристики разных групп средств индивидуальной защиты: инсектоакарицидных, репеллентных и инсектоакарицидно-репеллентных. Рассмотрены показатели их эффективности, описано практическое использование, а также особенности специальной защитной одежды и необходимость ее применения. Токсичность защитной одежды снижается за счет наличия подкладочной ткани, локальных вставок из ткани с инсектоакарицидной пропиткой и применения нательного белья. Обсуждается разная трактовка терминов «репеллент» и «репеллентный» в отечественной и зарубежной литературе, а также два различных подхода («восточный» и «западный») к разработке и производству средств индивидуальной защиты людей от нападения кровососущих членистоногих, в том числе иксодовых клещей, в Р оссии и странах Западной Европы и США. Акцентировано внимание на действие различных групп пиретроидов на поведенческие реакции клещей. Показано, что в Российской Федерации использование перметрина не допускается для обработки защитной одежды от кровососущих членистоногих, в частности для защиты от таежного клеща Ixodes persulcatus, являющегося основным переносчиком опасных инфекций на большей части территории страны (на востоке европейской части, Урале, в Сибири и на Дальнем Востоке).

В последние десятилетия большую обеспокоенность медицинских работников, в том числе вирусологов и инфекционистов, вызывает увеличение количества случаев выявления вируса Усуту (Usutu, USUV, Orthoflavivirus usutuense) (семейство Flaviviridae, род Orthoflavivirus), особенно с момента его появления на территории Европы, где возбудитель вызвал массовую гибель птиц, и ежегодно регистрирующиеся случаи заболевания людей. В данном обзоре приводятся сведения о строении вируса и его генетических вариантах, географическом распространении и особенностях циркуляции на территории стран Европы и Африки, используемых методах и принципах индикации и идентификации рассматриваемого патогена, а также основные симптомы вызываемого им заболевания. В работе проведена оценка экологических предпосылок для возникновения вспышек инфекционной болезни, вызванной вирусом Усуту, и показана возможность такого развития событий на территории Российской Федерации.

Во второй половине прошлого века на территории Фенноскандии сформировался стойкий очаг заболеваний, вызываемых вирусом Синдбис. В разных странах заболевание получило названия «болезнь Погоста», «болезнь Окельбо» и «карельская лихорадка». Наиболее высокая заболеваемость – в Финляндии, где заболевания регистрируются ежегодно в диапазоне от спорадических случаев до крупных вспышек с сотнями пострадавших. В других странах Скандинавии и в России в настоящее время выявляются единичные случаи инфекции. Данные о регистрируемой заболеваемости и результаты сероэпидемиологических исследований свидетельствуют о неравномерном распространении инфекции на территории Фенноскандии, причины которого требуют изучения. В статье приведены современные данные о возбудителе, его распространении среди населения и в биоценозе Фенноскандии, клинических особенностях, диагностике и эпидемиологических характеристиках заболеваемости.

Цель работы – проанализировать эпизоотолого-эпидемиологическую ситуацию по лептоспирозам на территории Российской Федерации в 2013–2022 гг. и дать прогноз ее развития в 2023 г. Многолетняя динамика заболеваемости лептоспирозами в Российской Федерации имеет тенденцию к снижению. Больные зарегистрированы в 58 субъектах Российской Федерации, во всех федеральных округах. Наиболее высокие показатели инцидентности отмечены в Северо-Западном федеральном округе. При исследовании материала от мелких млекопитающих бактериологическими, иммунологическими и молекулярно-биологическими методами циркуляция лептоспир выявлена в 52 субъектах Российской Федерации, во всех федеральных округах. В 2023 г. возможны спорадические случаи заражения на территориях Северо-Западного, Центрального, Южного федеральных округов, не исключены завозные случаи инфекции из стран с субэкваториальным и экваториальным климатом.

Цель – оценить распространенность маркеров вируса иммунодефицита человека (ВИЧ ), вирусного гепатита В (ВГВ ) и С (ВГС ) среди беременных женщин и их партнеров мужчин в Гвинейской Республике.

