ОБЗОРЫ 
Цель обзора – прогноз заболеваемости клещевым вирусным энцефалитом (КВЭ) в Российской Федерации на 2023 г. на основе анализа эпидемиологической ситуации по КВЭ за 2012–2022 гг. в течение десятилетия наибольшая заболеваемость КВЭ наблюдалась в Сибирском, Приволжском и Уральском федеральных округах. в 2022 г. На второе место вышел уральский федеральный округ, почти в два раза уменьшилась доля Северо-Западного федерального округа. ранжирование территорий по заболеваемости КВЭ на уровне субъектов позволило отнести 16 из них к группе регионов с высокой эпидемической опасностью, 14 – к средней, 18 – к низкой. В 2022 г. заболеваемость КВЭ в стране возросла в 1,9 раза по сравнению с 2021 г. и составила 1,34 0/0000. несмотря на рост заболеваемости КВЭ в 2022 г., значимый тренд к ее снижению сохранился. Вирусофорность клещей, снятых с людей, в 2022 г. была ниже среднемноголетних значений при их изучении методами ПЦР и ИФА. Инфицированность клещей с объектов окружающей среды при использовании ПЦР была выше среднемноголетних значений, а ИФА – ниже. в 2022 г. против КВЭ привито 3,5 млн человек (вакцинировано и ревакцинировано). экстренной профилактикой иммуноглобулином охвачено 24,5 % от числа пострадавших от присасывания клещей (дети – 34,3 %). Прогноз заболеваемости КВЭ на 2023 г. остается благоприятным. в стране ожидается снижение инцидентности КВЭ до (0,83±0,298) 0/0000. вместе с тем среди пострадавших от присасывания клещей в 2022 г. произошел рост не только числа случаев КВЭ, но и доли клинических проявлений болезни, а также летальных случаев. если эта закономерность сохранится, то заболеваемость КВЭ в 2023 г. будет выше прогнозируемой, особенно в субъектах с сильным ростом доли людей, заболевших КВЭ, среди пострадавших от присасывания клещей.
Бактериальные тени представляют собой неповрежденные оболочки бактериальных клеток, которые освобождаются от своего содержимого через поры, сформированные с помощью мягких методов биологического или химического воздействия. Методология получения бактериальных теней повышает безопасность убитых вакцин, сохраняя при этом их антигенность за счет щадящих процедур приготовления. Более того, бактериальные тени могут быть одновременно носителями нескольких антигенов или плазмидных ДНК, кодирующих белковые эпитопы. В последние годы наблюдается рост интереса к разработке прототипов вакцин и систем доставки биологически активных веществ на основе бактериальных теней. В настоящем обзоре обсуждается прогресс в разработке данного типа препаратов за последние годы. Рассмотрены различные способы получения бактериальных теней, их преимущества и ограничения при использовании. Подробно описан лизис бактерий, опосредованный фагами, молекулярные манипуляции с генами лизиса, трудности, возникающие при масштабировании биотехнологического производства бактериальных теней, и пути их преодоления. Рассмотрено использование бактериальных теней в качестве альтернативных убитых вакцин, адъювантов, рекомбинантной антигенной платформы, носителя плазмидной ДНК на моделях возбудителей особо опасных инфекций бактериальной этиологии.
Вирус Нипах (Nipah virus, NiV) – представитель рода Henipavirus семейства Paramyxoviridae, является возбудителем опасной инфекционной болезни с широким спектром клинических проявлений: от бессимптомной (субклинической) формы до тяжелого энцефалита со смертельным исходом. Несмотря на регистрацию заболевания, вызванного данным вирусом, только в странах Юго-Восточной Азии, не исключена возможность завоза возбудителя на неэндемичные территории. Также данный патоген способен инфицировать не только большое количество людей, но и животных, являясь причиной тяжелых заболеваний и нанося значительный экономический ущерб, поэтому представляет собой как медицинскую, так и ветеринарную проблему. В настоящем обзоре приведены имеющиеся в современной печати данные о строении и классификации вируса Нипах, возможных циклах его передачи, распространении, методах индикации и идентификации возбудителя в клиническом и биологическом материале, а также эффективности их применения в зависимости от сроков начала заболевания и об имеющихся коммерческих диагностических и профилактических препаратах.