Материалы и методы. Использована плазма крови 140 беременных женщин, сообщивших о половом контакте своих партнеров с ВИЧ -инфицированными лицами (без указания пола), а также образцы крови (60), полученные от партнеров указанных женщин. Образцы исследовали на наличие серологических (HBsAg, HBeAg, антитела анти-HBs IgG, анти-HBcore IgG, анти-HBe IgG, анти-HCV IgG, Ag/Ab-HIV) и молекулярных (ДНК ВГВ, РНК ВГС и ВИЧ) маркеров.

Результаты и обсуждение. Возраст обследованных беременных женщин варьировал от 13 до 55 лет и составил в среднем (26,29±9,67) года, мужчин – от 15 до 60 лет, в среднем – (29,05±11,99) года. Антитела к ВГС выявлены у 2,14 % женщин и 3,33 % мужчин, к ВИЧ – у 6,43 % женщин и 6,67 % мужчин. Серологические маркеры, связанные с ВГВ, определены у 80,71 % (HBsAg – 13,57 %) женщин и 81,67 % (15 %) мужчин. В группе женщин не выявили РНК ВГС, РНК ВИЧ обнаружена в 1 случае (1,67 %), ДНК ВГВ определена в 26 случаях (18,57 %), в том числе 5 % HBsAg-негативного гепатита В. В группе мужчин РНК ВГС и ВИЧ выявлены в 3,33 и 6,67 % случаев соответственно, а ДНК ВГВ определена у 16,67 % лиц, в том числе у одного человека определен скрытый гепатит В . Показана достоверно более высокая встречаемость ВИЧ у мужчин по сравнению с женщинами (χ2=3,907 при p<0,05). Относительный риск инфицирования ВИЧ у мужчин выше, чем у женщин (RR=9,333; p=0,0291; 95 % ДИ: 1,065–81,815 %). В четырех из пяти выявленных случаев ВИЧ -инфекции определена коинфекция с ВГВ и/или ВГС. Необходимо внедрение скрининга на ВИЧ, ВГС, ВГВ , включая скрытый гепатит В, при обследовании беременных женщин и их партнеров с последующим консультированием пар и вакцинацией против вируса гепатита В.

В 2020 г. при проведении эпизоотологического мониторинга в очаге степного типа на юго-востоке Ростовской области на фоне разлитой эпизоотии в популяциях обыкновенной полевки Microtus arvalis obscurus и общественной полевки Microtus socialis изолировано шесть культур туляремийного микроба от павших и отловленных живыми животных.

Цель работы состояла в разработке схемы SNP-типирования и сравнительном изучении филогенетических связей штаммов Francisella tularensis, изолированных в Ростовской области (2020 г.), со штаммами из других регионов.

Материалы и методы. Полногеномное секвенирование проводили на платформе MiSeq Illumina. Для анализа применяли авторское программное обеспечение GeneExpert, PrimerM и VirtualPCR, написанное на языке программирования Java.

Результаты и обсуждение. Штаммы возбудителя туляремии, выделенные на территории Ростовской области в 2020 г., можно распределить между двумя различными кластерами. Установлено, что два штамма возбудителя туляремии (F0884 и F0889), выделенные на территории Турции, генетически близки к некоторым изолятам, циркулирующим в Ростовской области. Выявлен уникальный INDEL-маркер, характерный для данной группы штаммов. Проведенное сравнение предлагаемой нами схемы типирования со схемой «канонических» SNP показало довольно хорошее схождение результатов в пределах больших кластеров, при этом использование набора из 6626 SNP позволяет дифференцировать штаммы внутри одного canSNP-типа. Выявлено, что вакцинный штамм имеет общий canSNP-тип с клиническими и природными штаммами. Подобран набор SNP-маркеров для проведения сравнительного анализа. Обнаружен новый INDEL-маркер, позволяющий проводить внутривидовое типирование F. tularensis, и доказана возможность его использования in vitro и in silico.

Существует необходимость разработки антирабических вакцин нового поколения, обеспечивающих достижение протективного уровня антител после однократного введения. Перспективы решения данной проблемы открывают последние разработки в области «обратной вакцинологии». Основным параметром, определяющим эффективность рекомбинантных вакцин, является дизайн антиген-кодирующей последовательности.

В связи с этим целью работы явилось проведение биоинформатического анализа пептидов вируса бешенства (Rabies lyssavirus, Rhabdoviridae) для выявления иммуногенных эпитопов.

Материалы и методы. Анализ 5 кандидатных протеиновых последовательностей более 100 штаммов и эпизоотических изолятов вируса бешенства проводили с использованием стандартных методов in silico прогнозирования по базе данных иммуногенных эпитопов The Immune Epitope Database (IEDB) (NIH, США).

Результаты и обсуждение. В результате анализа первичных аминокислотных последовательностей, проведенного с использованием наиболее часто применяемых инструментов биоинформатики, установлено количество иммуногенных эпитопов и типы выявленного иммунного ответа (T- и B-клеточные эпитопы, эпитопы связывания с МНС I класса) для вирусных белков: гликопротеина (G), нуклеопротеина (N), фосфопротеина (P), матричного протеина (М), РНК -зависимой РНК -полимеразы (L). В аминокислотной структуре указанных белков дополнительно идентифицированы сайты N- и О-гликозилирования, сигнальные пептиды и трансмембранные домены. В целях прогнозирования безопасности и эффективности данных белков в качестве компонентов рекомбинантных вакцин проведена in silico оценка их физико-химических свойств. Несмотря на то, что превалирующее количество эпитопов сосредоточено в структуре гликопротеина, эпитопы остальных белков, ранжируясь по уровню антигенности и консервативности, также могут представлять интерес в качестве компонентов профилактических препаратов либо диагностикумов. Представленные данные могут быть использованы при дизайне вставки в ходе конструирования вирус-векторной кандидатной вакцины либо контрольных положительных образцов в диагностических методах, основанных на индикации фрагментов вирусного генома.

Цель работы – изучение структуры гена алкилсульфатазы (asu) у штаммов Vibrio cholerae различных серогрупп, а также сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей алкилсульфатаз с использованием различных методов биоинформационного анализа.

Материалы и методы. В работе использовали 483 штамма V. cholerae серогрупп О1, О139 и nonO1/nonO139. Поиск гена, его копийность и локализацию проводили с помощью программы Blast. Нуклеотидную и соответствующую аминокислотную последовательности гена, а также его структуру изучали с помощью биоинформационного анализа. Секвенирование проводили на платформе MiSeq (Illumina). Ферментативную активность детектировали с использованием среды, подтверждая наличие/отсутствие гена методом ПЦР in vitro и in silico.

Результаты и обсуждение. Проведен биоинформационный анализ нуклеотидной и соответствующей аминокислотной последовательностей гена asu и изучена его структура. В структуре гена выявлено четыре функциональных домена. В бета-лактамазном домене обнаружена консервативная аминокислотная последовательность -HAHADH- у всех штаммов холерных вибрионов, входящая в Zn²⁺-связывающий мотив. Установлено, что алкилсульфатаза холерных вибрионов относится к семейству Zn²⁺-зависимых-β-лактамаз. Blast-анализ выявил сходство нуклеотидных и аминокислотных последовательностей алкилсульфатаз представителей V. cholerae серогрупп O1 и O139 (ctxAB⁺tcpA⁺) с представителями родов Aeromonas и Pseudomonas, что совпало с данными 3D-моделирования структур аминокислотных последовательностей фермента алкилсульфатазы у этих микроорганизмов. Биоинформационный анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей алкилсульфатаз у холерных вибрионов выявил их консервативность у токсигенных штаммов и наличие ряда единичных мутаций в гене asu у атоксигенных. Наличие или отсутствие гена asu установлено методом ПЦР in vitro и in silico и подтверждено результатами, полученными с помощью программы Blast. Продемонстрировано, что наличие/отсутствие гена asu коррелирует со способностью/неспособностью штаммов О139-серогруппы гидролизовать додецилсульфат натрия (SDS) на среде. Эти данные могут быть использованы в изучении механизмов, лежащих в основе адаптации/персистенции и патогенности холерных вибрионов.

С первых дней распространения SARS‑CoV‑2 работники медицинских организаций (МО) стали группой риска в аспекте заболевания, тяжелого течения и летального исхода.