В обзоре кратко изложена информация о врожденной способности клеток возбудителя туляремии Francisella tularensis subsp. holarctica сопротивляться противомикробным препаратам с помощью разнообразных механизмов, приводящей к его мультирезистентности. Всего, с учетом новых территорий, в 2022 г. в Российской Федерации зарегистрировано 120 случаев инфицирования человека возбудителем туляремии. Эпизоотические проявления инфекции различной степени интенсивности выявлены в 58 субъектах РФ. На этом фоне спорадические случаи заболевания людей туляремией зарегистрированы в 18 регионах страны. Вспышка туляремии произошла в Ставропольском крае, заболевание легкой и средней степени тяжести обнаружили у 76 человек. Продолжается повышенная заболеваемость туляремией на территории Республики Карелия с тяжелыми случаями болезни при отсутствии иммунопрофилактики этой инфекции в регионе. Всего выделена 61 культура возбудителя туляремии F. tularensis subsp. holarctica, из которых 20 эритромицин-устойчивых штаммов изолировано на территории Ставропольского края. Кроме этого, выделено 8 культур F. tularensis subsp. mediasiatica из пробы ила и клещей Dermacentor silvarum и Haemaphysalis concinna, отловленных в Республике Алтай. На территории Российской Федерации в 2022 г. вакцинировано и ревакцинировано против туляремии 930999 человек. На основании анализа данных, полученных в 2022 г., наиболее вероятны в 2023 г. эпидемические осложнения в виде спорадических случаев заболевания среди невакцинированного населения на территориях: Центрального федерального округа – во Владимирской, Рязанской и Смоленской областях; Северо-Западного федерального округа – в Архангельской области и Республике Карелия; Южного федерального округа – в Волгоградской и Ростовской областях; на территории Северо-Кавказского федерального округа будет оставаться сложной ситуация в Ставропольском крае; в Приволжском федеральном округе – на территориях Саратовской области, а также в Кировской области и Республике Мордовия; Уральского федерального округа – в Ханты-Мансийском и Ямало-Ненецком автономных округах; Сибирского федерального округа – на территориях отдельных районов Омской, Кемеровской, Томской, Новосибирской, Иркутской областей, Алтайского, Красноярского краев; в Дальневосточном федеральном округе эпизоотическая активность природных очагов туляремии наиболее интенсивная на территории Приморского края.
В статье рассмотрена современная ситуация по вызванному высокопатогенным вирусом гриппу птиц в 2022 г. и сделан прогноз возможного дальнейшего распространения вирусов на территории России. В 2022 г. в мире отмечена циркуляция широкого разнообразия вариантов вируса, имеющих важное эпизоотологическое и эпидемиологическое значение. Вспышки вызванного высокопатогенным вирусом гриппа птиц зарегистрированы более чем в 60 странах. Помимо этого, зафиксированы случаи инфицирования людей вирусами гриппа подтипов A(H5Nx) и A(H9N2). В России в 2022 г. зарегистрирована эпизоотия, которая затронула более 10 регионов европейской части и Дальнего Востока. Вспышки среди диких и домашних птиц были вызваны высокопатогенным вариантом вируса гриппа A(H5N1) клады 2.3.4.4b, при этом среди циркулирующих на территории России вирусов выявлено генетическое и антигенное разнообразие. Таким образом, в очередной раз показана важная географическая роль территории России в глобальном распространении вируса гриппа птиц, что подчеркивает важность постоянного его мониторинга на территории нашей страны.