Цель исследования – изучить влияние мер специфической и неспецифической профилактики на риск инфицирования SARS‑CoV‑2 у работников МО в условиях крупного промышленного региона в период пандемии COVID‑19.

Материалы и методы. Проведен анализ данных опросника персонала инфекционных госпиталей для лечения больных COVID‑19 и непрофильных МО крупного промышленного региона в период пандемии COVID‑19 (1905 шт.), опросника по оценке приверженности сотрудников инфекционного госпиталя гигиене и антисептике рук (100 шт.), результатов определения специфических IgG к нуклеокапсиду вируса SARS‑CoV‑2 (2200 проб), результатов исследований вирусно-бактериальной контаминации наружной поверхности средств индивидуальной защиты работников инфекционного госпиталя (108 проб).

Результаты и обсуждение. В ходе исследования установлено влияние дефектов реализации отдельных мер специфической и неспецифической профилактики на увеличение заболеваемости COVID‑19 работников МО различного профиля. Пандемия COVID‑19 еще раз подчеркнула необходимость сохранения жизни и здоровья работников МО как социально значимой категории граждан при распространении возбудителей, имеющих высокий эпидемический потенциал, с применением комплекса специфических и неспецифических мер, взаимно не исключающих друг друга.

Временное прекращение работы школ является эффективной противоэпидемической мерой в периоды подъема заболеваемости ОРВИ и гриппом, что подтверждается результатами большого числа научных работ. Эффективность указанной меры главным образом заключается в снижении уровня заболеваемости среди учащихся. В условиях распространения COVID‑19 в Российской Федерации, как и во многих странах, также неоднократно осуществлялся временный перевод школьников на дистанционное обучение, однако остается неясным, является ли рассматриваемая мера эффективной относительно новой коронавирусной инфекции.

Цель исследования – оценка эпидемиологической эффективности временного перевода учащихся на дистанционное обучение в период распространения COVID‑19 в Саратовской области.

Материалы и методы. Анализ проведен на основании статистических данных Управления Роспотребнадзора по Саратовской области по заболеваемости COVID‑19 за период с 2020 по 2022 г., а также материалов опубликованных научных работ.

Результаты и обсуждение. При анализе данных в период закрытия школ в 2020 г. зафиксировано снижение заболеваемости среди школьников (–42,9 %), а также выявлен подъем заболеваемости среди лиц 65 лет и старше (+7,2 %); в 2021 г. Наблюдалось снижение заболеваемости среди учащихся (–15,6 %) и повышение данного показателя среди лиц пожилого возраста (+17,8 %); в 2022 г. очередное закрытие школ привело к росту заболеваемости COVID‑19 среди учащихся (+7,8 %) и лиц старше 65 лет (+44,2 %). В случае с COVID‑19 рассматриваемая мера является нецелесообразной ввиду того, что в эпидемический процесс активнее вовлекается наиболее уязвимая категория населения (лица 65 лет и старше), что в свою очередь приводит к значительному ухудшению эпидситуации.

Цель исследования – оценка эффективности использования разработанных сибиреязвенных магноиммуносорбентов (МИС ) для селективного концентрирования спор Bacillus anthracis и повышения чувствительности методов детекции возбудителя сибирской язвы, в том числе при исследовании проб почвы.

Материалы и методы. Исследование проведено на 10 вакцинных штаммах B. anthracis, 30 штаммах близкородственных бацилл рода Bacillus (B. cereus – 15, B. thuringiensis – 10, B. megaterium – 5) с типичными видовыми свойствами. В работу были взяты три экспериментальные серии магноиммуносорбентов. Экстракцию ДНК и постановку ПЦР проводили согласно инструкции по применению набора реагентов для выявления ДНК B. anthracis «АмплиСенс Bacillus anthracis-FRT».