Цель обзора – проанализировать и оценить эпидемиологическую ситуацию по холере в мире и России в 2013–2022 гг. и дать прогноз на 2023 г. В период 2013–2022 гг. выявлено 500 пораженных холерой административных территорий в различных регионах 71 страны Азии, Африки и Америки (регион Карибского бассейна) с формированием 69 эндемичных очагов в 16, 41 и 12 странах соответственно. В 2022 г. зарегистрирован 1209301 случай холеры в 36 странах мира. Усилилась интенсивность эпидемического процесса в странах Азии (Сирия, Ливан). Сохранилась неблагополучная эпидемиологическая обстановка на Африканском континенте. Продолжались эпидемии и крупные вспышки, которые начались в 2021–2022 гг. в связи с чрезвычайными ситуациями (ЧС) социального и природного характера. Прогноз о стабильности эпидемиологической ситуации по холере на территориях субъектов РФ, данный на 2022 г., подтвердился. В 2022 г. из водных объектов окружающей среды (ООС) выделено 43 нетоксигенных штамма Vibrio cholerae О1, от людей – 8 штаммов V. cholerae nonO1/nonO139. Показано сходство указанных штаммов с генетически близкородственными штаммами, выделенными в ходе мониторинга в предшествующие годы в России, Донецкой Народной Республике (ДНР) и Запорожской области. В 2023 г. сохранятся риски завоза инфекции на территорию РФ, связанные с активизацией эпидемического процесса в странах Азии, Африки и регионе Карибского бассейна. Повышению степени рисков способствует протяженная граница с Украиной, куда вероятен завоз холеры из эндемичных стран. Не исключается и биотерроризм. Последствия возможного эпидосложнения по холере в ДНР , Луганской Народной Республике, Запорожской и Херсонской областях усугубляются ЧС , приводящей к нарушению инфраструктуры, перебоям водоснабжения и др. При отсутствии реализации рисков завоза этой инфекции на территории РФ будет сохраняться стабильная эпидемиологическая обстановка по холере. Прогнозируется обнаружение в водных ООС нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О1-серогруппы (не исключая вероятность формирования клональных комплексов), а также штаммов nonО1/nonО139, которые могут явиться этиологическим фактором спорадических случаев или вспышек диарейных заболеваний.
Целью работы являлась оценка эпидемической обстановки по чуме в мире и эпизоотической активности природных очагов чумы Российской Федерации в 2022 г. В результате выполнения комплексных планов профилактических мероприятий отмечено снижение эпизоотической активности Горно-Алтайского высокогорного и Тувинского горного природных очагов, прекращение эпизоотий чумы в Центрально-Кавказском высокогорном очаге. Общая площадь эпизоотий в 2022 г. в Российской Федерации составила 248,3 км2, что в 7 раз меньше, чем в 2021 г. В Терско-Сунженском низкогорном, Дагестанском равнинно-предгорном, Прикаспийском Северо-Западном степном, Волго-Уральском степном, Забайкальском степном, Волго-Уральском песчаном, Прикаспийском песчаном, Восточно-Кавказском высокогорном природных очагах зараженные животные не обнаружены. В 2023 г. прогнозируется сохранение напряженной эпизоотологической обстановки на территории Республики Алтай и Республики Тыва. Обоснована перспективность использования ГИС -портала ФКУН Российский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора для оперативной оценки реально складывающейся эпидемиологической обстановки в природных очагах чумы.
В обзоре представлен анализ эпидемиологической ситуации по лихорадке Западного Нила (ЛЗН ) в Российской Федерации в 2022 г. и обобщены результаты мониторинга за возбудителем. Определены следующие особенности эпидемического процесса ЛЗН в России: снижение (в 4 раза) заболеваемости относительно среднемноголетних значений при чрезвычайно экстенсивном характере проявлений (16 субъектов в 6 федеральных округах), в том числе с выявлением местных случаев на 5 новых территориях (Тверская, Тамбовская, Владимирская области, Ханты-Мансийский автономный округ и Карачаево-Черкесская Республика), преимущественная регистрация заболеваемости в Центральном федеральном округе (51 %), раннее начало и окончание эпидемического сезона. В структуре заболеваемости отмечено снижение доли нейроинвазивных форм, преобладание удельного веса лиц женского пола и возрастной группы «60 лет и старше», а также рекордные значения показателя заразившихся по месту проживания в городах, что связано с особенностями выявления случаев, а именно проведением скрининговых обследований Референс-центром в группе лихорадящих пациентов стационаров, по результатам которых диагностировано 60 % от всех зарегистрированных больных ЛЗН в России. Мониторинговыми исследованиями Референс-центра на территории субъектов Центрального, Южного и Северо-Кавказского федеральных округов подтверждена интенсивная циркуляция возбудителя. Низкий уровень официально зарегистрированной заболеваемости обусловлен недостаточно эффективным выявлением больных. Молекулярно-генетические исследования показали, что на территории европейской части России как в эпизоотическом, так и в эпидемическом циклах циркулировал вирус Западного Нила 2-го генотипа. Посредством филогенетического анализа установлена принадлежность 4 изолятов вируса Западного Нила, выделенных в Астраханской, Волгоградской областях, Республике Калмыкия и Ставропольском крае в 2022 г., к новому геноварианту 2-го генотипа, впервые выявленному в России в 2021 г. Прогнозируется возможное осложнение эпидемиологической обстановки во всех федеральных округах центра и юга европейской части России.
В работе проведен анализ эпидемиологического процесса геморрагической лихорадки с почечным синдромом (ГЛПС ) в Российской Федерации в разрезе федеральных округов в 2022 г. и подготовлен прогноз заболеваемости ГЛПС на 2023 г. В 2022 г. в России отмечен рост заболеваемости ГЛПС в три раза по сравнению с показателями 2021 г. Результаты эпизоотологических обследований и лабораторных исследований в отдельных федеральных округах свидетельствуют о сохраняющейся напряженной эпидемиологической ситуации по ГЛПС. В ряде регионов страны прогнозируется высокий риск заражения ГЛПС в связи с благоприятными природно-климатическими условиями зимнего периода 2022/23 г. для резервуарных хозяев патогенных для человека ханта-вирусов. Выявление инфицированных грызунов свидетельствует о высокой вероятности осложнения эпидемиологической обстановки на территориях повышенной эпидемической опасности по ГЛПС.
ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ 
Цель – разработка методических подходов к оценке экономического ущерба, связанного с заболеваемостью геморрагической лихорадкой с почечным синдромом (ГЛПС), расчет экономического ущерба на примере вспышки ГЛПС в Саратовской области в 2019 г. Материалы и методы. Проанализированы экономические показатели Федеральной службы государственной статистики; данные по заболеваемости населения ГЛПС в РФ в 2019–2022 гг. Для расчета стоимости амбулаторной и стационарной медицинской помощи, а также расходов, связанных с диспансеризацией переболевших, использованы показатели Программы государственных гарантий бесплатного оказания гражданам медицинской помощи на 2022 год и на плановый период 2023 и 2024 годов. Расчет экономических потерь, связанных с выплатами пособий по временной нетрудоспособности, производили согласно формуле, представленной в Федеральном законе от 29.12.2006 № 255-ФЗ (ред. от 07.10.2022). Экономические потери, связанные с преждевременной смертью в экономически активном возрасте, рассчитывались исходя из значения непроизведенного валового внутреннего продукта (ВВП) вследствие потерянных лет жизни в соответствующей возрастной группе. Результаты и обсуждение. Затраты на лечение, реабилитацию и выплату пособий по временной нетрудоспособности одного больного ГЛПС в возрасте от 0 до 56,5 лет для женского населения и от 0 до 61,5 лет для мужского населения составляют 140495 рублей; в возрасте старше 56,5 и 61,5 лет, соответственно – 95412 рублей. Каждый летальный случай ГЛПС в возрасте от 0 до 16 лет среди мужского населения обходится государству в 38976231 рубль; среди женского населения – 34708331 рубль; в трудоспособном возрасте значение экономического ущерба разнится в зависимости от возраста человека, умершего в результате заболевания ГЛПС. Экономический ущерб от вспышки ГЛПС в Саратовской области (2019 г.), с учетом прямых затрат системы здравоохранения и непрямых потерь в экономике страны, составил 441453432 рубля. Подчеркнуто, что в структуре основного ущерба превалируют непрямые потери в экономике, обусловленные преждевременной смертью лиц экономически активного возраста.