Результаты и обсуждение. Показано, что при использовании МИС чувствительность культурального метода возрастает не менее чем в 7 раз (с учетом возможности сорбции на частице сорбента 1–10 и более спор). Чувствительность ПЦР -метода возрастает в 10 раз и составляет 50 спор B. anthracis в 1 мл для образцов, концентрированных на МИС . При исследовании искусственно контаминированных спорами B. Anthracis проб почвы с использованием МИС чувствительность бактериологического метода возрастает в 7,5 раза. Таким образом, применение разработанных МИС позволяет существенно повысить чувствительность методов детекции возбудителя сибирской язвы и может рассматриваться в качестве эффективного способа пробоподготовки при исследовании объектов окружающей среды (почвы).

Цель работы – выявление генотипических особенностей клональных комплексов, образуемых CTX–VPI⁺ штаммами холерных вибрионов, выделенными в разные годы из водоемов Ростовской области, на основе биоинформационного анализа их полногеномных сиквенсов (WGSs).

Материалы и методы. Полногеномное секвенирование выполняли на платформе MiSeq (Illumina), идентификацию в WGSs генетических детерминант и биоинформационный анализ – с использованием программ BioEdit, BLASTN, BLASTP, CARD, Vector NTI.

Результаты и обсуждение. В каждой группе изолятов 2002, 2005, 2007, 2020, 2021, 2022 гг. штаммы были практически идентичными и обнаруживались в разных точках отбора проб воды в течение более или менее длительных периодов (от 3 недель до 2 месяцев). Биоинформационный анализ WGSs представителей этих групп показал их разделение на 4 кластера, которые можно рассматривать как отдельные клональные комплексы, отличающиеся рядом характерных генетических маркеров: 1) изоляты 2002 г., содержащие один SNP в регуляторном гене rpoS; 2) штаммы 2007 г., несущие тандемно дуплицированный профаг preCTX; 3) штаммы, выделенные в 2020 г. в Ростове-на-Дону и в 2005 г. во время эпидосложнений в Каменском районе Ростовской области, которые имели «гибридный» остров патогенности, включающий кластер системы секреции 3-го типа и nan-nag-область острова VPI-2, а в гене rpoS присутствовало 9 SNP; 4) штаммы 2021 и 2022 гг. и единичный изолят 2018 г., содержащие делецию 9 п.н. в гене коллагеназы vchC. Несмотря на выявленные различия, представители всех клональных комплексов обладали достаточными наборами интактных детерминант факторов патогенности/персистенции для реализации вирулентных свойств и для обеспечения способности к выживанию в водоемах. Обнаружение в поверхностных водоемах клональных комплексов потенциально патогенных штаммов свидетельствует о периодическом создании благоприятных условий для их продолжительной циркуляции, что подчеркивает значимость постоянного мониторинга за холерными вибрионами на территории России.

Цель работы – сравнительный анализ спектра и антибиотикорезистентности возбудителей вторичных пневмоний, выделенных на территориях Ростовской, Тюменской областей и Хабаровского края на фоне пандемии новой коронавирусной инфекции.

Материалы и методы. Исследованы образцы мокроты от SARS‑CoV‑2-позитивных и SARS‑CoV‑2-негативных пациентов с внебольничными пневмониями из медицинских организаций с использованием бактериологического метода, ПЦР , масс-спектрометрии.

Результаты и обсуждение. Изучение этиологической структуры возбудителей вторичных пневмоний, выделенных от больных в медицинских организациях Южного, Уральского и Дальневосточного федеральных округов, показало, что доминирующими культурами у SARS‑CoV‑2-позитивных и SARS‑CoV‑2-негативных пациентов являются дрожжи и дрожжеподобные грибы. Обнаружено, что при разнообразии изолированных грибов превалировал вид Candida albicans. Бактериальная микрофлора представлена разнообразными грамположительными и грамотрицательными бактериями, из которых наиболее часто в мокроте присутствовали Staphylococcus aureus и Klebsiella pneumoniaе. Установлено также, что еще до госпитализации больных внебольничные пневмонии могут быть обусловлены микроорганизмами группы ESKAPE (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniaе, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp.), которые обычно рассматриваются как полиантибиотикорезистентные возбудители нозокомиальных инфекций. Более того, у SARS‑CoV‑2-позитивных пациентов с вторичной внебольничной пневмонией эти возбудители выделялись в 2–3 раза чаще, чем у SARS‑CoV‑2-негативных больных. При анализе чувствительности/устойчивости изолированных штаммов к антибактериальным препаратам установлена общая тенденция: большинство штаммов, вне зависимости от вида, характеризовались узким спектром чувствительности, имея три и более маркеров антибиотикорезистентности. Это подтверждает необходимость и целесообразность микробиологического сопровождения больного в течение всего инфекционного процесса. Наиболее адекватными препаратами выбора, обеспечивающими активность против 60–70 % штаммов семейства Enterobacteriaceae, являются амикацин и цефоперазон/сульбактам.