Цель работы – получить и охарактеризовать гибридомы-продуценты моноклональных антител к антигенам коронавируса SARS‑CoV‑2, перспективных для конструирования диагностических иммунохимических тестов. Материалы и методы. Для иммунизации мышей линии BALB/c использовали рекомбинантные антигены NP и RBD SARS-CоV-2. Антигенные препараты сорбировали на геле алюминия гидроксида и вводили подкожно мышам линии BALB/c с интервалом 7 дней. Слияние иммунных спленоцитов с клетками миеломной опухоли SP2/0-Ag14 проводили с помощью ПЭГ -1450. Отбор гибридом, секретирующих анти-NP- и анти-RBD-антитела, проводили методом непрямого иммуноферментного анализа (ИФА) в 96-луночных планшетах с сорбированными препаратами NP и RBD. Для клонирования гибридом использовали метод предельных разведений. Изучение секреторных свойств полученных клонов проводили при культивировании in vitro в 24-луночных культуральных планшетах. Иммуноасцитические жидкости получали при культивировании гибридных клеток в брюшной полости мышей линии BALB/c. Моноклональные антитела очищали методом аффинной хроматографии на сорбенте протеин А-сефарозе, конъюгировали с пероксидазой хрена и проверяли возможность использования в сэндвич-варианте ИФА для детекции инактивированного коронавируса SARS-CоV-2 штамма «Изолят В». Результаты и обсуждение. В результате гибридизаций и отбора клонов получены гибридомы-продуценты моноклональных антител к NP и RBD коронавируса SARS-CоV-2. При культивировании in vitro и in vivo клоны характеризовались стабильностью пролиферативной и антителопродуцирующей активности. Использование моноклонального антитела 415D12 в качестве захватывающего и конъюгированного с пероксидазой хрена 411D12 в качестве детекторного моноклонального антитела в ИФА позволяет выявить коронавирус SARS-CоV-2 в минимальной концентрации 1·103 БОЕ /мл.
Цель работы – анализ генетической структуры популяций и изучение закономерностей эволюционной изменчивости возбудителя новой коронавирусной инфекции в Сибирском и Дальневосточном федеральных округах. Материалы и методы. Исследовано 1033 генома SARS-CoV‑2 из проб от лиц с диагнозом COVID‑19 из восьми субъектов Сибири и Дальнего Востока с декабря 2020 г. по ноябрь 2021 г. Секвенирование проводилось на платформе MinION Oxford Nanopore по протоколу ARTIC v.3. Степень генетической изоляции SARS-CoV‑2 оценивалась по критерию Fst. Филогенетический анализ осуществлялся с использованием метода максимального правдоподобия и байесовского филогенетического вывода. При реконструкции популяционной динамики применена непараметрическая модель Bayesian Skyline Plot (BSP). Результаты и обсуждение. На начальных этапах в 100 % идентифицирован исходный вариант SARS-CoV‑2 (B.1), геновариант Alpha обнаруживался в марте – июне 2021 г., Beta – в единичных образцах в марте – мае 2021 г., Delta впервые выявлен в апреле 2021 г. Максимальная степень генетической изоляции SARS-CoV‑2 (Fst=0,18) установлена для наиболее удаленных территорий (Алтайский край ↔ Республика Бурятия и Алтайский край ↔ Иркутская область). Между Иркутской областью, Республикой Бурятия и Красноярским краем выявлена относительно свободная циркуляция вируса. По результатам популяционно-генетических тестов показано, что определяющим механизмом формирования генетического разнообразия SARS-CoV‑2 стал резкий рост эффективного размера популяции вируса. Реконструкция популяционной динамики в BEAST (модель BSP) выявила согласованность трендов генетического разнообразия вируса и количества активных случаев заболевания. В кластере Delta выявлено два субкластера, состоящих преимущественно из образцов, выделенных в Иркутской области и Красноярском крае. Установлена смена доминирующего варианта SARS-CoV‑2 в динамике. Молекулярно-эпидемиологические данные свидетельствуют о существовании множественных путей проникновения различных генотипов SARS-CoV‑2 в субъекты с формированием отдельных монофилетических кластеров и дальнейшим внутри- и экстерриториальным распространением входящих в кластеры вариантов.