При определении способности штаммов Vibrio cholerae агглютинироваться диагностическими холерными сыворотками возможны затруднения при отнесении вибрионов к той или иной серогруппе в случае отклонения культуры от типичных по агглютинабельности признаков. Изучение генетических детерминант, позволяющих установить серогруппу, является актуальной задачей при проведении мониторинга контаминации холерными вибрионами поверхностных водоемов.

Целью данной работы явилось сравнительное изучение структурной организации липополисахаридных кластеров (O-LPS) штаммов холерных вибрионов R-вариантов.

Материалы и методы. Полногеномное секвенирование проведено на приборе Illumina MiSeq. Cборка осуществлялась de novo программой-сборщиком SPAdes (v. 3.11.1). Для поиска генов использовали программу blastn 2.5.0, для аннотирования входящих в кластеры генов – программу GeneMarkS. Поиск гомологичных участков проводили с помощью программы nucmer. Визуализация O-LPS-кластеров выполнена в программе SnapGene Viewer.

Результаты и обсуждение. Кластеры генов, ответственных за биосинтез О-антигена, различались у разных штаммов V. Cholerae R-вариантов. Определено три типа O-LPS-кластеров, отличающихся размером и количеством входящих в их состав генов. Уникальных участков ДНК, общих для всей группы штаммов V. cholerae R-вариантов, обнаружить не удалось. Определены два гена, встречавшиеся у всех R-вариантов, но они не являются уникальными для этой группы штаммов и присутствуют также у представителей других серогрупп. Для двух типов кластеров обнаружен общий с V. cholerae O1 участок, содержащий IS-элемент.

Цель работы – проанализировать пространственно-временные особенности динамики эпидемического процесса клещевого вирусного энцефалита (КВЭ ) на территории Иркутской области за 2001–2021 гг.

Материалы и методы. Проанализированы данные Управления Роспотребнадзора по Иркутской области, Референс-центра Иркутского научно-исследовательского противочумного института, материалы государственной статистической отчетности формы № 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях», научные публикации. Прослежены хронологические и хорологические особенности изменения инцидентности КВЭ. В последнем случае проведена дифференциация административно-территориальных образований (АТО) субъекта по группам эпидемиологического риска за два десятилетних периода: 2001–2010 гг. и 2011–2020 гг. На каждом временном отрезке группировка районов по уровню инцидентности КВЭ проведена с применением расчета 95 % доверительного интервала. Временные последовательности наблюдений анализировали с помощью построения регрессионных уравнений. Использованы стандартные методы вариационной статистики в программе Excel.

Результаты и обсуждение. На протяжении XXI столетия заболеваемость КВЭ в Иркутской области снижается. По данным 2001–2010 гг., в шести АТО случаи КВЭ отсутствовали, а эндемичные районы включали три группы: с низкой (15 районов), средней (6) и высокой (8) инцидентностью КВЭ . Отдельно проведен анализ заболеваемости в административном центре субъекта – г. Иркутске. В 2011–2020 гг. структура АТО различного эпидемиологического риска КВЭ претерпела изменение. Выделено шесть неэндемичных районов, группы низкого (12 АТО), среднего (9), высокого (6) и очень высокого (2) эпидемиологического риска. Изменилось пространственное расположение зон высокого эпидемиологического риска, причем их площадь возросла. Каждый кластер АТО с различной заболеваемостью КВЭ в 2011–2020 гг. охарактеризован по числу случаев КВЭ и объемам мероприятий профилактики инфекции. Сделан вывод о недостаточности объемов профилактических мероприятий в группах АТО высокого и очень высокого эпидемиологического риска.