В 2022 г. в эндемичных по клещевому вирусному энцефалиту (КВЭ) и иксодовым клещевым боррелиозам (ИКБ) субъектах Российской Федерации, федеральных округах и в целом по стране произошел рост заболеваемости. Одновременно среди людей, пострадавших от иксодовых клещей, возросла доля клинических форм болезней. Цель – провести анализ возможных причин одновременного роста заболеваемости трансмиссивными инфекциями и доли клинических форм среди лиц, пострадавших от присасывания клещей, на примере материалов по Красноярскому краю. Материалы и методы. Анализировали заболеваемость КВЭ и ИКБ среди лиц, перенесших или нет COVID‑19, число людей, пострадавших от присасывания клещей за 2021–2022 гг. в Красноярском крае. Статистическая обработка выполнена стандартными методами вариационной статистики с применением программы Excel. Результаты и обсуждение. Показано, что в Красноярском крае при снижении числа лиц, пострадавших от присасывания клещей в 2022 г., по сравнению с 2021 г. (соответственно 12216 и 13214) произошло увеличение числа случаев КВЭ (со 124 до 250) и ИКБ (со 115 до 224), а также доли лиц, у которых после присасывания клещей выявлены клинические формы инфекций. Из трех возможных объяснений наблюдаемой картины в качестве наиболее вероятной рассматривается снижение иммунного статуса красноярцев, переболевших до контакта с клещами COVID‑19. Статистическим методом обосновано, что среди людей, заболевших КВЭ и ИКБ , доля лиц, перенесших COVID‑19, значимо выше ожидаемой исходя из фактической заболеваемости населения Красноярского края новой коронавирусной инфекцией. Таким образом, COVID‑19 влияет на заболеваемость людей трансмиссивными инфекциями опосредованно, через изменение числа контактов людей с природными стациями, и напрямую, изменяя иммунный статус.
В статье представлена разработанная комплексная система молекулярно-генетической идентификации штаммов Yersinia pestis в соответствии с их принадлежностью к подвидам, биоварам и филогеографическим популяциям, с помощью методов ПЦР в режиме реального времени (ПЦР -РВ ), аллель-специфической ПЦР -РВ и мультиплексных ПЦР с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов на твердой подложке. С использованием этой системы возможно установление принадлежности штаммов Y. pestis к следующим филогенетическим ветвям: 0.ANT1, 0.ANT2, 0.ANT3, 0.ANT5, 3.ANT, 4.ANT античного биовара основного подвида; 2.MED0, 2.MED1, 2.MED2, 2.MED3, 2.MED4 средневекового биовара основного подвида; 1.IN1, 1.IN2, 1.IN3 биовара intermedium основного подвида; 1.ORI1, 1.ORI2, 1.ORI3 восточного биовара основного подвида; 0.PE3 (ангольский подвид), 0.PE7 (тибетский подвид) и 0.PE10 (цинхайский подвид). Первый этап исследований в рамках разработанной системы – индикация возбудителя чумы с использованием зарегистрированных диагностических препаратов. Второй этап – установление принадлежности к отдельным подвидам методом ПЦР -РВ или методом системы мультиплексных ПЦР с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов на твердой подложке, позволяющей также определять принадлежность штаммов к биоварам основного подвида и основным филогенетическим линиям античного биовара. Третий этап – определение принадлежности штаммов к филогенетическим ветвям методом АС -ПЦР -РВ . Разработанная комплексная система молекулярно-генетической идентификации штаммов Y. pestis может быть применена на региональном и федеральном уровнях системы лабораторной диагностики инфекционных болезней Российской Федерации. Ее использование значительно облегчит и повысит оперативность проведения внутривидовой дифференциации штаммов Y. pestis в рамках эпидемиологического расследования вспышек или заносов штаммов возбудителя чумы на территорию Российской Федерации или при паспортизации штаммов в коллекционной деятельности.
Цель – разработка способа внутривидовой дифференциации туляремийного микроба: подвиды tularensis (субпопуляции AI и AII), holarctica (биовары japonica, EryS/R), mediasiatica и novicida – с помощью мультилокусной ПЦР с учетом результатов в режиме реального времени. Материалы и методы. В работе использовали 48 штаммов Francisella tularensis различных подвидов, биоваров и субпопуляций. Внутривидовую принадлежность штаммов устанавливали на основании анализа вариабельности области дифференциации RD-1 методом ПЦР , гена sdhA – методом фрагментного секвенирования по Сэнгеру, диско-диффузионным методом с использованием дисков с эритромицином. Подбор праймеров и зондов проводили с помощью программного обеспечения на сайте www.genscript.com и программы GeneRunner 6.5.52. Оценку гомологии последовательностей – по алгоритму BLAST, используя базу данных GenBank NCBI. Результаты и обсуждение. Получены новые данные по структуре и встречаемости областей дифференциации RD-8, RD-12, RD-28, гена FTT1122с и гомологичных ему последовательностей у штаммов туляремийного микроба различной подвидовой принадлежности. Выявлена новая RDhm размером 346 п.н., характерная для штаммов subsp. mediasiatica, holarctica, которая делетирована у subsp. tularensis и отсутствует у subsp. novicida. На основе выявления локусов FTT1670, FTT1122с, FTT1067, FTW_2084 разработана мультилокусная ПЦР с учетом результатов в режиме реального времени «F. tularensis 4c», обеспечивающая определение всех подвидов туляремийного микроба, отдельно биовара japonica голарктического подвида и субпопуляций АI, AII подвида tularensis. Подтверждена ее специфичность при исследовании штаммов туляремийного микроба из фонда Государственной коллекции патогенных бактерий ФКУН Российский противочумный институт «Микроб». Полученные результаты расширяют представление о внутривидовой генетической неоднородности туляремийного микроба и возможности идентификации возбудителя туляремии с помощью молекулярно-генетических методов. Они также важны для понимания процессов приспособления возбудителя к циркуляции в макроорганизме и объектах окружающей среды, направлений эволюции и образования новых видов франциселл.
Возбудитель Ку-лихорадки – внутриклеточный патоген Coxiella burnetii – распространен практически по всему миру; в его циркуляции участвует множество видов кровососущих клещей, опасных для животных и человека. С помощью молекулярно-генетических методов обнаружены близкородственные виды микроорганизмов рода Coxiella sp., ряд которых является эндосимбионтами клещей, а некоторые могут выживать в организме человека, вызывая инфекционный процесс. Существование видов, гены которых по нуклеотидной последовательности сходны с генами C. burnetii, затрудняет генодиагностику патогена у членистоногих переносчиков. Цель данной работы – изучение возможности применения ПЦР для молекулярной диагностики и секвенирования протяженного фрагмента гена 16S рРНК для дифференциации C. burnetii от Coxiella-подобных микроорганизмов. Материалы и методы. Индивидуальные пробы кровососущих клещей исследовали для обнаружения бактерий рода Coxiella sp. с помощью стандартной ПЦР. Для положительных образцов получали протяженные фрагменты гена 16S рРНК и исследовали его с помощью секвенирования и множественного выравнивания с гомологичными последовательностями. Результаты и обсуждение. Из 96 исследованных клещей, собранных на территории Ульяновской области, один был положителен на присутствие ДНК C. burnetii и один – на присутствие ДНК Coxiella sp. Для изолята C. burnetii наибольшее сходство выявлено с западноевропейскими штаммами, для Coxiella-подобного микроорганизма – с близкородственными бактериями из клещей того же вида. Отмечены уникальные полиморфизмы для обнаруженных микроорганизмов. Установлено, что родоспецифичные праймеры к фрагменту гена 16S рРНК способны амплифицировать не только бактерии рода Coxiella sp., но и генетически дистанцированные виды. Анализ последовательности протяженного фрагмента гена 16S рРНК позволяет дифференцировать C. burnetii от Coxiella-подобных микроорганизмов; некоторые полиморфизмы гена, по-видимому, возникли в процессе микроэволюции в различных географических регионах. В европейской части Российской Федерации Coxiella-подобные бактерии обнаружены впервые.