В последние десятилетия на Европейском Севере России зафиксирован значительный рост заболеваемости клещевым вирусным энцефалитом (КВЭ) и числа людей, подвергнувшихся нападению клещей.

Цель исследования – анализ динамики заболеваемости КВЭ и количества обратившихся в медицинские организации по поводу присасывания клещей на Европейском Севере России.

Материалы и методы. Использована форма № 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях», результаты оперативного сезонного мониторинга КВЭ, представленные управлениями Роспотребнадзора соответствующих территорий. Статистическая обработка данных выполнялась с помощью программы Microsoft Excel. Отображение результатов на карте выполнено в географической информационной системе ESRI ArcMap.

Результаты и обсуждение. Выполнен совместный анализ данных числа заболевших и заболеваемости КВЭ, числа обратившихся в медицинские организации по поводу присасывания клещей и обращаемости населения по поводу присасывания клещей на 100 тыс. населения для Архангельской области, республик Карелия и Коми и их муниципальных районов. Вычислены значения средних величин и градиентов числа заболевших, заболеваемости (2010–2020 гг.), числа обратившихся в медицинские организации по поводу присасывания клещей, обращаемости населения по поводу присасывания клещей на 100 тыс. населения (2002–2020 гг.). Построены карты средних значений и градиентов величин. Заболеваемость и число заболевших остаются на высоком уровне, превышающем среднероссийский, но снижаются в последнее десятилетие. Количество обратившихся в медицинские организации и обращаемость населения по поводу присасывания клещей на 100 тыс. населения остается на стабильно высоком уровне и не имеет тенденции к снижению. Заболеваемость и обращаемость населения по поводу присасывания клещей на 100 тыс. населения распространяется в северном направлении, захватывая новые территории в Приарктической зоне. Основной движущей силой наблюдаемой эпидемической ситуации на Европейском Севере России являются природные процессы изменения климата.

Широкое распространение заболеваний, передающихся клещами, представляет значительную проблему для общественного здравоохранения и здоровья населения, проживающего в эндемичных районах.

Цель работы – с использованием метода высокопроизводительного секвенирования провести поиск, анализ генетического материала и идентификацию новых вирусных агентов семейства Phenuiviridae в иксодовых клещах, собранных в различных регионах азиатской части России.

Материалы и методы. В исследовании использованы 1460 таежных клещей, собранных в пригородных районах Томска, Екатеринбурга и в Приморском крае. Генетический материал, выделенный из клещей, анализировали методом высокопроизводительного секвенирования с использованием технологии Illumina с последующим филогенетическим анализом.

Результаты и обсуждение. Анализ результатов секвенирования позволил обнаружить протяженные нуклеотидные последовательности L-гена, характерного для вирусов семейства Phenuiviridae. Удалось идентифицировать 20 нуклеотидных последовательностей длиной в среднем 250 п.н. в гомогенатах клещей Ixodes persulcatus. Восемнадцать изолятов идентифицированы как представители рода Uukuvirus и два изолята отнесены к роду Phlebovirus семейства Phenuiviridae. Филогенетический анализ показал, что все изоляты рода Uukuvirus кластеризуются с Tacheng tick virus 2, который относится к виду Tacheng uukuvirus. Они формируют отдельную филогенетическую группу этого вида вируса, близкую к двум румынским вариантам 2019 г. Генетический материал Tacheng tick virus 2 обнаружен во всех трех исследованных регионах азиатской части России. Два томских изолята флебовируса классифицированы как Sara tick phlebovirus. При этом они кластеризовались с двумя изолятами флебовирусов из Карелии. Таким образом, в клещах I. persulcatus, собранных в трех географически различных регионах азиатской части России, обнаружен генетический материал Tacheng tick virus 2 и Sara tick phlebovirus, относящийся к двум родам семейства Phenuiviridae.

Цель исследования – сравнить дискриминирующую способность методов сanSNP13-генотипирования и MALDI-TOF масс-спектрометрии на основании результатов исследования штаммов возбудителя сибирской язвы, принадлежащих к двум основным генетическим линиям А и В.