Важным аспектом в обеспечении эпидемиологического благополучия по особо опасным инфекционным болезням на территории природных очагов чумы и потенциально очаговых территорий, находящихся в границах Российской Федерации и Республики Казахстан, является объединение усилий стран при осуществлении эпидемиологического надзора и контроля за чумой и другими опасными природно-очаговыми инфекционными болезнями. Цель работы – проведение совместного эпизоотологического обследования трансграничных территорий Волго-Уральского песчаного природного очага чумы и потенциально очаговой по чуме территории Восточно-Казахстанской области Республики Казахстан за период 2019–2022 гг. Материалы и методы. Исследованы образцы полевого материала, полученные в ходе эпизоотологического обследования территорий Республики Казахстан в 2019–2022 гг., с применением бактериологического, молекулярно-генетического и иммуно-серологических методов. Результаты и обсуждение. Получены современные данные о пространственно-биоценотической структуре трансграничных территорий Восточного и Западного Казахстана, циркуляции на этих территориях возбудителей опасных природно-очаговых инфекционных болезней. Установлено, что на территории трансграничных очагов Республики Казахстан существуют условия, способствующие возможности возникновения заболеваний людей чумой и другими опасными инфекционными болезнями при обострении эпизоотической обстановки в очагах или заносе возбудителей на их территорию.
Цель исследования – разработка перорального способа вакцинации против сибирской язвы, так как для проведения широких прививочных кампаний с помощью этого метода не требуется специальных условий, оборудования и аппаратуры. Достаточно минимального количества медицинского персонала для обеспечения контроля за приемом препарата. Материалы и методы. В работе использовали отечественные сырье, материалы и реактивы, прошедшие входной контроль и отвечающие требованиям ГОСТов, ОСТов, ТУ и статей Государственной фармакопеи РФ. Испытанию подверглись серии сибиреязвенной вакцины на основе Bacillus anthracis штамма СТИ -1, приготовленные в НИЦ (г. Киров) ФГБУ 48 ЦНИИ Минобороны России. Результаты и обсуждение. Отработаны на животных схемы иммунизации исходя из особенностей антигена. Одним из решающих условий, определяющих эффективность пероральной вакцинации, является правильный выбор вида и формы препарата пероральной сибиреязвенной вакцины, вводимой энтерально. Показано, что в энтеральных вакцинах, в отличие от оральных, вакцинный штамм должен быть защищен от губительного действия желудочного содержимого. В исследовании использованы кишечнорастворимые капсулы, покрытые оболочкой, устойчивой к действию желудочного сока. Изложенные экспериментальные данные свидетельствуют о том, что однократное введение капсул с пероральной сибиреязвенной вакциной СТИ защищает не менее 70 % лабораторных животных от высоковирулентного штамма сибиреязвенного микроба, и подтверждают безвредность и ареактогенность вакцины. Разработанная лабораторная технология позволяет получать готовый препарат, содержащий одну прививочную дозу пероральной вакцины для лабораторных животных. Таким образом, разработан новый способ вакцинации, необходимо проведение доклинических и клинических исследований и скорейшее внедрение в медицинскую практику перорального способа введения сибиреязвенной вакцины как наиболее простого для массовой вакцинации людей.
ПАМЯТИ КОЛЛЕГИ 
ПРАВИЛА ДЛЯ АВТОРОВ 
ISSN 2658-719X (Online)