Материалы и методы. Исследовано 73 штамма Bacillus anthracis из коллекции микроорганизмов ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора. Белковое профилирование проводили на масс-спектрометре Microflex, анализ данных – в среде языка статистического программирования R.

Результаты и обсуждение. Экспериментально подтверждено, что предлагаемый подход для дифференциации протеотипов штаммов B. anthracis с индексом дискриминации 0,952 превышает таковой для метода canSNP-типирования и сопоставим с индексом дискриминации для метода MLVA31. Корреляция результатов кластеризации штаммов при типировании методами MALDI-TOF масс-спектрометрии и canSNP-генотипирования достигает 95 % в отношении разделения на главные генетические линии A и B. Изученные штаммы сибиреязвенного микроба, относящиеся в большинстве случаев к филогенетическим группам линии А, представляют собой более десятка белковых профилей, что может быть связано с различиями в уровне экспрессии белков у штаммов каждого canSNP-генотипа. MALDI-TOF масс-спектрометрия позволяет получить сопоставимые с генетическими тестами результаты, имеет лучшую дискриминирующую способность по сравнению с canSNP-типированием, более проста в выполнении.

Цель исследования – районирование территории Саратовской области с использованием показателей, влияющих на интенсивность эпидемических проявлений геморрагической лихорадки с почечным синдромом (ГЛПС), и оценка риска заражения людей для дифференцированного подхода к организации противоэпидемических мероприятий в природных очагах.

Материалы и методы. При вычислении интенсивности эпидемических проявлений ГЛПС по административно-территориальным образованиям (АТО) области выбраны показатели, в наибольшей степени влияющие на риск заражения: интенсивный показатель заболеваемости населения, показатель инфицированности носителей вирусом ГЛПС, количество рекреационных объектов, показатель лесистости. В работе проанализированы персонифицированные данные заболевших ГЛПС, результаты эпизоотологического мониторинга, использованы сведения о рекреационных объектах и лесном фонде Саратовской области. Вся информация рассмотрена за период 2010–2022 гг. по каждому из административных районов области и г. Саратову. Для вычисления интенсивности эпидемических проявлений применен метод размерности и десятичный логарифм.

Результаты и обсуждение. В результате расчетов к территориям с наивысшей интенсивностью эпидемических проявлений и риском заражения ГЛПС отнесены 8 АТО области, с высокой интенсивностью – 9, средней – 10 и низкой – 12. Эпидемиологический геоинформационный анализ позволил установить, что территории с наивысшей интенсивностью эпидемических проявлений ГЛПС занимают 15,8 % площади области, высокой – 23,8 %, средней – 28,5 %, низкой – 31,9 %. По итогам исследования выделены 16 районов области и г. С аратов как наиболее опасные в плане заражения ГЛПС. Именно эти территории в первую очередь нуждаются в целенаправленном эпизоотологическом мониторинге для заблаговременной и эффективной организации профилактической работы.

Вакцина холерная бивалентная химическая – единственный препарат для профилактики холеры, зарегистрированный в Российской Федерации. Вакцина выпускалась во флаконах стеклянных по 210 таблеток. В то же время современные тенденции диктуют необходимость производства препарата для удобства потребителя в различной фасовке и более практичной упаковке.

Цель работы – исследование стабильности свойств иммунобиологического лекарственного препарата «Вакцина холерная бивалентная химическая» с измененной фасовкой и в новой первичной упаковке.

Материалы и методы. При исследовании качества серий вакцины холерной бивалентной химической оценены физико-химические показатели, содержание формалина, специфическая активность и безопасность, аномальная токсичность, иммуногенность, микробиологическая чистота. Стабильность по показателю «специфическая активность» оценивали методом дот-иммуноанализа.

Результаты и обсуждение. В результате выполнения данной работы экспериментально обосновано применение нескольких вариантов фасовки и новой первичной упаковки холерной вакцины. Установлена стабильность готового препарата вакцины в тесте «ускоренного старения» и при длительном хранении. Экспериментально показана возможность использования дот-иммуноанализа с использованием конъюгата на основе стафилококкового белка А, меченного коллоидным золотом, для мониторинга стабильности холерной вакцины.